• Santé - Données, Protéines, Cellule

Un second code caché dans l'ADN !

Grâce à ces données fondamentales, les scientifiques ont pu comprendre comment se transmettait l'information génétique dans la cellule. Les chercheurs ont démontré que les nucléotides présents dans l' ADN étaient alignés de façon spécifique, formant un code permettant la production des acides aminés et des protéines.  [...] Ils ont montré que 15 % des codons du génome humain avaient une double fonction. d'un côté ils participent à la fabrication des protéines, de l'autre ils donnent des instructions aux cellules pour moduler l'expression des différents gènes. Pour cette raison, les scientifiques les ont appelés duons.  [...]

[Biologie Cellulaire] Existe-t-il une telle base de données ?

[Biologie Cellulaire] Existe-t-il une telle base de données.  [...] J'aimerais savoir s'il existe une base de données dans le genre de Pubmed qui permettrait de savoir quelles protéines exprime une cellule spécifique, par exemple, un entérocyte, un lymphocyte ou autres ….  [...]

Voir les neurones en action en les rendant lumineux

De nombreuses protéines interviennent pour relayer les données entre deux cellules nerveuses. Parmi elles, on trouve les protéines PSD95 et géphyrine, situées dans le neurone postsynaptique qui reçoit l'information. PSD95 est localisée dans une synapse excitatrice, alors que la géphyrine est présente au niveau d'une liaison inhibitrice.  [...] Les scientifiques ont mis au point des anticorps fluorescents ciblant ces deux protéines. Ils ont tout d'abord utilisé des cultures de cellules nerveuses et ont montré qu'ils pouvaient visualiser nettement les synapses inhibitrices et excitatrices en plaçant les cellules sous une lumière bleue.  [...]

Cancer : et si on le traitait à l'aide du VIH ?

Le virus de l' immunodéficience humaine (VIH), responsable du Sida, utilise le matériel des cellules humaines pour se multiplier, notamment en insérant son matériel génétique dans le génome des cellules hôtes. La principale caractéristique du VIH est de muter en permanence et, par conséquent, de générer au cours de ses multiplications successives, plusieurs protéines mutantes (ou variants).  [...] Via la multiplication du VIH, une base de données de près de 80 protéines mutantes a été sélectionnée puis testée sur des cellules tumorales, en présence de médicament anticancéreux.  [...]

Grippe H7N9 : certaines populations s'en défendent très bien, pourquoi ?

Pourquoi En analysant le phénomène plus en détail par des méthodes de biochimie, les chercheurs ont montré que le système de présentation des antigènes par les cellules variait en fonction des personnes. En d'autres termes, certains individus montrent mieux les antigènes aux lymphocytes, ce qui permet de déclencher une réponse immunitaire plus efficace face au virus H7N9.  [...] Grâce à une analyse génétique, les chercheurs ont pu identifier certaines mutations dans le système HLA qui favorisent la visualisation des protéines virales par les cellules de l'immunité. Dans le futur, ils espèrent utiliser l'ensemble de ces données pour développer un vaccin universel contre la grippe.  [...]

[Divers] La Vie sous une forme différente, dans des conditions différentes?

En date du 3 décembre 2012, on connaissait la séquence d'acides aminés de 18877226 protéines différentes (voir les données Uniprot de la PDB). De ces ~19 millions de protéines, seules 538585 ont été vérifiées expérimentalement (voir base de données UniProtKB ).  [...] En date du 1er février 2012, de ces 86611 protéines dont la structure cristalline est connue, on n'avait analysées les domaines et motifs que de 49219 (56,8%) d'entre elles (voir la base de données SCOP ).  [...]

Le responsable du cheveux bouclé !

Une petite recherche sur UNIPROT (base de données non redondantes de protéines) nous donne la bagatelle de 15 protéines différentes et annotés comme kératine ( HAIR-keratin pour être exact, car il en existe beaucoup d'autres). Je passe sous silence un certain nombre de protéines qui sont associées aux kératines au cours de leur maturation.  [...] De plus, différentes allèles de chacun des gènes codants pour ces protéines se baladent dans nos populations (variabilité inter-individuelle), et des individus sont susceptibles de posséder un nombre de copies différent de chacun de ses gènes.  [...]

[Biochimie] sequençage de novo MS/MS

j'ai une question concernant la spectrometrie de masse pour l'identification des protéines. Lorsqu'on on a un spectre de masse d'un fragment d'une protéine (peptide) on peut de temps en temps le comparer avec une base de données pour trouver la protéine correspondante, mais de plus en plus on effectue un sequençade de novo. C'est ce concept que je n'ai pas bien compris.  [...] Cela signifie que la plupart du temps les protéines recherchées ne sont pas enregistrées dans des bases de données et qu'il est donc nécessaire de déterminer leur séquence.  [...]

les chromosomes/télomère

Le fait est qu'on à des systèmes de protection qui permettent d'éliminer les cellules qui deviennent cancéreuses (car il y en a quasiment quotidiennement qui le deviennent),Il arrive que dans certains cas il y en aient qui passent au travers de ces protections, survivent et se multiplient, mais de toute façon si tu augmente de 10% le nombre de divisions, tu augmentera proportionnellement le nombre de cellules qui deviendrons cancéreuses, mais elles seront éliminées par le système immunitaire.  [...] Pas de chance une protéine importante (p53) va être surexprimée en présence de molécules oxydantes (ROS) comme système de défense des cellules et lorsque les chercheurs ont diminuer les ROS, cette protéine p53 n'est plus stimulée et le nombre de cancers augmente car elle est impliquée dans la mort cellulaire programmée.  [...]

[Biologie Moléculaire] obtenir un cDNA à partir d'une protéine

J'ai pensé d'effectuer un Northern Blot à partir des ARN recueillis sur des cellules possédant la protéine isolée à un instant t (transcriptome). On détermine ainsi la taille des différents ARNm et on devine lequel est notre ARNm car sa taille est environ 3 fois supérieur à celle de la protéine.  [...] Le mieux est de comparer ta protéine avec les bases de données pour trouver des protéines homologues.  [...]