• Santé - Distance, Génétique, Marqueurs

[Génétique] Notion de distance génétique

Il s'agit d'une question de génétique formelle. Pour calculer la distance génétique entre deux gènes (deux marqueurs chromosomiques), il faut être en situation de pouvoir calculer la probabilité d'une recombinaison entre ces deux gènes. Chez différents modèles génétiques (drosophile, Arabidopsis, souris) on doit croiser des individus double-hétérozygotes (A/a B/b) (parent P) avec des individus double homozygotes récessifs (a/a b/b) (parent P') (situation appelée Test Cross).  [...] (Si éloignés qu'il y a tellement de crossing-over entre les deux gènes, qu'il y autant de chance d'obtenir un gamète recombiné qu'un gamète parental.) Plus la distance calculée est grande, plus elle est surestimée. En calculant de petites distances entre deux marqueurs, puis deux autres et ainsi de suite, de proche en proche, on peut, par addition, calculer la distance génétique entre deux gènes très éloignés d'un même chromosome, voir entre tous les gènes, jusqu'à obtention d'une carte génétique complète.  [...]

les centiMorgans

J'ai bien compri pourquoi on peut avoir 50cM maximum en distance génétique. Par contre, puisque il semble qu'un cM=1million de pb, est-ce que ça veut dire que la taille maximum d'un chromosome est de 50millions de pb Si je suis à côté de mes pompes dites- le moi que je parte sur une autre piste. Merci d'avance.  [...] Les centiMorgans représentent effectivement une distance génétique mais il ne s'agit pas vraiment de pb mais plutot de pourcentage de recombinaison. Lorsque tu étudies 2 marqueurs, ils peuvent se séparer lors de la méiose et cette probabilité que la séparation se produise augmente avec la distance qui sépare ces 2 marqueurs.  [...]

Cartographie génétique

je fais appel à vous car j'ai beaucoup de mal à comprendre mon cours sur la cartographie génétique.  [...] Alors voici ce que j'ai (ou je pense avoir ) compris. la cartographie de liaison consiste à insérer des marqueurs dans les chromosomes (marqueurs= séquence d'ADN qui a une localisation précise, et dont le gène est polymorphique), puis à faire des croisements et observer chez la descendance si les marqueurs sont transmis avec le gène que l'on étudie (et à quelle fréquence), on détermine ainsi la distance génétique entre les marqueurs respectifs et le gène en Cm.  [...]

marqueurs genetiques

Le gène marqueur doit entraîner un phénotype facilement repérable. Au hasard, si on obtient une certaine coloration chez le mutant, c'est que le gène d'interêt a bien été intégré.  [...] En cartographie, les marqueurs representent des bornes dans le genome. On peut calculer leur distance (physique ou genetique) avec des locus qu'on etudie.  [...]

crossing over

Parce que 2 marqueurs génétiques vont se retrouver sur la même chromatidebien qu'il y ait eu CO, donc pas gene conversion apparente, donc tu sous-estimes la distance génétique.  [...] 2. Je mentionnais le cas de double CO sur une distance genetique significative (plusieurs dizaines de kb) pour laquelle il n'y aura pas de conversion apparente (considerant 2 marqueurs eloignes de plusieurs dizaines de kb).  [...]

carte liaisons, génétique physique...

La def 2) est. Agencement relatif des marqueurs le long du ou des chromosomes AVEC connaissances de la distance des marqueurs (Cm).  [...] J'ajjoute que dans le cas de la carte physique, la molécule d'ADN est jalonnée de marqueurs moléculaires (exemple. microsatellite) et les distances sont exprimés en paire de base alors que la carte génétique c'est une représentation simplifiée du génome qui consiste à jalonner l'ensemblre des chromoomes par de points de repère les distance dans ce cas sont exprimées en centimorgan.  [...]

Au Mexique, les paysans cultivent la diversité du maïs

Ils se sont intéressés à deux types de diversité, la diversité phénotypique (celle des caractères morpho-anatomiques des plants) et la diversité génétique (observée par les marqueurs génétiques).  [...] , variaient suivant l'agriculteur. À l'échelle du génome, une grande homogénéité entre les populations de maïs au sein d'un même village et, plus surprenant, entre villages distants, a été mise en évidence par les marqueurs génétiques, ce qui signifie que l'ensemble des variétés locales possède une base génétique commune.  [...]

[Biologie Moléculaire] diversité génétique et marqueurs biochimiques

[Biologie Moléculaire] diversité génétique et marqueurs biochimiques.  [...] salut à tous, je travaille sur l'éstimation de la diversité génétique du genre rétama, par marqueurs biochimique (protéines et ezymes) je manque de documentation.....si quelqu'un peu m'aider je serai reconnaissante.  [...]

Génétique et probabilité de recombinaison(cartographie)

Bonsoir tout le monde, il y a une notion en génétique que j'arrive pas à assimiler, en fait ça concerne la carte génétique, alors je sais que cette carte établit les distances génétiques = statistiques entre les genes et les marqueurs génétique en se basant sur la fréquence de recombinaison qu'on appelle teta, deja ici j'ai une petite confusion est ce que teta= fréquence de recombinaison= probabilité de recombinaison (c'est la meme chose ), et on utilise ce concept pour calculer le lod score, et pour ce faire il faut calculer les probabilités et ici je beugue franchement, est ce que la probabilité de non recombinaison par exemple est égale à 1-teta ou c'est égale à 1-teta le tout sur deux parce que dans chaque source je trouve un calcul different.  [...] j'espere avoir bien transmis ma question et j'espere avoir une réponse, parce que cette confusion me pose beaucoup de problemes dans la résolution des exercices de génétique. merci d'avance.  [...]

[Génétique] marqueurs génétiques et groupe ethnique

je n'ai pas travaillé sur la génétique des populations humaines mais pour d'autres organismes, en général un seul marqueur ne permet pas de séparer parfaitement les sous-populations. Ce n'est que par la prise en compte simultanée de plusieurs marqueurs qu'on y arrive, et encore y a-t-il souvent des individus mal classés.  [...] Ce que j'ai du mal à comprendre, c'est le groupe assez distinct que semblent constituer les habitants du continent américain. Peux-tu préciser de quelle(s) population(s) il s'agit ici Parce que j'imagine que la plupart des habitants de l'Amérique du Nord, plus une grande partie de ceux de l'Amérique latine, devraient avoir une assez grande proximité génétique avec les européens, puisqu'ils ont une origine commune qui remonte à peine à quelques siècles.  [...]