• Santé - Facteur, Séquence, ADN

enzymes de restriction

La séquence d'ADN est le principal facteur qui détermine la spécificité d'une enzyme de restriction à couper l'ADN bicaténaire à un endroit précis.  [...] On parle alors d'activité star qui altère la fidélité de l'enzyme. Les conditions expérimentales de rapport enzyme.substrat, volume de digestion, temps de digestion, force ionique et pH des tampons de digestion, présence ± concentrée de glycérol ont toutes un fort impact sur la fidélité de l'enzyme à couper la séquence d'ADN à l'endroit désiré et pas n'importe où ailleurs.  [...]

[Biochimie] Synthese protéique

Ce sont les facteurs de croissance, liposolubles ou hydrosolubles, qui vont venir, soit traverser la membrane plasmique de la cellule par lipodiffusion, et trouver un récepteur cytosolique qui va lui ( facteur de transcription), entrer dans le noyau grâce à un NLS ( signal de reconnaissance) et venir transcrire la séquence spécifique d'ADN.  [...] soit donc aussi par transduction, le facteur de croissance, vient rencontrer un récepteur membranaire, et par effet TRANS, par des cascades de réactions cela va entrainer, la phosphorylations de protéines G cytosoliques puis la phosphorylations de kinases qui vont elles phosphoryler des facteurs de transcriptions qui vont donc eux aussi transcrire une séquence d'ADN.  [...]

[Biologie Moléculaire] ADN et facteurs de transcription

1- L'union entre les facteurs de transcription et une séquence consensus (generalement un promoteur) d'ADN est une union reversible, faible (la somme des 20 liaisons faibles entre les aminoacides d'un facteur de transcription et les nucléotides d'un ADN rend l'interaction forte) et spécifique.  [...] 2- L'union des FT sur l'ADN se fait sur des régions non méthylées (puisque la méthylation est responsable de la condensation de la chromatine, donc éviter la transcription) et acétylées (les histones acetyltransferases acétylent les histones de l'ADN, cad la décondense pour que les FT puissent s'y unir).  [...]

[Biologie Moléculaire] Liaison spécifique d'un protéine à l'ADN

Je me posais une simple question. Comment une protéine (facteur de transcription en général) peut-elle se fixer spécifiquement à une séquence d'ADN.  [...] C'est dans cette lumière qu'il faut considérer l'exemple de la TBP de TFIID, autrement dit la sous-unité du facteur de transcription TFIID qui se fixe à la TATA-box... Mais il n'y a pas de complexe nucléoprotéique contenant une partie protéique assurant disons l'activation de la transcription et une autre composée d'acides nucléotidiques qui assure la reconnaissance avec l'ADN par complémentarité de séquences.  [...]

Comment un gène s'exprime dans une cellule ?

Chaque gène est précédé d'une ou plusieurs séquences promotrices. Ce sont des régions sur lesquelles vont venir se fixer des facteurs de transcription, qui vont soit stimuler soit inhiber l'expression du gène en amont. Un facteur de transcription stimulateur va permettre la liaison de l'ARN polymérase qui crééra la séquence ARNm complémentaire de la séquence d'ADN du gène.  [...] ce n'est pas toute a fait exacte un gène est constituer d'une suite d'introns (séquence non codante) et d'exons (séquence codante) prenons un Gene A I=introns et E= exons.  [...]

[Biologie Moléculaire] Gel de retard

Quant à la nature exacte des interactions, on ne peut pas les connaître avec les expériences de retard.   [...] Il peut s'agir d'un des nombreux types d'interactions entre facteur de transcription et l'ADN (helice boucle hélice, zinc finger, glycine zip,...), de la reconnaissance par un acide nucléique complémentaire de la séquence qui ferait part d'un complexe, etc.  [...]

Gènes ribosomaux et séquences en tendem

-Est-ce que la séquence d'ADN (qui donnera par transcription l'ARN 45S) est en fait copiée en plusieurs exemplaires, sur plusieurs chromosomes(Je pense que oui, mais je veux juste confirmation...).  [...] La presence dans la cellule de cet ARN depent de beaucoup de facteur, et la forte presence de sequence repété de l'ADN codant pour cet ARN est juste un de ces facteurs.  [...]

Promoteur

Bof bof, c'est sur les deux brins. Un facteur de transcription reconnait une conformation de séquence d'ADN double brin, qu'on la mette dans un sens ou dans l'autre, la conformation reste la même... (voir les enhancers par exemple).  [...] Pareil que LXR, quand on parle de séquences régulatrices, c'est-à-dire que leur fonction implique des intéractions protéine-ADN, il faut considérer que la structure importante est l'ADN double-brin.  [...]

[Biologie Moléculaire] Principe de la LM-PCR

La LM-PCR est utilisé pour la technique de ChIP on Chip qui a été developpé afin de rechercher les sequences nucléotidiques associées a une protéines d'interet (Facteur de transcription) sur tout le génome. Elle permet d'amplifier les sequences d'ADN intergéniques coimmunoprécipité lors de la ChIP de séquence inconnue.  [...] Globalement, ca permet de faire une PCR quand tu ne connais pas ta sequence, puisque tu as fixe un adaptateur lors de la premiere etape. Les applications sont donc multiples.  [...]

[Génétique] enhancers

Un élément de réponse est une séquence d'ADN de quelques paires de bases sur laquelle se fixe un facteur de transcription. Cette séquence correspond donc à quelque chose de précisément défini. Il se cache sous ces terme la notion d'interaction chimique entre l'ADN et une protéine.  [...] Le terme complémentarité s'applique aux interactions entre les bases. Maintenant vous avez bien saisi l'idée. La séquence nucléotidique définie une structure chimique caractéristique reconnue par le facteur de transcription.  [...]