• Santé - Detection, Fragments, ADN

[Microbiologie] Hybridation

Après, si l'expérience est un Southern-Blot (ou équivalent), la fréquence de coupure de l'ADN par l'enzyme doit être assez élevé pour que le profil de digestion soit lisse. Dans mon ancien labo, on utilisait des enzymes classique de type EcoRV, HindIII... Le point difficile étant que la zone de référence (pour toi le 16s) et la zone à tester (le gène de résistance) doivent toujours être détecté (et donc qu'il ne faut pas couper au niveau de la sonde - qui n'est généralement pas excessivement grande -500pb pour moi).  [...] Le site de reconnaissance est super long (je trouve que 27-28 nucléotides de détection, non dégénéré, c'est long - à comparer avec les 6-10 normalement), ce qui signifie une fréquence de coupe de l'ADN faible (donc de plus gros fragments).  [...]

[Génétique] Principe de la technique RFLP

SVP si quelqu'un pourrai m'expliquer le principe de la technique RFLP ( le polymorphisme de longueur des fragments de restriction de l'ADN ), et comment il sert à l'etablissement des caryotypes ainsi que la detection de certaines maladies génétiques.  [...] Si une mutation intervient à cet endroit précis de reconnaissance de l'enzyme (par exemple un GTTC au lieu de GATC), il n'y aura plus de coupure, le gène B par exemple ne donnera que 4 fragment dont un sera beaucoup plus long. C'est ce qu'on appelle un RFLP ( restriction fragment lenght polymorphisme ou en français polymorphisme de longueur des fragments de restriction).  [...]

[Biotechnologie] Principe de la PCR

Le produit d'une PCR est constitué d'un ou de plusieurs fragments d'ADN (la ou les séquences d'intérêt). La détection et l'analyse des produits.  [...] La détection des fragments est réalisée par une diode laser. Cela n'est possible que si la PCR est réalisée avec des amorces couplées à des.  [...]

[Génétique] polymophisme(probleme)

salut les amis j éspére que vous allez bien,voilà j ai un sérieux probleme,je suis en période de controles et j ai besoin de vous.   [...] en polymorphisme génétique,la détection d un polymorphisme peut se faire avec RFLP bi-allélique, et le prof a parlé de sites polymorphes internes/sites polymorphes externes se trouvant sur les fragments d ADN analysés et hybridés à des sondes.que signifie ces deux expressions.  [...]

la taq polymérase????

La PCR est utilisée dans des domaines variés. diagnostic des maladies génétiques, détection des infections virales, médecine prédictive et recherche des empreintes génétiques. Elle pourrait servir à copier en de nombreux exemplaires des fragments d'ADN de mammouth congelés vieux de 40 000 ans ou de restes humains de 7500 ans trouvés dans une tourbière, milieu où la décomposition de la matière organique est très lente.  [...] cette méthode, la PCR est également appelée amplification de fragment d'ADN, car elle permet d'obtenir après plusieurs cycles à température variablement hautes, à cause de dénaturation succééssives, un grand nombre de fragments identiques à celui de départ, ce qui revient au résultat d'un clonage avec moins d'inconvénients.  [...]

applications de la PCR

La detection de fragments d'ADN par PCR est certes tres utile et novateur (enfin 20 ans quand meme) mais ne represente qu'une infime partie de ce que cette technique permet.  [...] Mais en provoquer, non je ne vois pas. Etant donné que la PCR sert à amplifier un fragment d'ADN, il s'agit simplement d'obtenir à la fin une quantité beaucoup plus grande de l'ADN initial, donc par définition (et en dehors des amplifications parasites et des contaminations), on aura exactement le même ADN qu'au départ.  [...]

[Biologie Moléculaire] seuil de détection des fragments d'ADN

Le gel d'agarose permet de séparer, en gros, des fragments entre 0,5 et 20 kb en fonction de la concentration en agarose (pour des fragments de taille supérieure on peut utiliser l'électrophorèse en champ pulsé).  [...] Un seuil de détection signifie qu'il en faut, en quantité, au moins autant que le seuil pour pouvoir le détecter. Une résolution correspond à l'intervalle nécessaire pour pouvoir distinguer deux choses comme étant différentes.  [...]

[Génétique] Détection de SNP par TaqMan sur de l’ADN génomique problème?

Je dois déterminer des SNP par PCR TaqMan. Je pars de tissus de tumeur qui on eu un traitement peu adéquat et donc mon ADN est assez dégradé. Le protocole (TaqMan SNP Genotyping Assays de AB) conseil de ne pas utiliser plus de 20ng d'ADN par puits. Mais j ai une post doc audessus de moi qui me force (stagiaire) à utiliser bien plus (de 20 a 100X plus).  [...] La PCR n'a pas fonctionné. Mais elle me dit que je dois utiliser bien plus de matériel car mon ADN est dégradé et envisage une purification par extraction sur gel pour ne conserver que les fragment ADN les plus importants.  [...]

Un capteur électrochimique pour repérer les virus

Grâce à la spectroscopie d'impédance électrochimique, qui mesure les changements électriques au niveau du capteur, le système détecte spécifiquement le sérotype Ad5 à partir d'une concentration de 10 3 particules virales par millilitre.  [...] Novel impedimetric immunosensor for the detection and quantitation of Adenovirus using reduced antibody fragments immobilized onto a conducting copolymer surface.  [...]

[Biochimie] PCR: a quoi servent les differents elements

Enfin les amorces servent a amplifier un fragment d'ADN spécifique dû a la complémentarité de l'amorce sur une région de la matrice et sert à l'enzyme pour démarrer son activité de polymérization. Sans amorce l'enzyme ne sait pas démarrer une polymérization.  [...] Sinon tu peux faire des PCR classiques où la détection se fait sur Gel d'agarose/acryl(suivant les fragments) en utilisant des intercalants.  [...]