• Santé - Fixation, Protéine, ADN

Gel Shift : problème avec la compétition

Ca ressemble a une fixation non specifique de ta proteine sur l'ADN. As tu fais un temoin de binding de ta proteine sur une sequence d'ADN non specifique (different de la competition).  [...] D'autres études ont montré que ma prot liait une séquence d'ADN X et que cette fixation était spécifique. J'ai reproduit ses manip avec ma séquence d'ADN Y pour savoir si il y avait également fixation. J'ai obtenu un retard sur gel similaire mais pour des quantités un peu supérieures de protéine.  [...]

[Génétique] Retard sur gel

En gros les retards sur gel sont assez chiant a interpreter, c'est pour ca que tu dois faire une piste d'ADN sans proteine, et differentes concentration de ta proteine. Sinon tu ne peux pas conclure grand chose.  [...] en fait ici j'ai 2 sites de fixation sur l'adn c'est cela la méme protéine peux donc se fixer sur 2 sites différent sur l'adn ( à méme ou différente affinité bien sur).  [...]

[Biologie Cellulaire] Fixation d'une protéine à l'ADN

Je dois montrer comment une protéine qui se lie à l'ADN va réaliser des contacts spécifiques de séquences avec une molécule de l'ADN à double brin sans rompre les liaisons H.  [...] Je voudrais être sûre d'avoir compris la question. je pensais répondre qu'il pouvait y avoir liaison avec l'ADN si la protéine possède un domaine basique chargé + afin de se lier à l'ADN chargé -.  [...]

[Biologie Cellulaire] question sur les séquences consensus

Par exemple. les sites de fixation d'une protéine. Si il est établie qu'une protéine peut se fixer sur plusieurs séquences d'ADN différentes mais proches, il est possible d'écrire une séquence type. Ainsi, si l'on veut savoir si nos séquences d'intérêt possède le site de fixation pour cette protéine, c'est une séquence consensus que l'on cherche.  [...] Xylem, la séquence dite Shine-Dalgarno est un motif ARN reconnu par l'ARN16s du ribosome chez les procaryotes. Elle participe donc à l'initiation de la TRADUCTION pour de nombreux gènes bactériens.   [...]

Fonction "DNA binding"

L'homéodomaine correspond à une partie d'une protéine qui se fixe à l'ADN. Ainsi, l'homéobox d'un gène correspondra à ce domaine de fixation à l'ADN.  [...] D'accord, merci Mais du coup, il existe un homéodomaine pour toutes les protéines ou seulement pour celles qui agissent sur l'ADN.  [...]

L'influence de l'environnement sur le phénotype : besoin de conseils de méthode !

- Si le milieu est uniquement constitué de glucose, alors la bactérie consomme cette substance et la transcription du gène lacZ correspondant à la protéine impliquées dans le métabolisme du lactose est très faible.  [...] La liaison qui lie la protéine CAP avec l'ADN entraîne une déformation de la molécule d'ADN ( on observe une courbure de 80° ). Cette dernière favorise la fixation de l'ADN polymérase et donc la transcription du gène lac. Cette transcription va entrainer cette même action sur les gènes lacY et lacA de la protéine.  [...]

[Biologie Moléculaire] Technique SELEX aidez moi!

Comme nous avons généré un grand nombre de fragments d'ADN aléatoire, si notre protéine a une affinité pour l'ADN, elle trouvera son site de fixation. On rince et on élue.  [...] Ce que l'on élue est donc les fragments d'ADN qui étaient restés fixés sur la protéine. Afin d'éliminer les séquences aspécifique on va procéder par plusieurs réitération du processus. (PCR, fixation, élution). Ceci va avoir pour conséquence que les fragments ayant la plus forte affinité pour la protéine se fixeront les mieux.  [...]

homéodomaine et protéine

En simplifiant bcp, L'homéodomaine est une partie de la protéine qui va reconnaitre une séquence spécifique de l'ADN en amont d'un gène. Cette fixation va permettre la fixation du complexe d'initiation de la transcription et de l'ARN polymerase et le gène cible va être transcrit, puis maturé et traduit.  [...] Les homéodomaines sont des séquences très bien conservées au cours de l'évolution des différents êtres vivants et les protéines à homéodomaine jouent des rôles importants de régulation de l'activité génique en se fixant sur l'adn. C'est bien ça.  [...]

[Divers] [biologie du developpement] développement des membres

L'archétype des protéines à domaine T-Box est la protéine Brachyury. Le rôle de ce gène dans le développement embryonnaire a été décrit dés 1927 grâce à l'analyse de mutants spontanés (Dobrovolskaïa-Zavadskaïa (ouf..) C.R.Soc.Biol 1927 Vol 97. 114-116). Les mutants à l'état homozygote présentaient un arrêt de la formation de la ligne primitive, structure anatomique observable durant le développement précoce et marquant la formation de mésoderme embryonnaire.  [...] Le mode de fixation est original en plusieurs aspects. Le premier est qu'il intéresse le grand et le petit sillon de l'ADN. Mais la grosse originalité est qu'une hélice de cette protéine s'enfonce dans le petit sillon qu'elle élargit sans pour autant dénaturer l'ADN.  [...]

l'Homme, un programme ?

Tout organisme pluricellulaire viable repose sur la communication intercellulaire, qu'elle soit proche ou eloigne, par differrents messagers. chimique, electrique... Or toute communication est une reponse stimulee par differents effecteurs intra ou extra cellulaires, mais cette reponse est regulée ou 'programmée' par l'adn exprimé par la cellule.  [...] fixation sur la proteine 'regresseur' qui annule son affinité pour la sequence 'operateur' et permet ainsi la transcription de l'operon. L'adn regule sa propre expression, mais le resultat est le meme (le metabolisme de la cellule est regulé par l'adn, qui se regule lui-meme en fonction d'un facteur externe).  [...]