• Santé - Comparaison, Espèces, Séquences

[Génétique] Comparaison de séquences

J'ai un TP à faire en SVT à l'aide d'Anagène. Je dois faire des comparaisons de différentes séquences. Je dois révéler la notion de famille multigéniques.  [...] Pourquoi la comparaison des séquences de nucléotides d'espèces différentes est plus précise que la comparaison des séquences d'acides aminés.  [...]

[Biologie Moléculaire] Criblage d'une banque d'ADNc

AVec les banques des séquences complètes des génomes, on peut aussi utiliser le BLAST pour trouver des gènes homologues, variants du même gènes ( splicés )...etc.  [...] Et comme l'a précisé MaliciaR, tous les organismes n'étant pas intégralement, correctement,... séquencés, ton blast ne trouvera pas ce qui n'est pas encore présent dans sa banque de données, alors que cela peut être présent dans une banque... de cDNA.  [...]

Logiciel : séquence d'adn

Pratiquement, la base de donnée étant comme même volumineuse, il est utilisé la fonction BLAST du site du NCBI =. http.//blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi.   [...] Bien sur, cela prends du temps (surtout si vous souhaitez la comparaison avec toute les espèces séquencés), mais généralement, ce n'est qu'une affaire de minutes.  [...]

Question métier ?

- déjà pour commencer le domaine de l'évolution animale est très vaste et peu être attaqué sous différent aspect. Par exemple dans mon ancien labo, une chercheuse spécialisée dans l'immuno et un chercheur spécialisé en génétique des population travaillaient sur le même sujet.   [...] - collecte des séquences du gène chez différentes espèces, alignement et comparaison. détermination des zones conservées. réalisation d'arbre phylogénétique. determination du rôle des zones conservées et non conservées. listage des conséquences déjà observées.  [...]

[définition] Votre définition de l'espèce ?

Mais c'est pas déja ce qui est fait en phylogénie moléculaire, la comparaison de la séquences des ARN ribosomiaux entre espèces.  [...] Ce serait oublier les autres forces évolutives (sélection, dérive et migration) qui participent. Des espèces ont par exemple pu apparaître relativement rapidemment suite à une réduction drastique et brutale d'une population (effet bottle neck ). Dans un tel exemple, on pourrait donc nier l'existence de 2 espèces différentes car isolées reproductivement et globalement bien distinctes au niveau génétique mais pour lesquelles le taux de ressemblance serait largement supérieur au seuil de ressemblance fixé pour les gènes retenus pour la comparaison avec la méthode de John78.  [...]

Organites cellulaires

3-La nucléoline est une phosphoprotéine majoritaire du nucléole dont la fonction n'est pas encore bien définie. Elle est très abondante dans les nucléoles pr ésentant une forte activité de transcription. Plusieurs expériences suggèrent son implication dans l'organisation de la structure de la chromatine.   [...] Elle jouerait un rôle lors de la transcription des gènes codant pour les ARNr et l'empaquetage de ces ARNr lors de l'assemblage des ribosomes. Cette protéine a été identifiée dans de nombreuses espèces et la comparaison des séquences montre qu'il existe une grande conservation de séquence au cours de l'évolution.  [...]

Blé : des réarrangements chromosomiques que l'on croyait impossibles

La comparaison des génomes de plusieurs espèces de blé, depuis leurs formes sauvages jusqu'aux formes cultivées utilisées aujourd'hui, nous éclaire sur des mécanismes génétiques originaux liés à l'évolution de cette céréale. Ce travail, coordonné par l'INRA, dont le détail est publié dans le numéro d'avril 2005 de The Plant Cell, a permis de déterminer pour la première fois que des mécanismes de réarrangements chromosomiques par recombinaison illégitime d'ADN, conséquence de la polyploïdie (doublement ou agrégation du génome), ont eu un impact crucial sur l'évolution du génome du blé et de ses caractéristiques.  [...] C'est par la comparaison des séquences génétiques des espèces de blé diploïdes, tétraploïdes et hexaploïdes que les chercheurs ont élucidé les bases moléculaires des événements évolutifs observés au niveau du locus Ha. L'analyse comparée leur a permis de déterminer l'étendue des régions réarrangées, leurs séquences ainsi que les sites de réarrangements.  [...]

question sur le logiciel ANAGENE

Seulement je ne sais pas quelles séquences choisir pour faire une bonne comparaison et, ainsi, déterminer quelles sont les espèces les plus proches de l'homme.  [...] Reste CMH et NAD. Je crois que NAD est assez conservée dans le monde vivant, alors que le CMH présente une grande variabilité (polymorphisme). Donc après réflexion, pour une comparaison entre primates (les espèces sont relativement proches) je choisirais plutôt le CMH.  [...]

génétique du developpement et évolution

J'aurais besoin de votre aide a propos d'un dossier que je dois faire sur l'apport de la genetique du developpement ds la connaissance de l'évolution des especes. Le prof ns a demandé de prendre un ex concret, j'ai pensé au passage de la nageoire a la patte ou l'appartition des ailes chez les hexapodes, seul souci j'arrive pas a trouver le mécanisme exact des genes homéotiques jusqu'a l'apparition de l'innovation genetique et morphologique, l'apparition de la ou les mutations, la comparaison des sequences en bases azotées et AA pr ces exemples.  [...] J'ai vu que c'était controlé par le gene Pax 6 chez l'homme) qui était donc le gène maitre qui active en cascade plus de 2500 genes pour former l'oeil et que ce gene possède son homologue chez d'autres espèces (souris, mouche, mollusque, ver plat...). Ce que je comprends pas c'est pourquoi quand on greffe le gene homologue de Pax 6 de la souris appelé small eye, chez la mouche on obtien des yeux de mouche.  [...]

[Génétique] Terme scientifique pour comparaison des séquences d'ADN

J'entends par là que l'alignement est un procédé qui permet la comparaison. Or je cherche le terme scientifique qu'on utilise pour parler de comparaison de séquences d'ADN.  [...] http.//bioweb.pasteur.fr/ qui montre qu'il n'y a pas de terme pour parler de comparaison de séquences d'ADN, on parle directement d'alignements.  [...]