• Santé - Enzyme, Coupe, Liaison

enzymes de restriction

enzyme de restriction regroupe tout un tas de nucléases (=qui coupent l'adn) dites endonucléases (=parce que ca peut couper au milieu d'un double brin).  [...] 1) exemple avec l'enzyme BamHI qui coupe dans la séquence 5'-G*GATCC-3'. L'enzyme va couper la liaison covalente phosphodiester entre les 2 G de la séquence et va laisser un groupe phosphate 5' exposé et un groupe hydroxyle 3' en retrait. On parle alors d'une extrémité collante 5' (5' cohesive ends, ou 5' overhang ou surplomb 5').  [...]

[Biochimie] Question théorique sur clonage TOPO

Le plasmide pCR4 Blunt-TOPO vector (Figure11) nous est fourni sous forme linéaire, il possède en 3' une topoisomérase I du virus Vaccinia. Cette topoisomérase a la capacité de se fixer à des sites spécifiques de l'ADN et de cliver celui-ci au niveau des liaisons phosphodiesters, après le motif 5'-CCCTT.  [...] L'énergie libérée lors de cette réaction permet la formation d'une liaison covalente entre l'extrémité 3' du brin coupé et le résidu tyrosyl-274 de l'enzyme. Cette liaison est ensuite attaquée par l'extrémité 5' hydroxyl du brin d'ADN à insérer dans le vecteur, ce qui a pour résultats de libérer la topoisomérase I et de lier l'insert au vecteur (Figure12).  [...]

extraire de l'ADN

j'ai trouvé quelque chose à propos de ça mais en anglais et çava perdre beacoup de temps pour que je pourrai comprendre, j'ai quelques information sur l'EDTA c'est qu'il est un chélateur des ions ( il attire certain ions comme le Mg2+ par formation des liaison covalents ) et qu'il est un inhibiteur de nucléase ( je ne comprend ni le mécanisme ni le fonctionnement de cet effet ).  [...] Non, une enzyme de restriction coupe au niveau de la liaison 5'-3' phosphodiester entre 2 nucléotides sur les 2 brins, en aucun cas elles ne vont séparer les 2 brins d'ADN (c'est plus le rôle des hélicases par exemple).  [...]

[Biochimie] site de coupure de l'alcalase

voila, j'ai une petite question. savez vous quel est ou quels sont les sites de coupure de l'alcalase au niveau de la protéine, autrement dit après quels acides aminés cette enzyme coupe la liaison peptidique.  [...]

Manipulation des acides nucléiques

- La phosphodiesterase, je n'ai pas d'info sur cette enzyme, je me doute qu'elle coupe la liaison phosphodiester, mais j'ignore si c'est en amont ou en aval du phosphate.  [...] Enfin, la polynucléotide kinase est une enzyme capable de phosphoryler des extrémités 5' libres, ou préalablement déphosphorylées via l'action d'une phosphatase.  [...]

définition d'une protéine

quand tu dis tronquée tu veux dire que la chaine peut être coupé par des enzymes à un endroit et elle peut se relier ensuite a la chaine par des liaison H ou des pont disulfures et est ce que par exemple un gène peut coder pour la moitié d'une protéine et un autre pour l'autre moitié.  [...] quand tu dis tronquée tu veux dire que la chaine peut être coupé par des enzymes à un endroit et elle peut se relier ensuite a la chaine par des liaison H ou des pont disulfures.  [...]

Définition | Protéase - Peptidase | Futura Santé

Les protéases sont variées et ont des rôles biologiques bien différents. Leurs structures sont donc elles aussi très variées. Toutefois, elles possèdent toutes, comme les enzymes en général, un site actif qui assure l'activité d' hydrolyse des liaisons peptidiques, et un site de reconnaissance du substrat pour n'agir que sur la protéine cible.  [...] Elle permet de séparer deux acides aminés en cassant les liaisons peptidiques entre un atome de carbone et un atome d' azote au sein des protéines.  [...]

microbiologie - CARTE DE RESTRICTION

digestion de restriction. certaines protéines sont capables de couper l'ADN à des endroits bien précis (par exemple. gaa. ttc). Ce sont les enzymes de restriction. Dès que l'enzyme trouve son site, elle coupe l'ADN comme tu couperais un bout de ficelle avec un ciseau.  [...] Le résultat de la digestion avec l'enzyme 2 t'indique qu'elle coupe le plasmide 1 fois mais tu ne peux pas placer son site par rapport aux sites E1.  [...]

[Biochimie] RFLP et application !

On distingue les allèles parce que leur séquences sont différente si bien qu'en coupant avec une enzyme qui coupe à certains sites on a toutes les chances d'avoir un nombre variable de coupures, ce qui génèrent des bandes de tailles différentes. Donc hétérozygotes.  [...] - Si elle coupe, là y a probléme, quand on a 2 bandes, je me suis dite que peut être ça représente les fragments issus justement de la coupure. mais quand l'enzyme coupe et on a une bande hétérozygote.. comment c'est possible.  [...]

Enzyme de restriction: petite difficulté avec sa définition

D'après mon cour, une exonucléase détache des nucléotides terminaux, une endonucléase coupe les liaisons à l'intérieur de la chaine. Toujours d'après mon cour, une enzyme de restriction est une endonucléase... C'est ce que je ne comprends pas. cette enzyme de restriction semble couper la séquence de nucléotides aux extrémités, comme le fait une exonucléase.  [...] Ces séquences correspondent à ce qu'on appelle une séquence palindromique (qui se lit de manière identique dans les 2 sens). Cela veut dire que dans un grand flot de bases azotées allant de quelques bases à plusieurs centaines ou plusieurs milliers, dès que l'enzyme trouvera cette séquence enfouis dans le code génétique, elle la coupera de manière cohésive, c'est à dire en scindant le double brin en partant d'en haut à gauche entre le G et le A du 5'-3', fait sauter les liaisons entre les AATT complémentaires des 2 brins et finalement coupe encore entre le A et le G du 3'-5'.  [...]