• Santé - Développement, Analyse, Données

Quel Master Bioinformatique choisir ?

J'aimerai savoir, selon vous, dois-je choisir un parcours orienté développement ou analyse de données (niveau embauche, et sachant que je viens d'une licence bio. facilité d'adaptation à l'informatique ). L'analyse de données proposés à Marseille et à Rennes me tentent beaucoup.  [...] Mais ils font aussi beaucoup d'analyse de données médicales en partenariat avec le pôle de néphrologie/urologie. Pour finir il y aussi une demande dans l'analyse d'image, notamment sur le développement d'embryon. Je suppose que le master est donc orienté vers ces thématiques (sauf l'analyse d'image bizarrement mais certains se perfectionnent en stage).  [...]

La pauvreté aurait un impact sur le développement du cerveau des enfants

Pour arriver à ces conclusions, les chercheurs ont analysé 823 clichés issus de l'imagerie par résonance magnétique ( IRM ) de 389 enfants et adolescents âgés de 4 à 22 ans. La collecte des données a commencé en novembre 2001 et a pris fin en août 2007. Les participants ont été sélectionnés en fonction d'une variété de facteurs soupçonnés d'affecter négativement le développement du cerveau.  [...] Avec les données recueillies, nous avons démontré que les enfants des ménages vivant en dessous du seuil de pauvreté fédéral présentaient un développement structurel atypique de plusieurs zones du cerveau, dont la matière grise, le lobe frontal, le lobe temporal et l'hippocampe, soulignent les responsables de l'étude.  [...]

[Génétique] J. Philippe Rushton

J'aimerai savoir si les différences physico-chimiques (taille du crane, durée de gestation, développement du squelette, taux hormonaux,...) indiquées dans le tableau sont réelles ou bien si elles sont dues à des biais méthodologiques (beaucoup de critiques m'ont l'air de porter sur le fait que Rushton compile des données en méta-analyse sans vraiment savoir d'où elles viennent et en les prenant toutes comme égales.  [...] De facto, extensive statistical analyses by Beals et al. showed that cranial size varies primarily with climatic zones (e.g., distance from the equator), not race. According to Beals et al., the correlations of brain size to race are spurious. smaller crania are found in warmer climates, irrespective of race.  [...]

Qu'est ce que la génomique ? | Dossier

Il s'agit du transcriptome. Le suffixe 'ome' a été rajouté à l'objet d'étude (les transcrits) pour indiquer que les études sont réalisées à haut débit. Parallèlement, le développement d'autres techniques automatisées autorisant des études à grande échelle des protéines a conduit à l'étude du protéome (c'est à dire de l'ensemble des protéines).  [...] ... c'est pourquoi, on parle de biologie intégrative. Cette dernière ne peut se développer sans un stockage raisonné et une analyse globale des données générées aux différents niveaux (transcript, protéines, physiologie). Ces étapes nécessitent le concours de la bio-informatique, autre nouvelle Science en expansion.  [...]

[Divers] Publications des biologistes du forum

Et voilà un de mes projets de post-doc qui a abouti dans Molecular Cell. Quand j'aurais un peu de temps, j'essaierais de l'expliquer un peu dans la rubrique vos publications/publications de votre équipe. Je pense que c'est un bon exemple du potentiel de la ré-analyse de données de ChIP-seq disponibles dans les bases de données...Voilà pour la petite histoire.  [...] Je pense que c'est un bon exemple du potentiel de la ré-analyse de données de ChIP-seq disponibles dans les bases de données.  [...]

Technologies, perspectives et enjeux de la nutrigénomique | Dossier

La nutrigénomique est une discipline en devenir. Son application à large échelle dépendra de l'amélioration des outils technologiques permettant de gérer la complexité à la fois de l'alimentation (composition qualitative et quantitative en ingrédients) et des logiciels pour le traitement des données et l'analyse intégrée des résultats.  [...] Le développement futur de chacun des outils omiques sur lesquels s'appuie la génomique nutritionnelle offre de multiples approches d'identification et d'analyse des mécanismes moléculaires à différents niveaux, caractérisant de nouvelles interactions entre génome et nutrition.  [...]

Hausse constante de l'espérance de vie

Les espérances de vie augmentent à un taux remarquablement constant dans les pays développés et, si cette tendance se poursuit, les chercheurs prédisent une moyenne d'espérance de vie de 100 ans dans six décennies.  [...] Telles sont les conclusions d'une nouvelle étude publiée dans la revue Science du 10 mai 2002. James W. Vaupel, de la Duke University, et Jim Oeppen, de la Cambridge University, les co-auteurs de l'étude, ont analysé les données concernant la longévité dans certains pays développés, incluant le Japon, l'Australie, la Norvège, la Suède, la Suisse, les Etats-Unis, les Pays-Bas et l'Islande.  [...]

[Génétique] Influence d'une mutation sur la synthese d'une protéine.

Si le gène possède un nucléotide T au lieu de A en position 15, alors le codon TTA originel formant l'asparagine va devenir TTT qui va etre transcrit en AAA, ce qui formera l'acide aminé Lysine. Cela aura pour cause des disfonctionnements et des maladies ( par exemple la myopathie de Duchenne mentionnée ci-dessus.).   [...] et puis la redaction c'est pas top ( DSL). en bio, il faut faire une intro, un developpement et une conclusion, et montrer un esprit scientifique c'est a dire donner le protocole, les resultats, une analyse puis un bilan partiel pour chaque sous partie. Ca doit être asssez long, et n'hésite pas a mettre un plan apparent, les profs adoooooorent ça.  [...]

[Divers] Données brutes pour projet statistique

qqu'un aurait des données brutes pour un projet d'analyse de données.  [...] Un truc assez important, pas juste de quoi faire un Student ou une ANOVA.   [...]

Science citoyenne : un jeu vidéo pour aider la recherche sur le cancer

Le but du jeu est assez simple. tracer sa route dans des champs d' astéroïdes afin de récolter le Graal appelé élément alpha. Mais ces champs sont en réalité des données génétiques provenant de 2.000 patientes atteintes de cancer du sein. Le joueur doit viser les régions les plus denses et y plonger. C'est la trajectoire suivie qui sera analysée.  [...] Aux commandes du vaisseau spatial, le joueur doit suivre les zones les plus denses pour récupérer l'élément alpha. Ce faisant, il décrit une trajectoire qui relie les points les plus intéressants du génome à analyser. D'après les concepteurs, ce travail préparatoire, transmis à des serveurs par Internet, faciliterait grandement le décryptage des milliards de données recueillies chez les patientes de l'étude. Cancer Research UK.  [...]