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[Evolution] Une simulation d'écosystèmes évolutifs

[Evolution] Une simulation d'écosystèmes évolutifs.  [...] Plus d'informations sur ce projet sont disponible sur le site.   [...]

[Evolution] Suivez les comptes rendus hebdomadaires d’un très long run de notre écosystème virtuel évolutif

Nous avons créé une plateforme générique pour la simulation d'écosystèmes complexes comportant des agents prédateurs-proies intelligents qui agissent et participent a l'évolution d'un environnement dynamique. Le comportement de chaque agent est modélisé par une Carte Cognitive Floue (un modèle computationel permettant de représenter des interactions entre des concepts tels que des émotions, des perceptions ou des actions associées aux agents) individuelle, codée dans son génome et résultant de l'action du processus évolutif gouvernant la simulation.  [...] Chaque semaine, nous ajouterons une nouvelle page présentant un résumé détaillé de ce qui c'est passé dans le simulation lors des dernières 500 ou 1000 générations. Nous proposons de nombreux graphes, vidéos et figures présentant l'évolution du système comme, par exemple, le nombre d'individus, le nombre d'espèces, la quantité de nourriture disponible, l'arborescence des espèces, la distribution des âges des individus, les cartes cognitives résultats du processus évolutif, la variabilité des allèles des gènes de la population… Tout cela permettra de suivre en direct un processus évolutif et ses effets sur un écosystème virtuel complet au cours de plusieurs dizaines de milliers de générations.  [...]

Simulations en biologie

A ma connaissance on ne fait pas pour le moment de simulation du fonctionnement d'une cellule. Par contre on fait des modélisations et simulations d'écosystèmes.  [...] Si vous êtes interessés par les simulations d'ecosystèmes, ou si vous voulez m'aider, c'est mon sujet de TIPE de l'année prochaine.  [...]

Les bases de l'évolution du vivant | Dossier

Simulation réalisée avec le logiciel R. on part de dix gènes à deux allèles, chaque allèle étant à la fréquence initiale de 0,5 puis on les laisse évoluer pendant 700 générations. Certains se fixent, d'autres disparaissent. Si l'on réitérait la simulation, l'évolution de chaque gène serait différente.  [...] Les mutations se produisent de façon assez régulière (ce qui a entraîné le concept d' horloge moléculaire, énoncé par Kimura dans sa Théorie neutraliste de l'évolution ), mais totalement aléatoire, c'est à dire qu'il n'y a pas de lien de cause à effet entre le fait qu'une mutation soit favorable ou pas, et le fait qu'elle se produise.  [...]

Phasmes !!

Quelqu'un aurait-il une idée quand à la possible relation entre la parthénogénèse et la reproduction sexuée ( lien évolutif complémentarité.. ).  [...] Pour revenir au sujet. j'ai élevé des Bacculum extradentatum avec des mâles présents dans l'élevage (pour freiner la croissance de la population). Généralement j'avais toujours moins de mâles que de femelles, même en éliminant régulièrement des femelles (soit les femelles favorisent la parthénogénèse, soit les mâles sont plus fragiles, et résistaient mal aux conditions un peu.   [...]

Quand l'environnement change, l'évolution accélère

Depuis quelques années, en effet, les biologistes utilisent l' ordinateur pour créer des modèles d'évolution à toutes les échelles, celle des écosystèmes, celle des organismes et même celles des cellules et des molécules. Le résultat est toujours très théorique et bien éloigné des travaux des naturalistes (de plus en plus rares).  [...] Sur le plan théorique, cette étude fera aussi évoluer cette science toute neuve de la simulation des écosystèmes. Après tout, les astronomes en usent déjà beaucoup et avec succès pour reconstituer le passé ou l'avenir de galaxies entières, même quand elles s'entrechoquent en collisions cosmiques.  [...]

Evolution/maths/informatique

Je ne connais pas beaucoup d'exemple où une théorie sur l'évolution ait été testée à l'aide d'un logiciel informatique. C'est plutôt la théorie de l'évolution qui est appliquée à la création d'algorithmes. Cependant, voilà un exemple d'article de chercheurs qui ont cherché à voir si l'évolution tendait vers plus de complexité (question à laquelle une grande partie des biologistes répondent non) à l'aide d'une simulation utilisant des organismes virtuels.  [...] les modèles permettant de prévoir l'évolution d'une population, et d'une espèce, en fonction de l'environnement, sont les modèles de géntique des populations.  [...]

Ancêtre des poules avec des dents ?

Si on voulait vraiment appliquer ce critère à l'évolution pour comprendre l'Evolution, il faudrait faire des simulations tellement gigantesques avec des ordinateurs tellement puissants qu'il faudrait qu'ils soient capables de prendre en compte une telle multitude de facteurs qu'on prendrait plus de temps à construire des modéles qu'à les tester.  [...] Et donc on pourrait voir si dans les modèles simulés informatiquement, le changement d'un des facteurs annule ou modifie l'aspect ou le comportement de tel ou tel animal. Sauf qu'une simulation qui retracerait des centaines de millions d'années d'Evolution c'est difficile à envisager vous croyez pas.  [...]

[Biochimie] Expérience sur les processus d'apparition de la vie.

Je rappelle d'où vient la sous-partie du fil. l'idée que la notion de réplicateur évolutif seule n'est pas suffisante si le paysage (l'ensemble des solutions potentielles ) exploré est suffisamment pauvre pour que le système avec réplicateurs converge vers une stabilité (d'une forme quelconque) dans la simulation.  [...] L'idée que le système Terre n'a pas convergé (et ne semble pas prêt de le faire) explique cette insatisfaction devant toute simulation d'un système avec réplicateurs et évolution qui converge trop vite vers une situation stable.  [...]

limites d'adaptabilité des êtres vivants au phénomène de pollution.

..c'est ce qu'on a prouvé grâce à une simulation de reproduction aléatoire dans le cours de génétique des populations, lorsqu'on entre dans le logiciel que le nombre des individus initiale est faible, la disparition des allèles ainsi que la fixation se déroule d'une manière très instable, et très chaotique, lorsque le nombre des individus est grand, la diversité allélique a tendance à se fixer.  [...] et ceci pour tout les animaux, ce qui fait des allèles, la base sur laquelle agit l'évolution, après lorsque la sélection naturelle agit, elle peut éliminer certains allèles et ainsi fixer l'allèle bénéfique pour l'espèce à long terme...c'est ce qu'on a prouvé grâce à une simulation de reproduction aléatoire dans le cours de génétique des populations, lorsqu'on entre dans le logiciel que le nombre des individus initiale est faible, la disparition des allèles ainsi que la fixation se déroule d'une manière très instable, et très chaotique, lorsque le nombre des individus est grand, la diversité allélique a tendance à se fixer.  [...]