• Santé - Espèces, Séquence, ARN

[Zoologie] la systématique classique vs la systématique moderne

A priori, je dirai qu'il n'est pas possible d'utiliser un seul et unique marqueur moléculaire pour classer toutes les espèces. Parce que si vous considérez la séquence d'un gène très concervé au cours de l'évolution, par exemple une séquence d'ARN ribosomique, il va vous permettre de faire une classification phylogénétique de groupes très éloignés, les vertébrés par rapport aux arthropodes ou aux échinodermes.  [...] .. mais vous ne pourrez pas classer avec ce marqueur les différentes espèces de singes d'amérique du sud. Car comme ces espèces sont très proches la séquence de cet ARN ribosomique sera certainement la même. Inversement, vous pourrez trouver assez facilement un (voire plusieurs) marqueur(s) génétique(s) pour faire une classification précise des singes d'amérique du sud.  [...]

[Biologie Cellulaire] Ribosome eucaryote

Bonjour, je souhaiterai savoir si cette affirmation est vrai. A propos des ribosomes, ils sont identiques chez tout les eucaryotes. J'ai une correction qui dit oui et l'autre non. Après des recherches j'ai trouvé que les mitochondries ont un ribosome 70S, si elles sont bien dans une ceulle eucaryote ça réfuterait bien l'affirmation... Qu'en pensez vous Merci.   [...] Les ribosomes des différentes espèces ne sont certainement pas identiques puisqu'on se sert justement de la séquence ARN de l'unité 18S pour discriminer entre différentes espèces.  [...]

aide pour un protocole (PCR, DGGE...)

On peut donc utiliser des amorces universelles qui reconnaissent des séquences conservées d'une espèces à l'autre. Bien entendu, il existe des variations entre les différentes espèces. Ces variations concernent la tailles de l'ARN 16S, la séquence et le nombre d'opéron.  [...] La solution est double. Soit on séquence les régions 16S obtenues (ce qui est coûteux), soit on trouve une autre solution et cette solution c'est la DGGE.  [...]

Différence entre procaryotes et eucaryotes : vitesse d’allongement de la chaîne peptidique

Depuis peu, je m'intéresse à la différence de vitesse de synthèse des protéines entre les procaryotes d'une part et les eucaryotes d'autre part. En d'autres mots, quelle est la vélocité du cycle traductionnel en termes de nombre d'acides aminés incorporés dans une protéine par seconde et par ribosome.   [...] De plus il y a un biais de codon spécifique à l'espèce (si j'ose dire) qui fait qu'on ne peut pas comparer la vitesse de traduction du même ARN dans des cellules d'espèces différentes. Quand on programme une cellule pour exprimer un certain peptide, il faut d'abord éditer la séquence pour la faire coller aux préférences en termes de codons de la cellule en question.  [...]

[Biotechnologie] Comment déterminer le rendement d'une RT?

Ce qui est chiant c'est de trouver un ARN dont tu es sur qu'il n'a aucun competiteur dans ton echantillon. Certaines compagnies on speciallement cree ce genre d'ARN qui n'a d'homologue chez aucune espece sequence a ce jour. Forcement, c'est rare donc c'est cher.  [...] J'ai pas dis que c'etait parfait, il y a toujours des imprevus. Il peut tout a fait y avoir certains cas ou la RT a des rendements differents selon les cibles... d'un autre cote, tu auras aussi le probleme (et probablement encore plus marque) entre deux ARNm differents.   [...]

La modification facile du génome humain inquiète des chercheurs

En 2012, Jennifer Doudna et la Française Emmanuelle Charpentier ont adapté ce système au génie génétique. il est désormais possible de couper la séquence d'ADN de son choix en changeant l'ARN qui guide la protéine. Pour utiliser cette méthode, les scientifiques doivent fabriquer un ARN qui corresponde à la séquence d'ADN à couper.  [...] Attaché à la protéine bactérienne Cas9, l'ARN se lie à sa séquence d'ADN et Cas9 coupe l'ADN à cet endroit. La cellule essaie alors de réparer la coupure mais souvent avec des imperfections, d'où une inactivation du gène. Pour changer le gène, il suffit d'incorporer dans la cellule un morceau d'ADN similaire à celui qui a été coupé, mais contenant la bonne séquence.  [...]

[Microbiologie] ADNr 16S ou ARNr 16S ?

.) possèdent des ARNr. On va ensuite comparer les séquences de ces ARNr dans les différentes espèces, et en simplifié, plus ils se ressemblent d'une espèce à l'autre, plus les espèces sont proche d'un point de vue évolutif. Et donc plus ces séquences divergent, plus les espèces considérées sont loin évolutivement.  [...] J'avais compris que plus les séquences d'ARNr diffèrent plus les espèces sont éloignées les unes des autres. Mais si ces séquences en viennent à se différencier autant, comment sait-on qu'il s'agit d'ARNr et pas d'un autre ARN.  [...]

[Biologie Moléculaire] hybridation ADN /ARN sens / antisens

Ma question concerne l'hybridation de séquence d'ADN et d'ARN mises en solution.  [...] Idem concernant une séquence d'ARN qui serait comme la séquence 2, T étant remplacé par U, évidemment.  [...]

[Divers] Epissage

Je suis pas très bien informé dans le domaine mais je pense que à partir du moment où l'on connait la séquence nucléotidique d'un gène et la séquence en acides aminés de sa protéine,ça ne pose pas de problème. En effet à partir du moment où tu connais la séquence d'un gène tu peux en déduire la séquence de l'ARN messager immature correspondant (par complémentarité).  [...] Or, si tu connais le polypeptide correspondant à ce gène (supposons une protéine entière pour se faciliter la vie), tu remarques que si tu essayes de retrouver la séquence de l'ARN messager mature à partir de sa séquence en acides aminés, tu trouveras un ARN mature différent (plus court) que l'ARN messager immature dont on avait parlé plus haut.  [...]

L'arsenic, c'est fantastique

C'est pourtant là, dans les sédiments, en l'absence totale d' oxygène, que Ronald Oremland de l'US Geological Survey (USGS) et ses collègues ont identifié une nouvelle bactérie, baptisée SLAS-1, utilisant de l'arséniate As(V) qu'elle réduit en arsénite As(III) pour sa respiration.   [...] Par ailleurs, l'analyse de la séquence du gène codant pour l' ARN ribosomal 16 S de SLAS-1 a permis aux chercheurs de reconstituer l' arbre phylogénétique de ce procaryote qui pourrait constituer une nouvelle espèce de bactérie.  [...]