• Santé - Consensus, Boîte, Séquences

[Biologie Moléculaire] la transcription et la traduction à partir d'une séquence en bases

Donc c'est bien le brin du bas qui est copié par l'ARN polymérase (brin du bas = brin matrice), vu que le recopiage se fait par complémentarité, l'ARNm ainsi synthétisé correspond à la séquence du brin du haut (brin du haut = brin codant). Par contre, ne vous focaliser pas sur la recherche d'une séquence consensus comme la boite TATA, cela ajoute une complexité inutile pour répondre à cet exercice.  [...] Une petite remarque, la séquence TATAA qui est le meilleur consensus de la boite TATA est communément retrouvé dans les séquences d'ADN, cela ne veut pas forcément dire que c'est une TATA box.  [...]

[Biochimie] ARNm Bactérien.

La boite TATAA par exemple est présente dans ces deux domaines. Le problème des séquences consensus est qu'elles sont rarement identiques au consensus, il faut donc les identifier par ressemblance.  [...] Je ne connais pas ton niveau mais en principe, on n'apprend pas plus de 3 séquences consensus sur un gène eucaryote. la TATAA Box, le terminateur de transcription (qui est plutôt une structure secondaire repérée par ses répétitions de G et C complémentaires) et la séquence de polyadénylation.  [...]

[Biologie Moléculaire] Adn

Ensuite pour ta seconde question, je ne comprends pas trop cette idée de condensation, dans la plupart des cas, un gène n'est pas exprimé dans un type cellulaire donnée car ce dernier dne possède pas le récepteur nucléaire capable de se lier au promoteur dudit gène (et donc dans ce cas ce type cellulaire ne produira jamais la protéine codée par ce gène).   [...] Non pas exactement, lors de la transcription, on obtient un pré-ARNm. Ce pré-ARNm est alors épissé, on a alors des fragments d'ARNm qui sont éliminés, que l'on nomme intron et des fragments qui sont garder, que l'on nomme exon, formant l'ARNm mature. Du point de vue séquence, la zone de bordure exon-intron et intron-exon est formée par des séquences consensus assez conservée et les introns possèdent ce que l'on appelle une boite de branchement.  [...]

Génétique

c- des séquences consensus Je ne vois pas ce qu'ils veulent dire par consensus, peut être qu'ils insinuent que les scientifiques se sont mis d'accord sur des séquences précises, mais bon là encore je ne sais pas.  [...] Le promoteur est constitué de courtes séquences conservées d'une unité de transcription à l'autre et appelées séquences consensus.  [...]

Analyse chez Arabidopsis thaliana | Dossier

Le principe de la fenêtre flottante est de déplacer le long de la séquence à analyser une règle de lon-gueur fixe afin de déterminer la concentration des séquences qui permettent de déterminer celle consensus dans cette longueur. En prenant une longueur de 50 bases, le programme sliding window donne la figure 6, montrant ainsi la présence de boîtes, plus ou moins importantes, dont la localisa-tion est essentiellement entre -1000 et -2000 et de plus recouvre les positions déterminées par l'analyse avec oligo-analysis.  [...] La suite de programme RSA tools aboutit à la définition d'une séquence consensus sur l'ensemble des promoteurs considérés. Classé par ordre d'occurrences significatives pour Oligo-analysis, la plus élevée, 4,1, se retrouve dans toutes les séquences et correspond à TGCAGC GCAGC TTGAC TGACG.  [...]

[Génétique] promoteur??

Cette séquence -35 présente un motif de six bases bien conservées. TTGACA. Enfin, à environ 10 nucléotides en amont de l'origine de la transcription, on retrouve un motif TATAAT. Cette séquence dite séquence -10 est appelée également boîte de PRIBNOW.  [...] une séquence de six nucléotides riche en A et T. La séquence dite consensus (statistiquement la plus rencontrée) est TATAAA. Cette boîte fixe un facteur général de transcription appelé TFIID (TF. facteur de transcription. II pour l'ARN polymérase II). Ce facteur est absolument nécessaire pour l'initiation de la transcription.  [...]

[Biologie Moléculaire] Transcription ?

Tu ne peux pas le savoir sans plus de renseignements. Il te faut connaitre la séquence de l'ARNm transcrit à partir de cette séquence double brin pour savoir quel est le brin transcrit. Ou alors il te faut connaitre la séquence de la protéine codée, avec le code génétique tu retrouves la séquences de l'ARNm et de là le brin transcrit.  [...] sur le brin 5' -. 3' il y a également la séquence consensus -35 et même si il y a la boite de Pribnnow en -10 (qui n'a que TATA au lieu de TATAAT) la distance est peu être un peu forte entre les deux pour que ce soit un promoteur et le concencus TATAAT est moins respecté que sur l'autre brin.  [...]

[Biologie Moléculaire] Mutation site d'épissage?

Voilà on m'a dit que les mutations au niveau du site d'épissage étaient délétères pour l'organisme mais je ne comprends pas en quoi elles sont délétères alors qu'avant la sortie de l'ARN mature dans le cytoplasme celui-ci est épissé donc l'intron est enlevé Donc on s'en fout un peu qu'il y ait une mutation au niveau du site d'épissage non.   [...] Et pour expliciter mon propos, je dirais. Syndrome des lymphocytes nus, ou déficit en CMH de classe II, dû, justement, à une mutation affectant un site d'épissage du gène codant un coactivateur, l'empêchant d'être recruté sur le enhancer d'une famille de gènes cibles et par conséquent d'activer la transcription de ces gènes par acétylation des histones.  [...]

[Microbiologie] Mise en évidence système SOS bactéries

Pour répondre à MaliciaR, je sais que le système SOS est un système de réparation mutagène de l'ADN. il est utilisé en dernier recours, lorsque la survie de la cellule est engagée. Il permet de faire au moins pire. réparer l'ADN de manière un peu hasardeuse pour sauver la bactérie, ce qui entraine des mutations mais de conséquences plus benignes.  [...] Je suis pas sur que l'on voit d'autres espèces de bactéries assez rapidement..puisque je suppose que toutes ces infos c'est pour le TIPE sur l'information.Forcément un TIPE ressemble plus a un TPE qu'à un projet de recherche, surtout les expériences sur l'adn (qui est pourtant la première chose a laquelle on pense en lisant information ) étant donné les moyens qu'on a en lycée.   [...]

Identification d'une protéine

J'ai une séquence d'ADN et je dois trouver quelle protéine elle code. J'ai donc traduit cette séquence en AA grace à un logiciel, puis j'ai cherché des homologies avec d'autres protéines sur cette base de données. http.//www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST.  [...] Maintenant, si tu regardes les séquences consensus de ces domaines par rapport à la séquence de ta prot, tu peut voir que en gros, le consensus du deuxieme domaine contient en partie le consensus du premier domaine... Donc là, il va falloir voir quels résultats tu obtiens avec les allignements pour ne pas faire d'erreurs. Clique sur Format.  [...]