• Santé - Enzyme, Phosphate, Liaison

[Biochimie] Phosphorylation des acides aminés

Comme il s'agit d'une liaison à forte enthalpie, cela peut induire un changement de conformation par encombrement stérique. Puis (surtout) la liaison avec le groupement phosphate s'hydrolyse spontanément, ce qui libère l'énergie de liaison dans la région moléculaire immédiate, permettant de nouveau changement de conformation avec des encombrement stériques plus gourmands en énergie pour se maintenir.  [...] La phosphorylation est une régulation covalente de l'enzyme car on ajoute à l'enzyme un phosphate de façon covalent cad qu'il lui est attaché par une liaison forte si tu veux,  [...]

Manipulation des acides nucléiques

- La phosphodiesterase, je n'ai pas d'info sur cette enzyme, je me doute qu'elle coupe la liaison phosphodiester, mais j'ignore si c'est en amont ou en aval du phosphate.  [...] Enfin, la polynucléotide kinase est une enzyme capable de phosphoryler des extrémités 5' libres, ou préalablement déphosphorylées via l'action d'une phosphatase.  [...]

[Biochimie] Glycogénolyse

- Glycogène [n glucoses] -. Glycogene [n-1 glucoses] + 1 Glucose-1-Phosphate (par une enzyme debranchante spécifique au liaison alpha 1-6).  [...] - Tant qu'il reste 4 (ou5 je sais plus) résidu glucose sur une ramification du glycogène, c'est la glycogène phosphorylase qui en réalisant une phosphorolyse, détache les résidus glucose en formant du glucose-1 phospate. Lui-même transformé en Glucose 6-phosphate par laphophoglucomutase.  [...]

Le scénario de l'origine de la vie enfin déterminé ? - Page 8

avec la chimie pertinente étant la conversion d'une liaison phosphate d'acyle en une liaison énolphosphoester, énergétiquement meilleure que la réaction PPDK, qui fonctionne (avec l'aide d'une enzyme).  [...] En ce sens le phosphate apparaît dans nos considérations comme un cofacteur, très simple, dont la recharge en termes de liaison anhydride mixte du phosphate d'acétyle serait favorable, moyennant la synthèse durable de thioesters d'acétyle.  [...]

P inorganique = phosphoester ?

Je me demande ceci car j'étais dans le contexte de l'hydrolyse du fructose-1.6 bisphosphate en fructose-6-phosphate. On perd un phosphate mais si j'ai bien compris ce que le prof a raconté, il disait qu'il y avait libération d'un ester, il parlait d'un phosphoester, c'est exact.  [...] Peut-être que ton prof a parlé de la rupture d'une liaison phosphoester plutôt que de sa formation (liaison qui liait ton phosphate à l'alcool du C1 du fructose).  [...]

liaison phosphodiester

La structure primaire de l'ADN contient la liaison phosphodiester. Il s'agit de 2 groupements phosphate chaqun lié par une liaison ester au sucre.  [...] et au niveau des phospholipide on me dis que c'est une liaison entre OH et un OH du phosphate ( on peux m'éclairer aussi sur le fait que la le phosphate a un OH, alors que norlament il n'est entouré que de O).  [...]

[Biologie Cellulaire] Synthèse de lipide dans le REL

Etape 2. Phosphatase. le groupement P est détaché avec cette enzyme. Le groupement P subi une réaction par hydrolyse, P devient Pi, ( là j'ai beaucoup de doute, car sur le schéma je vois que O est lié avec H, est-ce que c'est dû à la réaction par hydrolyse ).  [...] Etape 3. Choline phosphotransferase. qui est une enzyme qui accélère les réactions chimique. ça va transformer la cytidine diphosphocholine en cytidine monophosphate et choline monophoasphate. l'enzyme casse les liaisons entre les 2 groupements phosphate et donc la choline monophosphate vient se lier au glycérol, mais le H qui était lié avec le O se transforme en ion H+ ( pourquoi est-ce par affinité ).  [...]

[Biochimie] [biochimie] ATP,ADP

Vous savez des experiences precedemment vu dans ce cours que la liaison entre le 3eme et le second phosphate de la molecule d'ATP est une liaison fortement energetique. (c'est aussi le cas de la liaison entre les phosphates 1 et 2, mais celle-ci est utilise moins frequemment par les cellules).  [...] Si elles lient deux phosphate entre eux alors on parle de liaisons phosphoanhydre. Si elles lient un phosphate avec un groupement acide carboxylique on les appelle des liaisons anhydres mixes.  [...]

Formule

Dans la voie glycolytique (ou voie d'Embden-Meyerhof-Parnas), il existe une réaction dont l'enthalpie libre standard est de 23.8 kJ/mol, de sorte que la réaction est endergonique et nécessite donc théoriquement d'être couplée à une réaction exergonique lui fournissant son énergie nécessaire à son avancement (hydrolyse d'une liaison phosphate de haute énergie d'un ATP le pls souvent).  [...] Cette réaction est le clivage du fructose-1,6-biphosphate en dihydroxyacétone phosphate (DHAP) et glycéraldéhyde 3-phosphate (GAP/G3P), catalysée par l'enzyme aldolase.  [...]

[Biochimie] transamination

Il y'a d'abord fixation de l'aspartate (S1)sur l'enzyme (E). Il suit le départ d'un groupement aminé qui se fixe sur le phosphate de pyridoxal (groupement prosthétique intimement lié à l'enzyme) donnant ainsi la forme phosphate de pyridoxamine.  [...] A ce moment, le transfert du groupement aminé du phosphate de pyridoxamine s'effectue sur l'alpha-cétoglutarate qui devient ainsi du glutamate (P2).  [...]