• Santé - Domaine, Fixation, Protéine

technique du double hybride

On dispose d'une protéine cible couplée au domaine de liaison à l'ADN et de protéines pouvant potentiellement interagir avec la cible couplées au domaine de transactivation de l'ADN.  [...] Ainsi pour avoir activation du gène rapporteur il faut une mise en contact du domaine d'activation au domaine de fixation. Ceci étant réalisé si il y a intéraction entre protéine X et Y.  [...]

[Biologie Moléculaire] Les récépteurs SH2 et SH3

(Je prends le cas du récepteur à l'insuline) Les protéines adaptatrices présentent des domaines de liaisons SH2 et SH3. J'ai cherché sur google et je suis tombé sur un bouquin qui annonce que la première protéine adaptatrice (que j'appelle A) présente un seul et unique domaine de liaison SH2 mais plusieurs SH.  [...] J'ai vérifié deux trois petites choses et tout me semble clair sauf peut être une chose. Je prends le cas de la signalisation de l'insuline. Quel est le domaine de fixation entre IRS et P85/P110 un domaine SH2 Comment la protéine IRS (donc toute première protéine qui se fixe à la tyrosine phosphatée dans le cas général) se phosphoryle Est-ce que dès fixation à la tyrosine phosphatée on a un changement de conformation de la protéine qui permet l'activation d'un domaine catalytique de type kinase sur la protéine Cette autophosphorylation permet de réellement activer la protéine qui peut être reconnu par les autres protéines de signalisation.  [...]

Fonction "DNA binding"

L'homéodomaine correspond à une partie d'une protéine qui se fixe à l'ADN. Ainsi, l'homéobox d'un gène correspondra à ce domaine de fixation à l'ADN.  [...] D'accord, merci Mais du coup, il existe un homéodomaine pour toutes les protéines ou seulement pour celles qui agissent sur l'ADN.  [...]

[Biologie Moléculaire] La molécule mystère - Page 9

Bonjoru alors voila je propose une protéine qui a été identifiée par la méthode de screening par yeast two-hybrid. Il s'agit d'un membre atypique de sa superfamille car ne possedant pas de site de fixation a l'ADN mais un domaine putatif fixant un ligand. Cette protéine est exprimée plutot de facon ubiquiste mais présente un grand intérêt pour des avancées vous concernant vous les mecs.  [...] Un autre indice. la sécurine est en aval dans le spindle checkpoint (en tout cas sa dégradation découle de l'inactivation du spindle checkpoint), ma protéine est quasiment en amont.  [...]

Schémas d'activation de la protéine Kinase C | Dossier

La liaison se fait par le domaine C2 de la [PKC ] et par une région de la protéine d'ancrage appelée RBS (RACK binding site). Les mécanismes régissant la reconnaissance et la fixation ne sont pas encore connus. il semblerait toutefois que cette liaison favoriserait l'accessibilité du substrat (fig.13).  [...] En réponse à la synthèse de la [protéine kinase C ], il apparaît qu'une modification posttranscriptionnelle comme la phosphorylation est primordiale pour permettre une activation par le diacylglycérol. Plusieurs sites de phosphorylation ont tout d'abord été décrits sur le domaine régulateur, sur le domaine catalytique et sur la région V3 qui sert de charnière entre les deux (Flint A.J. et al., 1990).  [...]

[Biologie Moléculaire] Gel de retard

Eske je peut trouvé quelqu'un qui peut m'expliquer la nature des interaction qui s'établissent entre ADN/protéines ARN/protéines lors de la migration sur un gel de retard.. merci d'avance.  [...] Le principe d'un EMSA, c'est qu'un fragment d'ADN lié à un facteur est plus lourd donc migrera moins vite qu'un fragment d'ADN seul, ce qui permet donc (avec les contrôles adéquats) de démontrer que telle protéine se fixe sur telle séquence, ou que telle séquence est un domaine de fixation d'un facteur,  [...]

Résultats | Dossier

Cette étude permettra de confirmer l'action de la chélérythrine sur la protéine kinase C. Le ligand marqué qui est utilisé est le phorbol-12,13-dibutyrate tritié, son site de fixation est le même que celui du PMA, c'est à dire sur celui du domaine régulateur de l'enzyme.  [...] fig. 32. Inhibition de la fixation du 3H PDB avec la protéine kinase C par la chélérythrine (n=6, * significativement différent de la référence pour p.  [...]

[Divers] [biologie du developpement] développement des membres

TBX. protéines portant le domaine T (T-Box). Il s'agit d'un domaine de 180 acides aminés se fixant sur la moitié d'un domaine palindromique.(5'-AATTTCACACCT AGGTGTGAAATT-3'). Le mode de fixation est original en plusieurs aspects. Le premier est qu'il intéresse le grand et le petit sillon de l'ADN.  [...] Le mode de fixation est original en plusieurs aspects. Le premier est qu'il intéresse le grand et le petit sillon de l'ADN. Mais la grosse originalité est qu'une hélice de cette protéine s'enfonce dans le petit sillon qu'elle élargit sans pour autant dénaturer l'ADN.  [...]

[Biologie Moléculaire] Complexe RISC et ARNi

Cette protéine possède deux domaines, respectivement appelés PAZ et Piwi, qui permettent la fixation du microARN ou du siARN au sein du complexe.  [...] Je sais pas pourquoi tous le monde fait le raisonnement enzyme -. protéine. Ya pas que ça tout de même, les ribozymes ont leur site actif constitués d'acides nucléiques.  [...]

Interaction ligand-protéine

En enzymologie que veulent dire les notions de sites équivalents et indépendants.   [...] Cela veut dire que la fixation d'un ligand sur un site de fixation d'une protéine en comportant plusieurs ne modifie pas la fixation d'autres ligands sur les sites de fixation voisins.  [...]