• Santé - Coupure, Génome, Enzymes, Restriction

[Biologie Moléculaire] Prédiction de coupure d'un génome par des enzymes de restriction

Un peu moins flexible quand au choix des génomes ou séquence et dans le choix des enzymes mais remplit bien son rôle, il m'a donné un début de réponse.  [...] Je viens de tester Webcutter, il n'arrive pas à utiliser le numéro d'accès Genbank de mon génome. Ca risque d'être compliqué de tester gène par gène sans parler de l'interprétation des résultats. Merci quand même, je le garde pour les gènes, il est vraiment complet à ce niveau là.  [...]

[Biochimie] Commentaires et analyses d'une photo d'électrophorèse sur gel d'agarose après PCR

La seule chose que je pense pouvoir dire, est le fait que l'on voit apparaître une bande pour le contrôle négatif. Je pense donc que les amorces ont du trouvé le gène recherché sur l'ADN (qui est ici le gène ATPase) et donc un site pour se fixer.   [...] Le but du TP est. caractérisations de différents génotypes de tabac et recherche du génotype d'une espèce inconnue par étude du gène d'une enzyme chloroplastique, l'ATPase, par coupure par des enzymes de restriction.  [...]

[Biologie Moléculaire] enzyme de restriction pourquoi elle ne clive pas tout les ADNs ?

Tu sais que les enzymes de restriction ne clivent que si elles reconnaissent un site spécifique. S'il n'y a pas coupure, cela peut être à cause de deux raisons.  [...] _ Ou alors, le motif est bien là mais il est modifié chimiquement et n'est donc pas accessible à l'enzyme. Par exemple l'enzyme ECORI vient de la bactérie E. coli et coupe de cette façon. G/AATTC. Ce motif existe pourtant dans l'ADN de cette bactérie. Pour éviter qu'elle ne coupe son propre ADN, les motifs GAATTC de E.  [...]

[Biologie Moléculaire] Réparation mutation, structure Holliday

Lors de l'analyse des allèles dans une famille dans laquelle on cherche la présence d'un fragment connu, On peut utiliser 2 techniques. RFLP ou Carte de restriction, bien que je les connaisse en gros, je ne comprends pas bien pourquoi ce serait plus rapide (ou simple) avec les enzymes de restriction.  [...] La plupart des cartes de restrictions sont de petite taille (haute résolution), même si l'on peut construire des cartes de grande taille à l'aide d'enzymes de restriction dont les sites de coupure sont rares.  [...]

[Biologie Moléculaire] La carte de restriction

disons que nous avons une molécule de l'ADN linéaire de 15 kpb la digestion de celui-ci par trois enzymes nous donne quelque chose comme ça.  [...] La coupure EcoRI permet d'obtenir deux fragments, donc il y a un seul site EcoRI. C'est concordant avec coupure par deux enzymes qui génère 3 fragments (un site de restriction pour chaque enzyme).  [...]

[Biologie Moléculaire] Site de restriction

1- ecrit un site de restriction sur le papier enzyme regarde ou l'enzyme va couper, et essaye de trouver tous les moyens de couper. tu vas vite t'appercevoir qu'il y a deux grandes familles de coupures.  [...] Chaque outil de découpe représente une enzyme de restriction différente et chaque endroit où la coupure est plus facile devrait représenter le site de restriction spécifique à l'enzyme.  [...]

[Biochimie] nucléase

Si tu coupes avec deux enzymes différentes, les extrémités générées ne seront pas complémentaires l'une à l'autre puisque les enzymes vont couper différemment (le site de restriction n'est pas le même et le type de coupure non plus).  [...] Tu commences par ouvrir ton plasmide avec une enzyme de restriction, tu fais agir ta phosphatase, et tu peux ensuite tranquillement faire ta réaction de ligation entre ton transgène et le plasmide (et ainsi éviter que ton plasmide ne se referme sur lui-même et d'avoir bossé pour rien).  [...]

Adn

Le site de coupure de l,enzyme de restriction Acc III est.TCCGGA en position 1.  [...] Le site de coupure de l,enzyme de restriction Hap II est.CCGG en position 1.  [...]

[Biologie Moléculaire] pourquoi parle-t'on d'effet "star"

On nomme l'effet star le pourcentage de coupures non canoniques (erronées) réalisées par une enzyme de restriction (EcoR1, dont la séquence canonique est AATT) augmente linéairement avec la pression osmotique. Ceci est interprèté comme la nécessité de l'expulsion de l'eau interfaciale du domaine de liaison enzyme-ADN.  [...] Donc si j'ai bien compris le spectre de restriction d'une certaine étoile (de mer je suppose) donc un profil ressemblant au coupure aspécifique surement de l'enzyme de restriction avec laquel l'effet star é été observé en 1 er c'est bien sa.  [...]

Enzyme de restriction

Les enzymes de restriction Bam HI et Pst I clivent respectivement les séquences suivantes. 5' G-GATCC 3' et 5' CTGCA-G 3' (- indique le lieu de coupure).  [...] Tu as oublié l'autre partie du site de restriction. De plus, La polymérase va remplir le site pas dégrader les nucleotides simple brin.  [...]