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[Biologie Moléculaire] methodes haut debit de screening de bacteries pathogenes

[Biologie Moléculaire] methodes haut debit de screening de bacteries pathogenes.  [...] je pense qu'il faut que j'utilise deux methodes d'analyse par haut debit afin de detecter des bacteries pathogenes er ceci dans le domaine agroalimentaire.  [...]

Une extraordinaire diversité | Dossier

Avant l'essor de la biologie moléculaire, les espèces étaient décrites en fonction de paramètres physiologiques (taille, forme, couleur, mobilité etc...) et biochimiques (capacité à métaboliser tel ou tel composé etc...). Cependant ces tests sont rendus imprécis par la variabilité des réponses d'une souche à l'autre ou pour une même souche, en fonction du temps et du milieu sur lequel les tests sont effectués.  [...] Il a fallu attendre les progrès conjoints de la biologie moléculaire (amplification en chaîne d' ADN, séquençage à haut-débit) et de la bioinformatique pour que se développe la phylogénie moléculaire. Il est alors devenu possible d'établir des arbres généalogiques à partir des séquences d'un même gène comparées entre toutes les espèces.  [...]

[Biologie Moléculaire] Séquençage à très haut débit

D'habitude je vois plutôt bien le fonctionnement des techniques, mais là je ne comprends absolument pas le principe de séquençage à très haut débit (et je ne trouve rien sur internet qui m'éclaire assez) et j'ai cru voir qu'il y avait des gens calés par ici.  [...] En fait c'est assez simple. Les biles se lient à une seule molécule d'ADN grâce à un primer spécifique. Ensuite, ces billes portant une unique copie d'ADN sont mises en émulsion (c'est à dire sous forme de gouttelettes d'huile) avec les réactifs nécessaires à une PCR.  [...]

Optimiser les ressources de l'agriculture et de l'élevage | Dossier

Les progrès spectaculaires de la biologie moléculaire, de la bio-informatique et de diverses technologies comme le séquençage à haut débit ou l'analyse d'images ont ouvert un nouveau champ d'investigation du vivant. la génomique permet de dresser le catalogue des gènes d'un organisme, de comprendre leur régulation, leurs fonctions et leurs interactions.  [...] Le programme Biotechnologies et ressources génétiques végétales (programme Biotrop, Cirad) utilise également les plus récentes technologies pour valoriser la diversité génétique des plantes et renforcer ainsi le dispositif d'amélioration variétale. Le programme développe de nouvelles méthodes assurant une gestion optimale des ressources génétiques, facilite la création et l'identification de génotypes performants (qualité technologique) et participe à la diffusion rapide des variétés sélectionnées.  [...]

Lait : l'avis de Marie-Christine Montel, spécialiste de la biodiversité microbienne | Dossier

des bactéries à Gram positif, parmi lesquelles on distingue les ferments (des bactéries lactiques qui ont une fonction d'acidification, comme Lactobacillus, Leuconostoc, Enterococcus, etc.) et les bactéries d'affinage (qui produisent des molécules aromatiques, les bactéries corynéformes, Micrococcus, Leucobacter, staphylocoques non pathogènes, etc.).  [...] Nos approches bénéficient de l'avancée des outils de métagénomique, avec le séquençage à haut débit de la totalité des génomes d'un écosystème. Mais nous restons également attachés aux méthodes pasteuriennes sur boîtes de Petri.  [...]

Le RV du docteur Cocaul : pour votre santé, soignez votre microbiote

Nous, êtres humains, sommes porteurs d'environ 160 espèces de bactéries différentes. Mais ce qui nous lie, quels que soient notre ethnie ou le continent où nous vivons, c'est un socle commun de 15 à 20 espèces. Le séquençage à haut débit du génome bactérien a permis la caractérisation de ces bactéries cohabitant dans notre intestin.  [...] Que va-t-on laisser à nos enfants et petits-enfants Une planète inhabitable qui fera que les films de science fiction comme Soleil vert, La route ou Le livre d'Eli deviendront des reportages et notre monde actuel, le monde d'hier. Nous sommes en train d'épuiser notre flore digestive et de la transformer en la dépeuplant d'espèces bactériennes bienveillantes pour les remplacer par des bactéries malveillantes et perturbatrices de notre état de santé.  [...]

[Biologie Moléculaire] Séquençage et métabarcoding

Bref, je comprends pas trop où va ton expérience. Soit tu as une information très précise à obtenir, sur un nombre limité de séquences, et tu fais du pyro-séquençage. Soit tu cherches à avoir une vision plus globale de ton génome et tu passes par du séquençage à haut débit (et après le choix de la méthode de séquençage à haut débit dépend des informations recherchées).  [...] Ne vous inquiétez pas, je ne me lance pas seule dans le haut débit, je me renseigne seulement des limites de ces méthodes selon ma problématique, il faut bien apprendre Et puis, il y a une différence entre la faisabilité selon le coût, et le fait que ce soit possible techniquement.  [...]

La génomique et la viande bovine | Dossier

La deuxième moitié du XX ème siècle a vu le développement des méthodes d'étude de l' ADN. Il semblerait que le XXI ème siècle sera celui des biotechnologies à haut débit d'étude des ARNm et des protéines. Les applications en Science de la viande sont.  [...] - l'identification de nouvelles caractéristiques musculaires explicatives de la variabilité de la qualité de la viande, et notamment de la tendreté de la viande bovine.   [...]

Séquençage haut débit d'E. coli : vers une médecine personnalisée

Ces équipes ont en effet travaillé sur un nouveau séquenceur haut débit (PGM, personal genome machine, IonTorrent de Life Technologies) installé il y a moins d'un mois sur le campus.  [...] Un inconvénient majeur, cependant. Si les laboratoires possèdent un recul vis-à-vis du séquençage, cette technique est nouvelle. On produit aujourd'hui, avec le IonTorrent, comme avec la majorité des technologies de séquençage haut débit, des fragments de séquences proches de 100 bases alors que certaines autres technologies permettent l'obtention de fragments de 400 bases, ajoute Christophe Audebert.  [...]

Mucoviscidose : l'espoir d'un médicament

Testée chez la souris, une molécule, déjà utilisée contre une autre maladie génétique, sera prochainement testée chez des patients. La recherche a été rapide et l'espoir d'un médicament est réel, même s'il ne peut y avoir aucune certitude.  [...] C'est en effet cette dernière qui a financé ces travaux. La vitesse à laquelle les recherches ont été menées s'explique aussi par le recours à la méthode de criblage à haut débit, qui accélère considérablement l'étude de produits actifs. Grâce à une plateforme robotisée, elle permet de tester rapidement des milliers de molécules différentes en vérifiant leur action sur une cible, ici, en l'occurrence, la protéine CFTR.  [...]