• Santé - Concentration, Agent, Protéines

[Biochimie] refolding

Le chlorure de guanidinium à forte concentration (6M) a souvent un rôle dénaturant sur les protéines. Mais est-il possible, à faible concentration (0,5M) que celui-ci participe au contraire au repliement de la protéine.  [...] Je pense que meme a faible concentration c'est un agent dénaturant des protéines. Il y a peu de chance qu'il permette a ta protéine de se replier correctement.  [...]

[Biochimie] cristallographie

Comme la goutte est faite d'un mélange de la solution de protéine et du réservoir, la concentration en agent précipitant y est donc plus faible. Aussi, de l'eau va s'évaporer de la goutte jusqu'à ce que la concentration en agent précipitant dans la goutte soit égale à celle du réservoir.  [...] La goutte va donc progressivement se concentrer, la protéine va franchir sa limite de solubilité et va précipiter, idéalement de manière ordonnée sous la forme d'un cristal.  [...]

Comment les cellules arrivent à s'adapter?

Je reprend avec un exemple car j'ai du mal à exposer le sujet. une cellules sauvage exposée à un agent stressant à faible concentration (donc c'est cet agent qui va induire la cascade de transduction du signal) exple un agent oxydant comme l'eau oxygénée,O2-.  [...] ., en réponse la cellule diminue la perméabilité de sa membrane face à cet agent (en réponse aussi elles fabriquent des anti oxydant.vitamine E, b-carotene ou des proteines qui reduisent les ROS.catalases,SOD..), on recultive ces cellules en milieu normal apres plusieurs cycles de division donc plusieurs générations on cultive ces cellules filles en milieu stréssé et on s'aperçoit qu'elles resistent mieux car la perméabilité de leur membrane face à l'oxydant est faible.  [...]

[Biochimie] Criblage de thermostabilité des protéines par fluorescence

Dans différents tampons (pH,concentration..) j'ai effectué un test de thermostabilité de la protéine. L'utilisation d'un agent fluorescent. le SYPRO orange permet de suivre la fluorescence.  [...] je ne pense pas que la température ait un effet sur la mobilité electronique et donc la fluorescence. L'explication de allan me parait plausible. diminution de la capacité d'interférence du sypro avec les protéines.  [...]

[Biochimie] Cross-linking pour mettre en évidence un état dimérique

Cependant, je n'arrive pas à comprendre comment l'on peut réellement conclure à une dimérisation. Cet agent, l'EDC, ne permet-il pas le couplage peptidique Ne suffirait t-il pas d'un contact rapide entre deux protéines en solution pour les coupler, alors qu'elles ne se dimériserait pas.  [...] J'ai penser que comme l'EDC est un agent de couplage dit 'zero length que les protéines devrait vraiment être proches pour que la réaction puisse se faire.  [...]

Sds

s'il vous plait pour le sodium dodecyl sulfate(sds), est ce que c'est un agent dénaturants qui dissocie les sous unités d'une macromolécule ou bien il ne fait que charger la molécule négativement pour qu'elle puisse migrer dans le sens - +,  [...] Ce n'est pas un agent denaturant. Les ponts dissulfures sont conserves et il ne permet que de charger les proteines. En revanche, il dissocie les interactions faibles.  [...]

le prion PrPsc

nous avons vu un cours aujourd'hui trés interessant mais néanmmoins incomplet en ce qui concerne le prion, autrement dit la protéine PrPsc, analogue de structure primaire de la protéine PrPc. On ne connait pas exactement le rôle de cette dernière mais saurait on de quelle manière la protéine PrPsc entraine une vacuolisation au niveau de l'encéphale De quelle manière entraine t elle l'apoptose des neurones à ce niveau et la pullulation des astrocytes De plus, lors d'une inoculation par voie digestive comment cette protéine, malgré sa résistance exceptionnelle aux PK peut elle traverser la muqueuse intestinale et attérir dans le SNC et enfin, quel traitement permettrait de reconfigurer des feuillets plissés béta en hélice alpha.  [...] Ces proteines nécessitent en general de l'energie ( souvent procurée par un systeme ATPase lent ) et peuvent linéariser des proteines et modifier leur conformation. On peut citer notemment deux exemples. la chaperoninne calnexine qui est un systeme de controle d'une bonne glycosylation des proteines et la hsp 70 qui permet de lineriser les proteines pour leur passage au travers la membrane de la mitochondrie.  [...]

[Biologie Moléculaire] Cross-linking

bjr, svp j'aimerai savoir à quoi servent le KCl et le PBS dans une réaction de cross-linking ou je regarde une interaction entre 2 protéines. sachant que les tampons de mes protéines contiennent du KCl. mon mixte comprend. les protéines, du PBS 10, le BMH( agent pontant) le KCl et H2O.  [...] Par contre, comme il s'agit d'un pontage chimique, il faut éviter de ponter les protéines si elles n'intéragissent pas réellement, c'est à dire +/- fortement (sinon on a un mega complexe.). Avec le KCl on augmente la force ionique (effet chaotropique), et donc les interaction aspécifiques entre les 2 protéines sont diminuées.  [...]

Ciblage de cellules de mamifères

En fait c'est possible. Un ami à moi a déposé un brevet sur une technique de transfection de protéines par pseudoparticule virale.  [...] Dans le détail, la protéine d'intérêt est fusionnée à la protéine gag de HIV par l'intermédiaire d'un site protéolytique ce qui permet la libération de la protéine après fusion de la particule avec la cellule d'intérêt. En théorie, le choix des protéines d'enveloppe de la pseudoparticule permettent un adressage à différents types cellulaires.  [...]

[Biologie Cellulaire] Mise en évidence de protéines membranaires

Bonjour, je suis actuellement bloqué sur une démonstration de la localisation des protéines (si elles sont transmembranaires ou périphériques) il est marqué dans mon cours.  [...] Je comprends le principe de l'expérience mais pas son interprétation. Comment peut on savoir si la protéines est transmembranaire ou périphérique car pour comparer les deux vésicules il.  [...]