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[Biologie Cellulaire] Principe d'émergence - Acides Aminés et Enzyme

L'enchaînement particulier des acides aminés, leur positionnement au sein du site catalytique de l'enzyme sont cruciaux pour que l'enzyme soit fonctionnelle. Un décalage de quelques angströms d'un acide aminé et la catalyse peut être perturbée. Au niveau de l'émergence, je ne vois pas de lien direct fort et évident.  [...] =. d'où assemblage des acides aminés formant les protéines (et on pourrait même partir de combinaisons des acides nucléiques =. ADN...etc) =. enzymes =. caractéristiques de l'individu dans son ensemble.  [...]

Le scénario de l'origine de la vie enfin déterminé ? - Page 9

Stanley Miller a été un des premiers scientifiques à attirer l'attention sur l'hypothèse que les molécules devaient être stables pendant un long moment pour favoriser l'apparition de la vie. C'est en partie à lui qu'on doit l'émergence du paradoxe selon lequel les différentes molécules indispensable à la vie (les différentes classes d'acides aminés, les bases puriques et pyrimidiques, les sucres comme le ribose, etc.  [...] Il y ajoute également l'idée que la phosphorylation des acides nucléiques est venue subséquemment, d'abord avec une phosphorylation des sucres (et pas seulement le ribose). Dans le cadre du modèle de Toxvaerd (que Russell ne connaît pas encore à ma connaissance, bien que j'en ai parlé à Nitschke), c'est une interaction entre les sucres (le D-glycérahldéhyde, mais il n'exclue pas d'autres candidats) et les acides aminés, qui mènerait à l'homochiralité de l'ensemble, mais aussi, à son maintien au fil du temps, toujours en solution aqueuse.  [...]

Gaz volcanique et émergence de la vie

Comment les premiers peptides se sont-ils formés à partir des acides aminés Cette question relative à l'émergence de la vie, sujet auquel se confronte la recherche actuelle, est ancienne. Des éléments de réponse sont proposés sur la base d'expériences menées par Reza Ghadiri et Luke Leman, du Scripps Research Institute, en collaboration avec Leslie Orgel, du Salk Institute for Biological Studies.  [...] Les peptides et les protéines sont des chaînes constituées des briques que sont les acides aminés. Ils composent une des principales classes de molécules biologiques retrouvées dans le vivant. Cinquante ans de recherches chimiques sur les origines de la vie ont montré que les acides aminés pourraient s'être formés spontanément sur la Terre primitive ou auraient pu être introduits par le biais de météorites.  [...]

Origine de la vie : l'apparition des premiers glucides se clarifie

D epuis de nombreuses années, l a science tente de comprendre l'émergence de la vie sur Terre. Deux questions se posent. quelle est l'origine des premières molécules organiques Et pourquoi la vie utilise uniquement des glucides de forme D plutôt que L et des acides aminés L plutôt que D Une équipe de chercheurs lève un coin de voile en démontrant que les acides aminés L catalysent la formation de glucides D.  [...] L'équipe de Paul Clarke, de l'université de York, a recréé un procédé qui aurait pu donner naissance aux premiers glucides (les sucres) dans le monde prébiotique. Les réactions sont complexes mais il apparaît que la synthèse de glucides biologiques serait liée à la présence d' acides aminés présentant une configuration particulière.  [...]

Le scénario de l'origine de la vie enfin déterminé ? - Page 10

Enfin, je pense que le Grand Bombardement Tardif a non seulement apporté l'eau de nos océans, mais aussi certains précurseurs de la vie tels qu'on en retrouve dans nos comètes actuelles. On peut espérer, avec suffisamment d'effectifs balancés à travers la couche atmosphérique, qu'une quantité intéressante d'acides aminés et de bases azotées ont survécu à l'atterrissage, ce qui enrichirait peut-être le panel moléculaire encore restreint tel que synthétisé en laboratoire par Russell et son équipe.  [...] Je n'ai pas compris cet argument... Tu suggères que la composition de l'océan primitif devrait refléter la composition des premières cellules Sachant que la vie est un phénomène dynamique hors-d'équilibre, des cellules qui sont en équilibre avec leur milieu (même composition dehors que dedans), ne seraient-elles pas tout simplement mortes Ne serait-il pas mieux de situer l'émergence de la vie là où des acides aminés (et d'autres molécules organiques) sont produits (et concentrés) en continu, comme l'évent hydrothermal alcalin de Russell.  [...]

Le scénario de l'origine de la vie enfin déterminé ? - Page 5

Les auteurs suggèrent que ces deux corrélations peuvent être facilement expliquer si avant l'émergence de macromolécules, les acides aminés simples étaient synthétisés à partir d'alpha-cétoacides précurseurs qui étaient attachés par une liaison covalente à des dinucléotides capables de catalyser les réactions nécessaires à la synthèse d'acides aminés spécifiques.  [...] D'ailleurs, 4 des six codons de Arg commencent par C dans le code moderne. Ce qui signifie que ni Ser, ni Arg ne constituent d'acides aminés plausibles pour le doublet AG. Nous sommes ici en présence d'assignements ultérieurs. Un assignement plausible pour AG est le 2,4-diaminobutyrate (Dab), qui se formerait à partir d'oxaloacétate par des réactions homologues à celles qui forment de l'ornithine à partir d'alpha-cétoglutarate.  [...]

[Microbiologie] Vih

Bonsoir,en ce qui concerne le VIh. est ce que l'émergence de mutants résistants est un phénomène rare.  [...] Chez tous les virus l'émergence des mutants n'est pas rare, tout du moins pour les virus qui utilisent leur propre enzyme pour répliquer leur génome. Les polymérases virales font beaucoup d'erreurs lors de la réplication du matériel génétique des virus, ce qui va entraîner des mutations très régulières (on parlera de quasi-espèces).  [...]

Le scénario de l'origine de la vie enfin déterminé ? - Page 4

Donc, je ne crois pas que ce genre d'acides aminés entre dans cette liste qui est censée contenir une cinquantaine de composés chimiques.  [...] Dans l'expérience de Miller, on a démontré la synthèse de certains acides aminés grâce à un mélange de gaz réducteurs. Hors, ces gaz sont également présents dans les fluides hydrothermaux alcalins, en solution aqueuse (avec les avantages que l'on connaît) et à pression élevée (l'océan primitif faisant entre 4 et 10 km de profondeur sur toute la surface), la dissolution (par exemple) de l'hydrogène est plus efficace.  [...]

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Evolutionary histories of enzymes involved in chemiosmotic energy conversion indicate that a strongly oxidizing substrate was available to the last universal common ancestor before the divergence of Bacteria and Archaea. According to palaeogeochemical evidence, O(2) was not present beyond trace amounts on the early Earth.  [...] Dans les expériences, la consommation d'oxygène (dépendant de la quinol) fut seulement partiellement inhibée par le cyanure. Ceci pourrait indiqué soit la présence d'une autre oxydase terminale insensible au cyanure dans la préparation (qui n'a pas été détectée malgré tous les efforts en ce sens), soit l'enzyme HCO 2 elle-même serait relativement insensible à cette inhibiteur, ce qui ne serait pas surprenant étant donné sa divergence phylogénétique.  [...]

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Pourquoi toutes les protéines actuelles sont faites avec des acides aminés L Simplement parce que le site actif en trois dimensions du ribosome ne reconnaît que les acides aminés L. S'il devait traiter des acides aminés D, il ne les reconnaîtrait pas.  [...] En effet, le site actif en 3D d'une protéine est comme un gant. il ne peut reconnaître qu'une des deux formes. Il est très probable que dans les peptides ou les protéines qui existaient avant les protéines modernes, il y ait eu des proto-protéines avec des acides aminés D.  [...]