• Santé - Expression, Protéines, Conditions

[Biologie Moléculaire] Approche proteomique

je ne suis pas sûre de comprendre l'objet de ta question. Une approche de protéomique sert à visualiser l'ensemble du protéome, pour cela on sépare effectivement l'ensemble des protéines par éléctrophorèse bidimensionnelle afin d'identifier des spots correspondant normalement chacun à une protéine.  [...] On compare un lysat contrôle au(x) lysat(s) que l'on étudie et on cherche à identifier les spots qui bougent de façon significative. Les protéines correspondante sont alors identifiées par spectrométrie de masse. Cela sert à identifier une expression différentielle de protéines sous les conditions que l'on étudie (traitement des cellules, RNAi.  [...]

[Génétique] Western blot

en fait il est très souvent difficile de réaliser exactement le même dépôt, d'où ces variations. De plus, suivant la méthode utilisée pour doser la concentration en protéine on est +/- précis. C'est pourquoi normalement pour toute quantification on utilise un rapporteur interne qui normalement ne varie pas dans les conditions testées (souvent l'actine ou la tubuline) et on rapporte le signal obtenu pour notre échantillon au signal obtenu pour le rapporteur (une division quoi ^^).  [...] Le dosage protéique a été effectué correctement. Je dois soumettre mes échantillons a différentes conditions (avec et sans inhibiteur) pour voir l'abondance d'expression des mes protéines selon la condition adéquate, donc il est impératif que la tubuline soit intacte pour tout mes puits pour que je puisse quantifier.  [...]

La génomique et la viande bovine | Dossier

La génétique et les conditions d'élevage déterminent ensemble et en interaction les caractéristiques des animaux de ferme, parmi lesquels les bovins. La génomique autorise une vision globale et exhaustive des caractéristiques des gènes (génomique structurale) et de leur expression sous forme de transcrits (ou ARNm pour ARN messager) et de protéines (génomique expressionnelle).  [...] - l'identification de profils d'expression de gènes caractéristiques des différents muscles et des conduites d'élevage ( vitesse de croissance, mode de conduite, niveau et type d'alimentation, conduite au pâturage).  [...]

[Biotechnologie] Culture bactérienne et protéines recombinantes en plaque 96 puits

Je réalise déjà des tests d'expression de protéines recombinantes (sreening des meilleures conditions) mais en format tube...et ça prends beaucoup de place pour gérer la quantité d'échantillons. Habituellement, je réalise une étape de centrifugation à 15000g 30min 4°C en tubes, après la lyse bactérienne via un tampon de lyse commercial, pour séparer les fractions solubles/insolubles et analyser dans quelles fractions se trouvent la protéine produite (par SDS PAGE/WB/ELISA).  [...] Mon problème est le suivant, si je fais des test d'expression en format plaque 96 puits, comment séparer la fraction soluble et insoluble après la lyse bactérienne...car je ne possède pas de centri/rotor permettant de faire tourne une plaque 96 puits à une telle vitesse (15000g).  [...]

[Biologie Moléculaire] Taux d'expression de gènes et fonction des protéines...

Suite à une expérience incluant un traitement A et un traitement B sur des animaux, je travaille sur l'expression de gènes qui codent pour des protéines dont la fonction est connue. Je trouve des différences significatives entre les taux d'expression de gènes des individus ayant subi le traitement A et ceux ayant subi le traitement B.  [...] Ces taux d'expression sont bien plus importants dans une condition que dans l'autre. Or, quand je mesure ce que devrait avoir produit les protéines qui m'intéressent (=synthèse d'une coquille), je ne trouve aucune différence de croissance de la coquille entre les deux traitements.  [...]

[biochimie] agrégation protéine à 320nm

Concernant la reversibilité de l'aggrégation, tout dépend des conditions d'expression, d'observation et de la bonne volonté de la protéine.  [...] Certaines protéines ont la faculté de se renaturer, mais l'optimisation des conditions de renaturation peut être fastidieux.  [...]

[Biologie Moléculaire] Comment analyser les résultats de PCR quantitative???

Dans le cas de l'évaluation de l'expression de gènes dans différentes conditions, le relatif reste le mieux pour moi. L'absolu interviendrait surtout pour universaliser les données produites.  [...] Dans mon cas, pour ce type d'expression, il n'y a pas un seul gène qui ait une courbe de fusion correcte, cela ressemble à du bruit de fond. Cela m'embête énormément car ces gènes sont super bien modulés dans les conditions voulues par rapport au contrôle, ils sont assez nombreux, et les modulations sont reproductibles.  [...]

[Microbiologie] Adaptation et résistance des bactéries au stress

+ Chez certaines espèces bactériennes, il y a formation des spores (endospores) au sein de cytoplasme.les spores sont très résistant et leur longévité est importante et elles donnent naissance à une une bactérie active lorsque les conditions devient favorables.  [...] Mais si on me force a trouver une différence entre les deux, alors a mon avis, dire qu'une bactérie résiste á des températures élevées par exemple, cela veut dire qu'elle posséde naturellement la capacité de survivre dans ces conditions. Et dire qu'une bactérie s'adapte á une température veut dire qu'elle modifie une voie de régulation protéique lui permettant de survivre dans ces conditions, par exemple activer l'expression des génes de sporulation, renforcement de la paroi cellulaire...etc.  [...]

Une classe d'antibiotiques particulière : les aminoglycosides | Dossier

Cependant il a été démontré indépendamment par deux équipes Américaines que l'efficacité de suppression de ces antibiotiques était fortement dépendante du codon stop et de son contexte nucléotidique (principalement le nucléotide suivant immédiatement le codon stop) (13, 14).   [...] Dans les conditions normales d'expression des gènes le ribosome rencontre le codon stop à la fin de la séquence codante. Seulement ce n'est malheureusement pas toujours le cas et il arrive que la synthèse protéique s'arrête prématurément en raison de l'apparition d'un codon stop.  [...]

Les voyages spatiaux accélèrent le vieillissement cellulaire

Cette étude a été menée sur des cellules endothéliales, celles tapissant la face interne des vaisseaux sanguins, cultivées sur Terre ou dans l' ISS. Après 10 jours dans ces conditions, les scientifiques ont examiné les différences dans la modulation des gènes et leur expression à travers les profils protéiques constatés.  [...] The challenging environment on board the International Space Station affects endothelial cell function by triggering oxidative stress through thioredoxin interacting protein overexpression. the ESA-SPHINX experiment.  [...]