• Santé - Demande, Protéine, Acides aminés

[Biochimie] Déterminer la charge d'une protéine

A partir d'une séquence d'acides aminés d'une protéine (108 acide aminés) on me demande tout d'abord le nombre de résidus acides et basiques. J'ai donc compter le nombre d'acides aminés basiques et acides. j'en trouve 22 acides et 22 basiques.  [...] Ensuite, on me demande quelle est la charge moyenne de la protéine à pH physiologique.  [...]

[Biologie Moléculaire] emplacement de l'ADN polymérase

On demande de repérer l'emplacement de l'ADN polymérase en sachant qu'il s'agit d'une protéine et que les protéines sont des chaines d'acides aminés.  [...] le ruban bleu correspond à l'ADN polymérase...on demande de repérer l'emplacement de l'ADN polymérase sachant qu'il s'agit d'une protéine et que les protéines sont des chaines d'acides aminés. il faut rédiger un texte argumenté...je ne sais que rédiger.  [...]

[Biochimie] migration des AA proline glutamine

Je me demande si quelqu'un connait l'influence des acides aminés proline et glutamine sur la migration de protéine en condition dénaturante.  [...] En effet j'ai fais migré une protéine composée de ces deux acides aminés, et au lieu d'arriver à la taille attendue de 30kDa, elle arrive à 40kDa. Je sais qu'avec les western c'est rare de trouver la taille attendue, sans parler des modifications post-traductionnelles possibles.  [...]

Pourquoi les galactomannanes sont-ils acaloriques?

Et autre petite question, on me demande, pour une même séquence en acides aminés, si le caractère hydrophile est plus marqué pour une protéine non glycosylée ou pour une glycoprotéine. j'ai envie de dire que ça dépend des aa considérés, puisque certains ont un radical polaire, d'autres non.  [...] .mais peut-être que dans tous les cas, de part les nombreuses fonctions OH, un ose sera toujours plus hydrophile que la chaîne polaire d'un aa.   [...]

[Biochimie] Acides aminés capables de créer des liaisons électrostatiques

Certaines protéines interagissant ensemble peuvent être dissociées par l'ajout de sel (en solution). J'imagine que les ions de ce sel solvatés en solution peuvent interagir avec certains acides aminés afin d'empêcher l'interaction protéine 1 protéine 2 (donc une interaction électrostatique) mais je me demande quels acides aminés sont capables de réaliser ces types de liaisons.  [...] Ne pas oublier aussi que les protéines n'interagissent pas uniquement au moyen de la chaine latérale de leurs acides aminés. Le squelette peptidique d'une protéine, avec ses fonctions amides, peut également établir des liaisons H avec d'autres protéines.  [...]

[Biologie Moléculaire] Les biomolécules Première st2s

elle se fait entre la fonction acide carboxylique (COOH ou COO-) du premier acide aminé et la fonction amine (NH2 ou NH3+) du second acide aminé.  [...] pour les protéines et peptides, tu représentes les acides aminés sous forme de ronds qui sont reliés par des traits représentant les liaisons peptidique. Par contre, je suis étonnée qu'on te demande de schématiser ou de connaître les liaisons dans une hétéroprotéine (une hétéroprotéine est une protéine qui est liée à de petites chaînes glucidiques par exemple).  [...]

[Génétique] Gène plus court?

Je suis en 3ème année de licence biochimie et j'ai des séquences protéiques et nucléotidiques d'un gène chez le rat et l'Homme à comparer. Je trouve (via NCBI) que la protéine du rat est plus courte de 13 acides aminés, soit 39 nucléotides. On me demande d'expliquer pourquoi il y a un tel gap dans le gène du rat et je sèche.  [...] Les deux protéines ont la même fonction chez les deux organismes et la région manquante n'est pas la région importante puisque ce sont les régions N et C terminales qui doivent être conservées pour avoir une protéine active. Si je regarde la séquence nucléotidique, il ne manque pas 39 nucléotides.  [...]

[Biochimie] Protéine hydrophile ou hydrophobe ?

Les acides aminés polaires ou chargés vont donc être mis à l'extérieur de la protéine si les conditions aux pourtours de la protéine sont hydrophiles. Même constat pour les acides aminés hydrophobes (ex des protéines membranaires. les acides aminés hydrophobes encapsulent les polaires/chargés à l'intérieur de l'enzyme, car la membrane est ultra hydrophobe).  [...] Exemple. Dans le collagène, on compte beaucoup d'acides aminés apolaires (dont un tiers de résidus de glycine et un quart de proline) qui forment les hélices alpha. Pourtant c'est une protéine commune du liquide interstitiel - principalement constitué par H 2 O.  [...]

[Biochimie] Modifications post traductionnelles et électrophorèse !

C'est possible mais ça fait une sacrée phosphorylation. Mais je suis d'accord avec toi que le SDS recouvre la protéine (je n'y ai plus pensé à ça... ) donc mon hypothèse est un peu foireuse, la tienne étant la plus probable. En plus sur 1863 acides aminés, c'est possible, les phosphorylations de cette protéine démontrées actuellement étant déjà une bonne dizaine, sans compter celles qui restent sans doute à découvrir.  [...] Bizarrement cette explication me convient mieux, mais je la trouve encore un peu approximative... Le phosphate, malgré sa taille imposante doit pouvoir être comparable à une chaine latérale encombrante comme la lysine par exemple. Dans ce cas, la migration électrophorétique tiendrait compte aussi de la composition en acide aminé et, pour un même poids moléculaire, une protéine ayant une composition forte en acide aminés à chaîne latérale encombrante migrerait moins vite qu'une protéine à composition forte en acides aminés à chaine latérale peu encombrante.  [...]

Polypeptide végétal

pas vraiment, en fait on parle de protéine lorsqu'on parle d'une chaine d'environ 100 acides aminés, en dessous ce sont des peptides tout simplement.  [...] Bon, alors je suis en attente d'une réponse de la part d'une Nutritionniste à qui j'ai posé la question. Elle a dit qu'à sa connaissance il n'y avait que des protéines dans les végétaux, mais m'a demandé ou j'avais lu qu'il y avait des acides aminés simples (c'est dans un livre de nutrition anglophone.  [...]