• Santé - Enzyme, Substrat, Interactions

Enzyme michaelienne/allostérique

Mettons qu'on a une une enzyme allostérique et qu'on a une concentration initiale en subtrat supérieur à son seuil. À cause de cet effet de seuil, la vitesse de réaction finira par décroître dès que la concentration en substrat restant passera en-dessous de ce seuil.  [...] Donc quand on parle de vitesse initiale de réaction, c'est évidemment quand enzyme et substrat sont homogénéisés ensemble, pour maximiser les interactions et donc la vitesse de consommation du substrat.  [...]

[Biochimie] Spécificité de substrat , spécificité d'action

Si le substrat et l'enzyme établissent des interactions suffisament importantes, et si le substrat possède la bonne conformation, alors le site actif, généralement de 2-3 acides aminés, pourra jouer son rôle de catalyseur.  [...] Ainsi, certaines enzymes vont être flexibles, ou alors certains substrats auront une structure tridimensionnelle proche ce qui leur permet d'établir des interactions suffisament importantes avec l'enzyme. Un exemple type. vous avez du voir la traduction, qui met en jeu les ARNt.  [...]

[Biochimie] La nature chimique d'une enzyme ?

Je voudrais juste revenir sur ces quelques affirmations. Ton et donc dans la phrase laisse supposer que si l'enzyme est en fable dose, elle reste intacte, mais cela soulève la question. Et à forte dose Qu'il y ait peu ou beaucoup de molécules d'enzyme, elles ne sont pas transformées au cours e la réaction catalysée.  [...] Oui et non. Dans le sens où, oui, il y aura des changements dus au fait que le site actif de l'enzyme sera impliqué dans la réaction et il y a des interactions chimiques et non parce que l'enzyme ne subit pas de transformation proprement dite (= celle que subit le substrat pour devenir produit = changement de la nature et propriétés radical).  [...]

[Biochimie] Problème de compréhension de la catalyse enzymatique

L'état de transition va être différent entre la réaction spontanée et la réaction catalysée dans beaucoup de cas. En effet la catalyse enzymatique utilise souvent des co-facteurs qui permettront justement d'optimiser la réaction. Donc l'état de transition pourra être par exemple le substrat lié à un métal, dans le cas de l'intervention d'une catalyse metallique, ce qui ne sera pas forcément le cas pour la réaction spontanée.  [...] Grâce au concours de plusieurs acides aminés et/ou cofacteurs, l'enzyme conditionne le substrat pour que la réaction se fasse de manière optimale. Pour que cela soit possible spontanément, il faut élever la température pour augmenter l'agitation thermique (Brownienne) pour augmenter le nombre d'interactions avec les molécules adéquates.  [...]

[Biochimie] L'agitation thermique au coeur de la cellule

D'après moi ça favorise donc les interactions entre les protéines. Il y aura donc plus d'interactions entre les protéines au cours du temps, et leur déplacement se verra lui aussi augmenté. En plus l'agitation thermique n'a rien à voir avec la diffusion.  [...] Néanmoins, certes en augmentant la concentration des protéines, tu augmentes bien évidemment les probabilités de rencontres enzyme-substrat... mais tu favorises aussi les interactions non désirées, favorisant agrégation et mauvais repliement.  [...]

[Biochimie] Affinité protéine

où Km est l'inverse de l'affinité de l'enzyme pour le substrat et cela dépend bien sur des conditions que j'ai énoncé au début de mon paragraphe.  [...] Bon, la notion d'affinité, il n'y a pas d'ambiguité possible, c'est l'attraction possible entre 2 éléments qui vont se rapprochés en fonction de leur charge (à l'inverse de la répulsion) et ça, ça met en jeu des intéractions faibles (ionique, hydrogène, Vander Walls, hydrophobe etc...).  [...]

[Biochimie] Enzymologie hétérogène

C'est normal une enzyme immobilisée est moins efficace car sa structure est contrainte par les interactions avec le support.  [...] Il serait aussi intéressant de savoir si l'enzyme immobilisée s'avère plus stable, car il y a souvent un compromis entre activité et stabilité.  [...]

[Biologie Moléculaire] Le TNA la molécule ancestrale?

Ce qu'il serait intéressant de savoir, c'est ce qui est reconnu par les polymérases sur un nucléotide. le sucre et surtout ce cinquième carbone ont-ils des interactions avec l'enzyme.  [...] Est-ce que les enzymes fonctionnent sur le TNA parce qu'elles sont réellement capables de d'interagir avec les bases de TNA, ou est-ce que ces réactions sont possibles par hasard juste parce qu'il y a du jeu dans les liaisons au sein des polymérases du fait que les molécules sont plus petites.  [...]

[Microbiologie] test oxydase

Mais ça me parait bizarre... peut être pour éviter les intéractions entre le glucose et l'enzyme qui donnerait un faux positif puisqu'apparement il est aussi nommé test au glucose-oxydase donc là ça prend son sens.  [...] EDIT. Je dis des bétises, apparement, le substrat du test interagit avec le glucose et donnerai des faux positifs d'où cette précaution.  [...]

pharmacocinétique et pharmacodynamie

Les enzymes impliquées dans les réactions de phase I sont, entre autres, les estérases, l'alcool déshydrogénase(qui transforme l'éthanol en acétaldéhyde) et les monooxygénases à cytochrome P450 aussi appelées CYP450. Ces CYP450 sont les enzymes les plus importantes à retenir dans les enzymes des biotransformations de phase I.  [...] * l'enzyme qu'on retrouve le plus souvent dans les interactions médicamenteuses est CYP 3A4. En général, lorsqu'un médicament est métabolisé par CYP 3A4, les métabolites sont moins actifs que la molécule mère.  [...]