• Santé - Comparaison, Séquences, Espèces, Acides aminés

[Génétique] Comparaison de séquences

J'ai un TP à faire en SVT à l'aide d'Anagène. Je dois faire des comparaisons de différentes séquences. Je dois révéler la notion de famille multigéniques.  [...] Pourquoi la comparaison des séquences de nucléotides d'espèces différentes est plus précise que la comparaison des séquences d'acides aminés.  [...]

Évolution du virus A (H5N1) | Dossier

La comparaison des séquences d'acides aminés de l'HA des isolats humains de clade 1 et 2 avec ceux des cas mortels de 1997 et 2003 à Hong Kong, montre des variations au niveau de l'HA des virus 2004-2005 (WHO Global Influenza Program 2005 98 ).  [...] L'arbre phylogénétique des gènes de la protéine M2 évolue de façon parallèle à celui des gènes de la HA. La séquence d'acides aminés de M2 des virus du clade 1 et du clade 1' (A/Hong Kong/213/03) révèle une substitution de la sérine vers l'asparagine au résidu 31.  [...]

[Génétique] Myoglobine

Mes documents pour m'aider sont la représentation en 3D de cette molécule et la comparaison d une partie de la séquence des acides aminés de la myoglobine de quelques vertébrés.  [...] ..) et/ou des liaisons covalentes de type ponts disulfures (entre deux cystéines). Finalement, c'est bien la séquence en acides aminés qui va conditionner la prise de forme, c'est-à-dire la structure 3D.  [...]

[Biotechnologie] spectrometrie de masse

je voudrais savoir aussi si le logiciel de comparaison avec une base de donnée utilisait la sequence en acides aminés ou le spectre de masse pour identifier le peptide ou la proteine en question.  [...] Ce qu'il faut avoir a l'esprit, c'est que la masse d'un peptide est statistiquement unique au dela de 6 ou 7 acides amines (je ne sais plus exactement). En comparant les masses des peptides obtenus aux masses theoriques que l'on peut obtenir a partir d'une base de donnees de proteine, on peut identifier ainsi la sequence a partir de la masse (algorithme Mascot).  [...]

[Biotechnologie] Il-2

je cherche la séquence en acides aminés de la Proleukin* afin de faire une comparaison avec celle de l'IL-2 sauvage.  [...] Donc là, vous devriez avoir la séquence protéique du précurseur (donc de 153 aa).  [...]

[Biologie Moléculaire] Criblage d'une banque d'ADNc

Tu transfectes une banque d'ADNc dans tes cellules malades, et tu regardes apres transfection lesquelles collent a la boite. Tu les recuperes, extrait ton cDNA issus de la banque, sequences et trouves le gene qui par sa presence permet de restaurer un attachement normal de tes cellules.  [...] donc le problème du départ c'était l'ignorance de la difficulté pour savoir la séquence d'une protéine(ses acides aminés), ce qui ma emmener à faire des fausses hypothèses.  [...]

Logiciel : séquence d'adn

Pratiquement, la base de donnée étant comme même volumineuse, il est utilisé la fonction BLAST du site du NCBI =. http.//blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi.   [...] Bien sur, cela prends du temps (surtout si vous souhaitez la comparaison avec toute les espèces séquencés), mais généralement, ce n'est qu'une affaire de minutes.  [...]

[définition] Votre définition de l'espèce ?

Pour la notion de gène, c'est pareil. Le génome étant de même un continuum, et parfois un véritable inbroglio de séquences de nucléotides codant une séquence d'acides aminés (mise à part pour les chromosomes des eucaryotes qui découpent le génome en plusieurs unités).  [...] Mais c'est pas déja ce qui est fait en phylogénie moléculaire, la comparaison de la séquences des ARN ribosomiaux entre espèces.  [...]

[Biologie Moléculaire] acides aminés

alors que ceux composés d'hétéroatomes (O, N, S) seront plus polaires (hydrophiles). Après, ca ne sert à rien de prendre en compte les fonction alpha carboxilique et alpha aminés, dans la mesure ou elles sont communes à tous les acides aminés. inutile donc de les prendre en considération pour la comparaison des aa entre eux.  [...] L'autre grande classe est celle des acides aminés apolaires ou hydrophobes dont les liaisons ne sont pas polarisés comme une liason c-H ou C-C, formant des chaines hydrocarbonées ou encore un noyau aromatique existant chez la phe qui est stabilisé par effet mésomère(déloclisation des életron des liaison pi) empechant toute interaction avec un groupement chargé.  [...]

Blé : des réarrangements chromosomiques que l'on croyait impossibles

Ces différentes espèces de blé constituent un excellent modèle pour l'étude de l'évolution des génomes des plantes sous la pression de la polyploïdisation, de la domestication et de la sélection par l'homme. L'examen par les chercheurs de l'évolution d'une des plus célèbres régions chromosomiques du blé, le locus Ha (hardness) qui contrôle la dureté du grain, leur a permis de reconstituer l'histoire et les conséquences des additions successives de jeux de chromosomes du blé.  [...] C'est par la comparaison des séquences génétiques des espèces de blé diploïdes, tétraploïdes et hexaploïdes que les chercheurs ont élucidé les bases moléculaires des événements évolutifs observés au niveau du locus Ha. L'analyse comparée leur a permis de déterminer l'étendue des régions réarrangées, leurs séquences ainsi que les sites de réarrangements.  [...]