• Santé - Charge, Protéine, Acides aminés

[Biologie Moléculaire] Page sds

Voilà je voudrais savoir quel est le voltage adéquat pour séparer de protéines de 280 et 290 kDa, sachant que jusqu'à maintenant je n'ai pas pu le faire en utilisant des gel de 4-12% et 3-8% à 200V. Je sais qu'avec un SDS-PAGE la charge des protéines n'a pas de roles sur mobilité mais le voltage peut-il jouer un rôle sur la résolution de la séparation.  [...] 4g de SDS pour 1g de protéine), la charge globale d'une protéine dépends alors uniquement de sa longueur en acides aminés, et du coups, de son poids moléculaire.  [...]

[Biochimie] Extraction enzymes

acides, protéases,... Enfin, le tampon permet de rester dans des conditions isotoniques qui contribuent au maintien de la forme native de ta protéine.  [...] Oui en se plaçant à un pH proche du pHi, on favorise la stabilité de la forme native de la protéine. En effet, la structure protéique est conditionnée par le pH qui va définir la charge des acides aminés déterminante pour la conformation finale de la protéine.  [...]

Composition d'un peptide

j'ai trouvé la solution pour la charge nette steph avait raison car elle correspond à la somme des charges portées par chacun des radicaux ionisables des acides aminés dans une protéine à un ph donné.  [...] pour calculer le phi il faut tracer un tableau des pk ionisable dans la protéine et leur attribué leur charge en fonction du pk des autre groupe. C'est pas clair comme ça mais il y a une bonne explication à page 9 de.  [...]

[Biochimie] La charge des protéines à pH=7

Certains acides aminés possèdent un deuxième groupement amine ou carboxyle, qui n'est donc pas pris dans la liaison peptidique.  [...] J'aurais une dernière question (un peu HS). à pH très acide, est-ce que l'extrémité N-terminale est sous forme NH3+ et l'extrémité C-terminale sous forme COOH En gros, est-ce que les extrémités N et C terminales interviennent dans la charge totale de la protéine.  [...]

[Biochimie] Protéine hydrophile ou hydrophobe ?

Je cherche à déterminer si ma protéine est hydrophile ou hydrophobe à partir de sa séquence en acides aminés et de sa charge globale.  [...] C'est justement parce que le ratio d'acides aminés hydrophobe/hydrophile ne suffit pas à prédire le statut hydrophile ou hydrophobe de la protéine que je suis perdue.  [...]

Biochimie : Protéines

Le point isoélectrique, c'est en gros la valeur de pH ou ta protéine ne possède plus de charge c'est déterminé par les acides aminés qui la compose.  [...] En clair si ta protéine à un point isoélectrique de 5 et que le pH de la solution est à 4 ta protéine sera chargé positivement, mais si tu monte le pH de ta solution à 6 ta protéine sera chargé négativement.  [...]

[Biochimie] Modifications post traductionnelles et électrophorèse !

Heu non tu peux pas dire ça parce qu'il peut y avoir d'autres acides aminés chargés dans ta protéine (histidines, arginines, glutamates, aspartates). Disons plutôt qu'elle va moins migrer vers la cathode que ta protéine P normale.  [...] C'est possible mais ça fait une sacrée phosphorylation. Mais je suis d'accord avec toi que le SDS recouvre la protéine (je n'y ai plus pensé à ça... ) donc mon hypothèse est un peu foireuse, la tienne étant la plus probable. En plus sur 1863 acides aminés, c'est possible, les phosphorylations de cette protéine démontrées actuellement étant déjà une bonne dizaine, sans compter celles qui restent sans doute à découvrir.  [...]

Polypeptide végétal

Ouais, monopeptide semble n'exister qu'en anglais, une langue ou apparemment les acides aminés simples semblent être aussi classés sous le nom de protéine.  [...] pas vraiment, en fait on parle de protéine lorsqu'on parle d'une chaine d'environ 100 acides aminés, en dessous ce sont des peptides tout simplement.  [...]

[Biochimie] pH>7 SVP C urgent

Pour des pH supérieurs à 7, l'activité enzymatique chute, est ce que cela est dû au fait que l'enzyme est dénaturé ou bien au fait que le site actif de l'enzyme est caché.   [...] tu as oublié une possibilité, que certains acides aminés du sites actif se chargent a des pH elevés, modifiant ainsi l'activité de la protéine.  [...]

[Biochimie] Etude de la reconnaissance enzyme, substrat

- Sachant que certaines liaisons faibles dans une protéine dépendent des charges + ou - portées par les acides aminés, proposez une explication à l'importance du pH dans l'activité d'une enzyme.  [...] On peut également trouver des exemples pour la différences ammonium/amine d'acide aminés comme la lysine. Il est probable que la charge des acides aminés soit optimales pour la catalyse à PH physiologique (PH 7,4 il me semble sauf dans certains cas cités par novocaine, à PH 7,4, les acides seront en tout cas majoritairement sous forme carboxylate et les amines sous forme d'ammonium).  [...]