• Santé - Domaine, Fixation, ADN

Fonction "DNA binding"

Dans un de mes devoirs, j'ai un gène sur lequel la fonction la plus représenté est la fonction DNA binding. Je dois expliquer à quoi correspond cette fonction. En regardant sur internet, j'ai cru comprendre qu'elle correspondait à l'homéodomaine en français ( c'est bien ça).  [...] L'homéodomaine correspond à une partie d'une protéine qui se fixe à l'ADN. Ainsi, l'homéobox d'un gène correspondra à ce domaine de fixation à l'ADN.  [...]

[Biologie Moléculaire] La molécule mystère - Page 9

Bonjoru alors voila je propose une protéine qui a été identifiée par la méthode de screening par yeast two-hybrid. Il s'agit d'un membre atypique de sa superfamille car ne possedant pas de site de fixation a l'ADN mais un domaine putatif fixant un ligand. Cette protéine est exprimée plutot de facon ubiquiste mais présente un grand intérêt pour des avancées vous concernant vous les mecs.  [...] alors IL12 est en effet une cytokine hétérodimérique avec une sous-unité p40 et une sous-unité p35. Elles se distinguent par le fait que p40 présente une homologie trèsimportante avec le domaine extracellulaire du recepteur à l'IL6tandis que p35 présente des séquences à IL6, G-CSF.  [...]

[Génétique] Retard sur gel

Ou alors comme tu dis un autre facteur de transcription à la place de la protéines couplé au FT. Mais dans ce cas dans les deux FT il y aurait un activateur et un inhibiteur car je vois pas l'intéret de 2 activateurs ou inhibiteurs si ils se marche dessus.   [...] en fait ici j'ai 2 sites de fixation sur l'adn c'est cela la méme protéine peux donc se fixer sur 2 sites différent sur l'adn ( à méme ou différente affinité bien sur).  [...]

[Biologie Moléculaire] Mode d'action des facteurs de transcription

Sans trop rentrer dans les détails, les facteurs de transcription sont capable de se fixer sur des zones spécifiques d'un promoteur d'un gène donné et d'aider la RNA pol a se fixer indirectement ou directement pour transcrire le gène.   [...] Petite précision, la fixation à l'ADN de fait par des domaines particuliers. Il y a différents domaines connus, par exemple doigt de zinc.  [...]

Gel Shift : problème avec la compétition

Ca ressemble a une fixation non specifique de ta proteine sur l'ADN. As tu fais un temoin de binding de ta proteine sur une sequence d'ADN non specifique (different de la competition).  [...] D'autres études ont montré que ma prot liait une séquence d'ADN X et que cette fixation était spécifique. J'ai reproduit ses manip avec ma séquence d'ADN Y pour savoir si il y avait également fixation. J'ai obtenu un retard sur gel similaire mais pour des quantités un peu supérieures de protéine.  [...]

[Biochimie] Réponse cellulaire (protéine stéroïde)

La réponse cellulaire est-elle la fixation du H/P r sur l'ADN ou le changement induit par la production de protéines spécifiques.  [...] Gardez en tête que ça n'a aucun intérêt d'essayer de faire une sorte de mécanisme général de signalisation cellulaire comme il semblerait que vous trouviez dans vos livres.   [...]

[Biologie Moléculaire] qPCR

Ce phénomène serait-il dû à une saturation du milieu réactionnel en Sybr Green, qui inhiberait la fixation correcte des molécules de Sybr Green sur les doubles brins d'ADN pendant l'établissement de la courbe de fusion.  [...] La fixation du SybrGreen sur la molécule d'ADN est en fait encore à l'heure actuelle assez peu connue, il y a des effets qu'on ne soupçonnait pas comme une préférence de site de fixation (S. Giglio, P.T. Monis, C.P. Saint, Demonstration of preferential binding of SYBR Green I to speciWc DNA fragments in real-time multiplex PCR, Nucleic Acids Res. 31 (2003) e136.).  [...]

technique du double hybride

Le principe repose sur l'utilisation d'un facteur de transcription avec deux domaines, un domaine de liaison à l'ADN et un domaine de transactivation.  [...] Si il y a interaction, il y aura reconstitution du facteur de transcription actif du fait de la proximité des domaines de liaison à l'ADN et du domaine de transactivation. Du coup le gène rapporteur sera activé.  [...]

[Biologie Moléculaire] La molécule mystère

Je suis une protéine transmembranaire ayant un domaine cytoplasmique type Myd88. Je fixe mes ligands qui sont les LPS des bactéries gram - par un domaine riche en Leucine.  [...] Pas obligatoirement. Enfin pour le domaine riche en leucine oui c'est constitutif beaucoup ont également le domaine myd88 mais pas tous ne fixent des LPS bactériens, certains sont spécifique de bactéries gram + ou de composant viraux.  [...]

récepteurs nucléaires et hormones thyroidiennes

Pour ce qui est des alpha, beta... Ce sont des formes différentes des récepteurs. semblables par l'architecture, le site de liaison à l'ADN, mais de petites différences pour la force de fixation à l'ADN notament. Ainsi on trouve trois monomères pour RAR.  [...] alpha, beta et gamma, de même pour RXR, dont la force de fixation à l'ADN est la plus importante pour gamma, un peu moins pour beta, un peu moins pour alpha.  [...]