• Santé - Forme, Acide, Basique

Caractère acide ou basique des acides aminés

je ne comprends pas pourquoi on appelle acide un acide aminé avec un pHi faible et basique un acide aminé avec un pHi élevé, pour moi si le pHi est faible l'acide aminé sera majoritairement sous forme basique.  [...] Le pHi ne concerne pas une fonction en particulier (il est donc impropre de parler de caractère acide ou basique sur la base du pHi). Elle concerne avant tout l'acide aminé sous forme libre car sous forme de résidu, une seule charge est éventuellement porté par l'acide en aminé, et la notion de pKa suffit à décrire cet état (en revanche le pHi peut être utilisé pour parler de la protéine dans son ensemble).  [...]

[Biochimie] coefficient d'extinction molaire

La phénolphtaléine est utilisé comme indicateur de PH. Sa forme acide est incolore et donc n'absorbe pas dans le visible alors que sa forme basique (entre PH 8,2 et 10) devient rose (absorption dans le visible, et donc coefficient d'extinction molaire je crois que c'est pour une longueur d'onde vers 530 nm mais je suis pas sur).  [...] Donc, comme l'a dit Benjy star, il faut considérer la longueur d'onde (en général, on prend les longueurs d'onde pour lesquelles on a une absorption maximale) mais pour ta molécule, il faudra distinguer la forme acide de la forme basique. Mais bon, je n'ai pas trouvé ta réponse.  [...]

[Biochimie] ADN: pKa du groupement phosphate, acidité etc.

Deuxième question.On dit dans mon cours de bioch que le phosphate impliqué dans un acide nucléique a deux pKa. un à 2 et un à 7 (un pour chaque fonction acide), puisque le pH physiologique est égal à 7 (J'arrondis les pH comme mon prof le fait dans mon cours), le premier groupe OH va s'ioniser en laissant partir son H+ et donc devenir une base conjuguée, le deuxième OH a un pKa= au pH, dans ce cas il devrait y avoir autant de forme basique qu'acide.  [...] . Je n'arrive pas à comprendre ce dernier point, quand je faisais des titrages en chimie je comprenais cette notion car on ajoutait de la base à un acide pour arriver à pH=pKa, mais dans le cas de l'ADN on n'ajoute rien.. Ca veut dire que l'OH oscille entre sa forme basique et sa forme acide Et quand est-il du 3e OH.  [...]

[Biochimie] Catécholamines

Tout dépend du pH. Une catecholamine comme la dopamine sera hydrosoluble a pH acide (sous forme d'ammonium) et basique (sous forme de phenolate). Elle sera plutôt liposoluble sous forme neutre.  [...] NB. La chaine latérale de la tyrosine est hydrophobe. Cela ne veut pas dire pour autant que c'est un acide aminé qui n'est pas soluble dans l'eau. La plupart des acides aminés sont insolubles dans les solvants organiques apolaires.  [...]

Solubilité acides gras

Non, pas forcément. Les acides gras sont d'autant moins solubles qu'ils sont saturés et longs. Exemple, l'acide palmitique ou le palmitate de sodium (C16) est pratiquement insoluble. L'oléate (C18.1) l'est un peu plus, le linoléate (C18.2) encore un peu plus et le butyrate (C4) plutot soluble (miscible en fait puisqu'il est liquide).  [...] Mais les sels sont toujours solubles dans l eau et si l acide carbocylique est sous sa forme basique il devient un sel soluble sous forme de micelles.  [...]

[Biochimie] point isoelectrique et PKA

je suis en 1er année de medecine, pourriez-vous, s'il vous-plait, m'expliquer la différence entre le point isoelectrique d'une proteine et le PKA, car je ne vois pas de différence. Est-ce que la différence est qu'on parle de PI pour une proteine, alors qu'on parle de PKA pour un acide aminé.  [...] C'est très différent. Le pka est la constante de dissociation d'un acide dans une réaction acido basique. Le pka s'applique à une fonction acide particulière, par exemple le pka de l'acide aspartique est de 2, ce qui veut dire qu'à pH. 2 il sera sous forme COOH et à pH. 2 il sera sous forme COO-.  [...]

acide aminé ionisé en milieu à pHi

je voudrais poser une question, en fait si on mettait un acide aminé dans un milieu dont le pH est son pHi, comment serait sa forme ionique, surtout lorsque l'acide aminé est acide, ou bien basique (Est-ce que ses racines seront ionisées aussi, en sachant qu'il ne deviendrait plus électriquement neutre).  [...] oui je sais qu'il sera amphotère, mais si l'on prenait l'exemple de l'acide aspartique, qui a deux parties carboxylique, Est-ce qu'il perdraient tous les deux leur protons H+, alors que la partie aminée unique recevrait un proton seulement.  [...]

[Biologie végétale] activité antibactérienne

quand il y a une certaine bacterie et a l'aide d'enzyme UREASE on donne le CO2 ET LE NH3, ce dernier et dans le mileu basique forme la struvite (tres petite piere) apres la croissance de bacterie precise qui trouve le mileu basique favorable pour leur croissance et pour battre ce phenomene en boit le jus de fruit qui est acide ( comme l'orange, citron ) et qui rend le mileu acide.  [...] Ton étude porte donc sur l'effet anti-bactérien de jus de fruits sur la croissance de bactéries pathogènes. Tu devrais chercher déjà quelles sont les bactéries concernées ( bactéries infections urinaires dans un moteur de recherche) et te renseigner les notions d'antibiotiques, d'infection, de pathogénicité, sur la composition de jus de fruits, et consulter quelques pages de livres sur les techniques d'études de résistances des bactéries.   [...]

[Biologie Moléculaire] bleu de Laemmli... jaune

Regarde le wikipedia sur le bleu de bromophenol, il est jaune sous forme acide et vert sous forme basique. Si ton tampon n'est pas au bon pH, cela peut avoir des conséquences sur les protéines.  [...] Le tampon n'est pas au bon pH ou le processus d'extraction rend des protéines à un pH acide. Ça m'était arrivé quand j'en purifiais. Le bleu redevient bleu dans le gel parce que lui peut tamponner le faible volume de dépôt. Au pire vous ajoutez une goutte de tris 1M pH 9.  [...]

[Génétique] L'acidité de l'ADN

Je voulais juste dire qu'au pH cellulaire (autour de 7 pour la majorité des cellules animales...) l'ADN est sous forme basique et est donc chargée négativement. C'est une propriété très utilisée en laboratoire. D'après les régles de la chimie, le pKa caractéristique d'un couple acido-basique détermine si la molécule est sous forme acide ou basique en fonction du pH.  [...] Lorsque le pH est supérieur au pKa, les molécules sont globalement déprotonées ou sous forme basique si tu préfères (après c'est une histoire de proportions...).  [...]