• Santé - Expression, Niveau, ARNm

[Biologie Moléculaire] régulation de l'expression du gène

Mais dans la plupart des cas, l'expression d'un gène est controlée au niveau de la transcrpition, c'est-à-dire lors de la synthèse de l'ARNm par l'ARN polymérase II.  [...] que l'expression génique est une succession d'étapes finement contrôlées à différents niveaux en effet, bien que toutes les cellules d'un organisme contiennent le même génome,  [...]

[Génétique] Stochasticité dans l'expression des gènes

Je cherche ici à montrer que la cellule in vivo utilise des systèmes qui visent à contourner l'expression aléatoire des gènes. opérons, ordre des gènes dans le génome, compétition entre les ARNm au niveau de la traduction etc. Et qu'on peut mettre à profit ces découvertes in vivo pour les appliquer dans la construction de systèmes d'expression artificiels in vitro (afin de réduire le bruit de fond qui diminue le rendement).  [...] Toutes ces modifications ne sont pas là par hasard puisque les enzymes brièvement citées sont elles même très finement régulées par les facteurs de transcription en ce qui concerne leur recrutement au niveau de gènes précis, mais aussi par leur propre expression et leurs modifications post-traductionnelles (phosphorylation, ubiquitinylation,  [...]

[Biologie Cellulaire] Les relation interne de la cellule

Sed a raison.. à ton niveau, c'est largement trop compliqué. Essaye de t'interesser d'un autre point de vue à l'autopoïèse. La synthèse de protéines est beaucoup plus compliquée qu'il n'y paraît. pour te donner une idée (et encore je simplifie à fond là).  [...] on a l'expression d'un gène plus ou moins régulée, transcription, maturation (dans le cas des ARNm et S et certains autres), sortie du noyau, synthèse aux niveau des ribosomes, passages dans le REG (glycosylation et autre), puis dans le golgi pour être envoyé là ou elle doit allé la protéine.  [...]

Différence RT_PCR semi-quantitative et Q-PCR

oui, je crois que son niveau d'expression change lors du cycle cellulaire, mais statistiquement sur le total de mes cellules il doit rester stable.  [...] 2 eme probleme avec 16S, si tu etudies l'expression de ton gene en differente condition de croissance, il y a fort a parier que la vitesse de croissance soit differente, ce qui fais que ton niveau de reponse style ppGpp dans la cellule est different, et donc [l'ARNr 16S] est differente entre tes echantillons.  [...]

[Biologie Cellulaire] Apoptose et le gène Bax

Ce n'est pas forcément parce que l'ARNm est transcrit qu'il est traduit, il existe des mécanismes de régulation à ce niveau aussi, suivant la nécessité du mécanisme.  [...] Pour définir s'il y a apoptose ou pas, regarder l'expression de Bax est déjà trop spécifique. En plus, on regarde très rarement son expression au niveau de l'ARNm mais au niveau protéique.  [...]

Différence puce a adn et RTqPCR

Bonjour à tous, je me permets de vous solliciter car je ne comprends pas bien la différence entre puce a ADN et RTqPCR. Je viens de lire un article où les chercheurs réalisés dans un premier temps des puces a ADN puis faisait de la RTqPCR.   [...] la RTqPCR ne te donne que l'indication de difference de transcription d'un ARNm en particulier dans differents tissus ou differentes conditions, la DNA chip te permet de connaitre le transcriptome complet de la cellule et le niveau d'expression, autant dire que tu as beaucoup plus d'information avec des puces qu'avec une RTqPCR.  [...]

gènes et transcription

Tout l'ADN n'est pas transcrit, seules les régions correspondant à des gènes le sont. L'expression peut être régulée selon le stade de développement, le type cellulaire, l'environnement, etc... Dès lors, un acteur doit intervenir pour déterminer à quel endroit une région d'ADN doit commencer à être transcrite. c'est le rôle du promoteur.  [...] Et puis ça serait trop simple de dire que toute la régulation de l'expression se fait au niveau de la transcription. Une partie se fait sur le taux d'export de l'ARNm du noyau, la stabilité de l'ARNm dans le cytoplasme, un peu sur la traduction, sans parler des modifications post-traductionnelles.  [...]

[Biologie Cellulaire] Banque d'ADNc

Merci de ta réponse. Un ADNc c'est un brin artificielle fait à partir d'un ARNm, il ne contient pas d'introns. Et ça sert aussi pour l'expression des génes.  [...] Au niveau de l'expression des gènes, c'est là qu'est tout l'interêt... Pose toi la question de quelle population d'ARNm reflète une banque d'ADNc.  [...]

[Biologie Moléculaire] Calibration qRT-PCR sur cellule unique

Je me demandais dans le cas où l'on réalise une qRT-PCR sur les ARNm provenant d'une cellule unique, est ce qu'on doit partir de la même quantité d'ARNm pour tous les échantillons ou comme c'est les ARNm d'une seule cellule on peut s'affranchir de ce biais puisque l'on compare les niveaux d'expression d'un gène d'une cellule à une autre ( la variabilité des quantité d'ARNm serait inter-cellules) et bien sur en utilisant un gène de ménage comme référence pour chaque échantillon. Je ne sais pas si j'ai été claire.  [...] D'un point de vue théorique, je dirais que non. On fait cela pour partir sur une base commune et éviter tout risque lié à une inhibition du à une quantité trop importante de cibles.   [...]

mesure de l'expression d'un gene

Est-ce imaginable un gène pas trop exprimé au niveau de la transcription mais avec un messager très stable et qui as une durée de vie très importante ce qui induirait donc une forte expression Ou est-ce que globalement tout les ARNm ont une durée de vie proche et donc le taux d'expression est surtout rapport aux taux de transcription.  [...] Tout dépend de la question que tu te poses. Pour le Run-On, on sort quand même du contexte physiologique. Et j'ai comme dans l'idée (peut-être fausse) que quantifier l'expression d'un gène par run-on n'est pas fiable (voire pas recommandé). Pour ma part, la PCR quantitative me parait être un bon outil pour déterminer le niveau d'expression d'un gène à un temps t.  [...]