• Santé - échantillon, Intérêt, Génome

Archéologie : une nouvelle technique rend l'ADN plus bavard

Malheureusement, la plupart des cadavres n'ont pas bénéficié des conditions jugées idéales par les chercheurs de squelettes. Ainsi, l'analyse du génome de ces restes humains est polluée par l'ADN des bactéries qui se sont abritées dans les corps. C'est alors un véritable calvaire pour purifier les échantillons.  [...] Quel intérêt En passant l'échantillon à la centrifugeuse, on sépare les billes liées à l'ADN humain de l'ensemble des gènes bactériens. Après digestion de l'ARN, ne reste que le génome originel des squelettes.  [...]

Utilité de la PCR en médecine ?

Faire une PCR avant de faire séquencer ton échantillon te permet d'une part de séparer précisément la région d'intérêt du reste du génome (par électrophorèse), ce que tu ne peux pas faire sans l'amplifier.  [...] Ensuite si ton échantillon n'est pas assez concentré en ADN à séquencer tu ne pourras pas le séquencer de manière fiable, d'une part parce que les séquenceurs utilisés en routine pour ce genre de manip ont un certain seuil de détection et qu'une seule molécule ne suffit pas, et d'autre part parce que tu veux que ta molécule soit séquencée plusieurs fois pour avoir une certaine profondeur de séquençage te permettant d'affirmer que la séquence que tu as est bien celle que tu avais dans ton échantillon au départ.  [...]

[Biochimie] Chromatographie

Oui justement...je vois,c'est le liquide, mais ça represente quoi au juste l'échantillon d'interêt ou quoi.  [...] Non c pas l'echantillon d'interet,c'est grace au solvant qu'on peut savoir la nature de l'echantillon.  [...]

Éviter l'amniocentèse en séquençant l'ADN foetal d'une façon non invasive

Éviter l'amniocentèse et ses risques de fausses couches. Voilà qui pourrait bien devenir réalité dans quelques années pour détecter la présence de maladies génétiques chez l'enfant à naître. Une simple prise de sang pour la mère et un échantillon de la salive du père suffit pour déterminer le génome foetal.  [...] Une technique non invasive et donc sans risque vient de faire l'objet d'une publication dans la prestigieuse revue Science Translational Medicine. Elle est l'oeuvre de scientifiques américains de l' University of Washington à Seattle, qui sont parvenus, à partir d'un échantillon de sang de la mère et de la salive du père, à reconstituer le génome de leur futur bébé avec une efficacité de 98,1 %.  [...]

[Biologie Moléculaire] quantification de la charge virale

Je veux calculer le nombre de copies du génome viral (virus à ARN ) contenu dans mon échantillon d'ARN (50ng/µl).  [...] Je sais que je dois faire une courbe standard afin de pouvoir quantifier.   [...]

[Biologie Moléculaire] PCR quantitative

Car moi ce qui m'intéresserait si c'est possible c'est de savoir au final dans mon échantillon, quel est la quantité en ng de mon gène d'intérêt. Es ce que cela est possible et si oui comment on peut le faire.  [...] En principe, tu devrais connaître le nombre initial de copies de ta molécule d'intérêt (en fait, du fragment d'intérêt) dans ton échantillon. Tu peux alors en déduire ta quantité de cette molécule en ng.  [...]

différence entre la PCR quantitative relative et absolue?

Dans certains articles sur le web, ils parlent de PCR en temps réel semi quantitative Est ce la même chose que la PCR quantitative relative.   [...] Rapidement, je dirai que la PCR quantitative relative, c'est estime des variations d'un messager d'interet par rapport a un messager qui n'est pas cense varier au cours de l'experience (genre GAPDH). L'absolu, c'est faire une PCR sur une gamme de concentration connue de ton gene d'interet et de le comparer a la quantite que tu as dans ton echantillon a tester.  [...]

Immunohisto

Le paraformaldehyde (PFA) sert a fixer ton echantillon. C'est un fixateur chimique, un agent pontant, qui va creer des liens covalents entre les proteines en particulier entre les amines libres. L'interet est multiple. 1-l'echantillon, le tissu, reste dans l'etat ou tu l'a fixe l'histologie et la cytologie sont conserves, 2-il n'y a plus degradation des elements cellulaires donc les antigenes a detectes sont preserves, 3-le tissus peut etre plus facile a couper si tu le fixe avant la coupe.  [...] ..2) il est naif de croire qu'en western denaturant on denature completement, on garde certaines interactions proteiques (oligomeres, structures secondaires...etc...) donce le site antigenique peut etre masque en western aussi.  [...]

[Biologie Moléculaire] Séquençage et métabarcoding

Si tes échantillons sont barcodés, cela signifie simplement que chaque read possède une séquence spécifique en début de read, qui ne fait pas partie du génome de ton organisme mais qui a été ajouté pour différencier les individus de ton échantillon. Si on utilise le barcoding, c'est a priori pour faire du séquençage à haut débit (mais c'est un peu stupide de faire du séquençage à haut débit si tu utilises des marqueurs).  [...] L'idée c'est d'identifier des espèces selon leur génome, à partir d'échantillons inconnus. Lorsqu'il y a un seul organisme dans l'échantillon, après séquençage, comme celui de sanger, on obtient une séquence nette. Mais si il y a plusieurs espèces dans l'échantillon, on obtient une superposition des deux séquences, donc c'est illisible.  [...]

Votre taux de stress bientôt mesuré par un simple test de salive

D'où l'intérêt de l'invention de ces chercheurs de l'Université de Cincinnati, qui ont développé un test simple pour mesurer le stress à partir d'un échantillon de salive, de sang, d'urine ou même de sueur.  [...] L'autre intérêt est la simplicité d'utilisation. Nous voulions un test facile à interpréter. Cela ne remplace pas un test en laboratoire, mais indiquera si vous avez besoin qu'un professionnel prenne le relais, précise-t-il.  [...]