• Santé - Chromosome, Distance, Marqueurs

[Génétique] Notion de distance génétique

Il s'agit d'une question de génétique formelle. Pour calculer la distance génétique entre deux gènes (deux marqueurs chromosomiques), il faut être en situation de pouvoir calculer la probabilité d'une recombinaison entre ces deux gènes. Chez différents modèles génétiques (drosophile, Arabidopsis, souris) on doit croiser des individus double-hétérozygotes (A/a B/b) (parent P) avec des individus double homozygotes récessifs (a/a b/b) (parent P') (situation appelée Test Cross).  [...] (Si éloignés qu'il y a tellement de crossing-over entre les deux gènes, qu'il y autant de chance d'obtenir un gamète recombiné qu'un gamète parental.) Plus la distance calculée est grande, plus elle est surestimée. En calculant de petites distances entre deux marqueurs, puis deux autres et ainsi de suite, de proche en proche, on peut, par addition, calculer la distance génétique entre deux gènes très éloignés d'un même chromosome, voir entre tous les gènes, jusqu'à obtention d'une carte génétique complète.  [...]

Cartographie génétique

La cartographie physique permet de déterminer la séquence complète du chromosome et la distance entre le gène et les marqueurs en Pb, et c'est là que je ne comprends pas grand chose, on m'explique dans mon cours que pour réaliser cette technique, on utilise un génôme que l'on fragmente en fragments de grande taille, on les insère dans des vecteurs (chr artificile de bactérie par exemple), on insère ces vecteurs dans les bactéries, puis on compare les séquences des clones en repérant les points communs entre ces séquences et par recoupement on trouve la séquence.  [...] .. bref vous avez surement compris en me lisant que la méthode pour faire une cartographie physique est vraiment très floue, je ne comprends pas pourquoi on doit mettre des séquences dans des bactéries pour les comparer, ni même ce qu'ils appellent un clone (grands/petits clones).   [...]

carte liaisons, génétique physique...

Pour moi la def 1) est. Agencement relatif des marqueurs le long du ou des chromosomes.  [...] La def 2) est. Agencement relatif des marqueurs le long du ou des chromosomes AVEC connaissances de la distance des marqueurs (Cm).  [...]

les centiMorgans

J'ai bien compri pourquoi on peut avoir 50cM maximum en distance génétique. Par contre, puisque il semble qu'un cM=1million de pb, est-ce que ça veut dire que la taille maximum d'un chromosome est de 50millions de pb Si je suis à côté de mes pompes dites- le moi que je parte sur une autre piste. Merci d'avance.  [...] J'avais posté sur un autre topic à ce sujet. le centimorgan si tu veux, ça peut correspondre à une certain nombre de paire de base, mais ça dépend de la taille totale du chromosome. C'est un pourcentage de la taille totale en gros. 50Cm signifie que les deux gènes sont aux extrémités opposée du chomosome, donc la distance entre les deux gène représente 100% de la taille du chromosome en pb. Mais tout ça reste théorique.  [...]

[Biologie Moléculaire] identification d'un gène

Enoncé. Dans le cas d'une maladie génétique, il ya plusieurs gènes dans une région d'un chromosome X. Certains codent des protéines dont la fonction est connue. En admettant que le syndrome observé est due à l'altération d'un seul gène, quelles stratégies expérimentales faut il utiliser pour identifier ce gène.  [...] - on peut faire un clonage postionnel c'est à dire qu'on mappe génétiquement le chromosome par des techniques de cartographie (marqueurs) pour trouver l'endroit où est la mutation. Par exemple avec des marqueurs FISH.  [...]

[Biotechnologie] Test De Paternité

Et combien y-a t-il de gènes par chromosome, c'est sur que ça varie d'un chromosome à l'autre mais on peut quand même estimer une moyenne pour se faire une idée je pense.  [...] Alors pour le nombre de marqueur par chromosome c'est très variable (ça dépend des chromosomes). En revanche, contrairement à ce qui a été dit avant, il faut bien discerner marqueurs et gènes, qui n'ont rien à voir. Les marqueurs ne sont pas les allèles d'un gène mais les allèles d'une séquence.  [...]

[Génétique] complexe d'espèce

La distance génétique de Nei sert à évaluer le degrés de ressemblance de structure génétique entre population et entre compartiments des mêmes complexe d'espèce.  [...] En biologie, un complexe d'espèces cryptiques est un groupe d'espèces qui satisfait certaines définitions de l'espèce telles que la définition biologique (elles sont isolées reproductivement l'une de l'autre) ou la définition phylogénétique de l'espèce (leurs lignées génétiques ont une importante différenciation génétique), indiquant une divergence ancienne, mais qui ne sont pas distinguables d'un point de vue morphologique.   [...]

crossing over

Parce que 2 marqueurs génétiques vont se retrouver sur la même chromatidebien qu'il y ait eu CO, donc pas gene conversion apparente, donc tu sous-estimes la distance génétique.  [...] Merci à tous. En résumé, on va sous-estimer la distance génétique dans le cas ou on aurait un CO sur un même chromosome, entre ses 2chromatides. Si c'est le cas, on sous-estime pour une chromatide et on sur-estime pour l'autre alors... Dans le cas d'un CO normal cad entre 2chromosomes, l'un échangeant un morceau de chromatide avec l'autre.  [...]

marqueurs genetiques

En cartographie, les marqueurs representent des bornes dans le genome. On peut calculer leur distance (physique ou genetique) avec des locus qu'on etudie.  [...] Et effectivement en transgenese on appelle marqueur une sequence introduite avec la sequence d'interet qui permet de detecter sa presence.  [...]

genetique bacterienne bacterie Hfr

le but de l'exercice est de remettre les lettres dans l'ordre en reconstituant un cercle à partir des 4 fragments proposés. Les 4 fragments sont issus du même chromosome circulaire. Il peut y avoir des parties qui se chevauchent. Cela va t'aider à retrouver l'ordre des marqueurs sur le chromosome.  [...] Ne remarques-tu pas que certaines lettres sont dans le même ordre entre la souche 1 et la souche 4 Comme les 2 premiers marqueurs de la souche 2 et les 2 derniers de la souche 3.  [...]