• Santé - échantillon, Extrait, ADN

[Biologie Moléculaire] Quantité d'ADN

Je dispose d'un échantillon contenant un extrait d'ADN. Cet échantillon a été dilué au 1/100. Je mesure la DO à 260 nm pour calculer la quantité d'ADN contenue dans l'échantillon.  [...] Oui mais pas au niveau de l'absorbance hein. D'abord tu fais ton calcul (ou ton report de valeur sur ta droite étalon) et ensuite tu prend en compte le facteur de dilution.   [...]

[Biologie Moléculaire] Quantification absolue / gamme étalon

J'ai réalisé 3 dilutions différentes du même échantillon, toutes sont couvertes par la gamme étalon. Par contre, pour chacune des dilutions, avec la même gamme étalon, je trouve un résultat différent (après avoir fait les calculs) alors qu'en théorie je devrais trouver au final la même valeur (la seule et unique valeur vraie de mon échantillon).  [...] Il se peut en effet que mon efficacité de PCR soit différente pour la gamme étalon et pour l'échantillon.. L'ADN est extrait de bactéries et ces bactéries sont dans des matrices différentes pour la gamme étalon et pour l'échantillon.  [...]

calibration entre différents run en QPCR

Dans mon labo on fait une quantification relative à un house keeping gene. Pour cela, tu dois choisir arbitrairement un gène dont la variation d' expression est la plus faible possible (on travaille sur des échantillons d'oreille de souris et on a choisit bêta-actine).  [...] Attention toute fois. Dans cette situation tu dois tout de même faire attention à avoir extrait ton ADN de façon comparable. En effet, certains produits chimiques contenu dans différents kits d' extraction d'ADN peuvent perturber la lecture de fluorescence de l' échantillon.  [...]

[Biotechnologie] Principe de la PCR

La PCR est donc une technique de purification ou de clonage. L'ADN extrait à partir d'un organisme ou d'un échantillon contenant des ADN d'origines.  [...] d'ADN matriciel contenue dans l'échantillon PCR n'aura pas varié. En revanche, la quantité de la ou des séquences amplifiées (l'ADN d'intérêt).  [...]

métagénomique, bio informatique et electrophorese DGGE

Je m'explique.. Nous avons réalisé une PCR sur nos échantillons de terre avec des amorces trouvé dans une revu scientifique correspondant en tout point à notre sujet, le problème étant qu'en attendant de pouvoir faire la DGGE ma maitre de stage m'a demandé de vérifier grace au site du NCBI et en faisant un blast que les séquences d'amorce matchaient bien avec les séquence ARNr 16s de bactérie présente généralement dans le sable et suceptible de sortir lors de la DGGE et d'en déduire leur taille. Cependant aucune ne matche correctement.  [...] ces amorces sont censé se positionner sur l'adn extrait du sol que l'on étudie lors de la pcr afin d'amplifier une partie du gène, cette partie amplifier va alors subir une dgge qui va nous permettre de séparer les differentes bactéries pésente dans chaque échantillon de sol.  [...]

La demi-vie de l'ADN a parlé, les dinosaures ne reviendront pas !

Ces ossements, vieux de 602 à 7.839 ans, appartenaient à trois espèces de moas, des oiseaux géants non volants de la famille des dinornithidés. Ces volatiles pouvant atteindre 3 m de haut auraient disparu voici 400 ans à la suite de l'arrivée des Maoris. L' ADN mitochondrial de chaque échantillon a été extrait puis séquencé à partir de 200 mg de poussière d'os.  [...] Selon les tests statistiques, la différence d'âge entre les échantillons expliquerait seulement 38 % des dégradations observées. La chimie des sols et l'époque de l'année ayant vu disparaître l'organisme pourraient également entrer en jeu. Des analyses complémentaires devront le confirmer.  [...]

[Biologie Moléculaire] Nested PCR

Je souhaite réaliser une Nested PCR afin d'identifier un évènement très rare dans mon échantillon. Mes premiers essais montrent une amplification très faible. Y a t'il un problème à réaliser une Nested sans dilution (Ni diluer l'extrait d'ADN, ni le produit de la première PCR) Est-ce que je ne risque pas d'obtenir des produits non voulus.  [...] Normalement vous ne devriez pas avoir de résultat indésirable sauf en cas de contamination ou un problème de programme au niveau de la température d'hybridation.   [...]

La régénération du cerveau démontrée grâce aux bombes atomiques

Le monde comme champ d'expérimentation. La course à l'armement constatée durant la guerre froide a amené les grandes puissances militaires de l'époque à développer des bombes atomiques de plus en plus puissantes. Mais il fallait les tester, pour des raisons techniques et scientifiques, et pour affirmer son pouvoir.   [...] Partant de ce principe, les scientifiques ont étudié les cerveaux de 55 personnes décédées entre 19 et 92 ans. Après des années d'entraînement et de perfectionnement, les auteurs ont extrait uniquement les neurones du gyrus denté de l'hippocampe et soumis l'échantillon, après purification de l' ADN, à un accélérateur de particules afin de mesurer le ratio carbone 14/carbone 12, et donc d'estimer l'ancienneté des cellules cérébrales.  [...]

Conservation d'échantillons biologiques à t° ambiante

Au pire transporte tes échantillons dans un sachet étanche recouvert de glace, ce sera toujours mieux que la température ambiante. Comme l'a dit Gorben si c'estpour en extraire de l'ADN ca ne devrait pas poser de soucis, ca ne serait pas le même problème si tu voulais en extraire de l'ARN.  [...] L'ideal serait de t'assurer que l'ADN de tes échantillons soit extrait avant leur envoi, il est courant d'envoyer de l'ADN non réfrigéré pour séquencage et celui-ci résiste très bien pendant le transport.  [...]

échantillons d'adn

Bonjour, je recherche la meilleure méthode pour stocker le maximum d'échantillons d'adn (d'individus différents) dans un minimum d'espace. L'idée serait d'avoir l'adn de chaque individu d'une population dans un contenant le plus petit possible. Dans ce cas là vaut-il mieux stocker l'adn extrait ou stocker des tissus dont l'adn est potentiellement extractable.  [...] Selon la quantité de cellules dont tu disposes à l'origine, il existe différents kit d'extraction (de marque QIAGEN pour faire de la pub ) et permettant d'obtenir un volume d'environ 40 microlitres par patient. L'ADN est une molécule relativement stable. Tu peux les garder à -20°C sans que ca ne s'abime.  [...]