• Santé - Calcul, Enzymes, Structure

[Biologie Cellulaire] Enzymes et ARN

...une simple réponse à ta question NON, c'et contraire à la formule qui dit, deux enzymes similaires= structures chimiques et moléculaires similaires...tout simplement...vous aurrez compris que la différence est dans la structure et la fonction intranucléaire.  [...] je m'explique un peu plus, si on calcul à un degré de précision yettamétrique en trouvera que ces enzymes différent dans la structure chimique et qui catalysent la même réaction biochimique, sont beaucoup moins rapide que d'autres (si en pense en yetta biensur et pas en géga.  [...]

[Biochimie] Culture virus?

Ma question est juste une question de curiosité, il faut savoir que la biologie n'est pas mon domaine de prédilection, je fait plutot dans le calcul de structure.  [...] Je suis en stage de fin d'étude en vue d'obtenir un diplome d'ingenieur en calcul de structure dans une boite qui concoit et fabrique des réservoirs en composite pour hélicoptére, il font aussi les airbags pour nos cheres véhicules.  [...]

[Biologie Moléculaire] Combien d'enzymes différentes dans le vivant ?

Il y a 4585 enzymes différentes. On connaît à la fois la séquence d'acides aminés et la structure cristalline pour 1776 d'entre elles. Pour 1052 autres, on connaît uniquement la séquence d'acides aminés. Enfin, pour le reste, soit 2809, on ne connaît ni la séquence ni la structure cristalline (mais on connaîtle minimum, c'est-à-dire le type de réaction effectivment catalysée par ces enzymes).  [...] Pour ceux qui ne connaisse pas, la structure primaire d'une protéine (et les enzymes en sont pour la très grande majorité) correspond à la séquence des acides aminés la constituant. La structure secondaire correspond à la forme générale tridimensionnelle de ces différents segments.  [...]

[Biologie Cellulaire] Génétique

Bonjour à tous, je ne comprends pas ce qu'est la structure d'un gène, le lien entre la molécule d'ADN et chromosome, et nous avions fait un calcul de comparaison pour trouver la longueur ADN avec une distance quelconque.  [...] on trouve chez les eucaryotes la structure suivante. site promoteur(boite tata...)+les exons(les séquences codantes) et les introns(les séquences non codantes).  [...]

[Biochimie] Sequençage de l'ADN

Pour les fragments de 100 bp je sais pas exactement mais il me semble que c'est mécanique... j'imagine mal qu'il existe une enzyme super bien élevée qui coupe tout les 100 paires de bases (quoi que).  [...] Ca dépend, les enzymes de restriction reconnaissant des sites de restrition courts, 3 bases par exemple, clivent selon un calcul probabiliste toutes les 64 paires de bases. Pour les sites de restriction de 4 bases, leur fréquence est en moyenne toutes les 256 bases.  [...]

[Biochimie] Questions à propos de l'activité enzymatique (1èreS)

- Nous avons dit dans le Cours 1 (Le phénotype dépend des protéines) que la structure des protéines est due aux affinités entre les différents acides aminés et dans le cours 2 (L'activité enzymatique) que la structure de l'enzyme (qui est une protéine) était due aux différentes liaisons liant les acides aminés.  [...] cette question n'a pas de réponse. Ca peut ou peut ne pas influer sur l'activité de l'enzyme. Meme si c'est pas dans le site catalytique, ça peut etre dans une région critique pour la structure de l'enzyme. Ca peut aussi ne rien changer si c'est dans une région peu impliquée.  [...]

confirmation pour un petit calcul

J'aurais besoin d'une petite confirmation pour un calcul car je ne suis pas sûre du résultat même si ça paraît tout bête. Voilà je voudrais 5Unités d'enzymes dans un mix de 20ul. J'ai rajouté dans le mix 5ug d'ADN sachant qu'il faut 1Unité d'enzyme pour 1ug d'ADN et que la concentration de l'enzyme est de 5 000Unités/ml.  [...] Normalement je devrais déposer 1ul d'enzyme dans monmix car 5unités / 5000Unités = 1ul non.  [...]

[Biologie Moléculaire] Fold It! le jeu du repliement des protéines

David Baker et son équipe ont également remporté les deux derniers concours de prédiction CASP (Critical Assessment of Techniques for Protein Structure Prediction) de 2004 et 2006 grâce à leur application Rosetta, au serveur Robetta et la grille de calcul distribué Rosetta@home (70 teraflops de puissance de calcul).  [...] Je connais bien le programme Rosetta puisque je calcule pour WCG qui utilise l'algorithme de David Baker, dans l'équipe Futura Sciences bien entendu. J'avoue que j'ai du mal à comprendre sur quoi les joueurs se fient pour replier sans avoir quelque base en structure protéique car d'après ce que je vois sur le dessin, c'est une véritable structure primaire.  [...]

Comment calculer la taille des fragments sur une carte de restriction?

Voila quelqu'un peut me dire si ma methode de calcul est bon et si mes resultats le sont aussi SVP De l'aide pour la suite de l'exo pour placer les enzymes sur le cercle me serait aussi trés utile. Merci d'avance.  [...] Ensuite, dans ce cas précis c'est impossible d'aller plus loin. Vous voyez que les doubles digestions ne sont faites qu'avec deux paires d'enzymes. Vous ne pouvez donc simplement PAS positionner vos deux cartes l'une par rapport à l'autre. Vous pouvez essayer, mais quelle que soit la position relative des sites EcoRI /SalI par rapport aux sites PstI/HindIII (imaginez superposer vos deux cartes), le résultat des doubles digestions telles que données dans l'énoncé sera le même (c'est à dire que si vous superposez vos deux cartes, vous pouvez les faire tourner l'une par rapport à l'autre et imaginer faire les mêmes digestion, le profil ne changera pas).  [...]

[Biochimie] PCR / sanger / amorces / séquences /

la tempérture d'annealing (d'hybridation de ton amorce sur son complementaire au niveau du brin) doit se trouver entre 55 et 68 approximativement (le calcul simplifié de la température est quelque chose du genre. le nombre de A + T multiplié par 2, + le nombre de C + G multiplié par 4, et ca te donne ta temperature pour le Ta qu'on appelle Tm), le nucleotide en dernière position est important aussi, il ne faut pas que ca soit n'importe lequel, et il est preferable de ne pas avoir plusieurs (genre 4 ou 5 ou plus) G a la suite vers la fin de ton primer sinon ca mène a des structure secondaire et ton primer ne sera pas linéaire et s'hybridera mal.  [...] La température d'hybridation est rarement de 50, tu dois choisir la température qui correspond a ta séquence (voir message #2) et pour l'élongation c'est souvent 72, mais la encore je crois que ca peut dépendre de la température optimale de l'activité de la polymérase.   [...]