• Santé - Biologie moléculaire, Comparaison, Séquences

[Biologie Moléculaire] comparaison de deux sequences

Connaissez vous un outil (logiciel,site en ligne ou autre )qui permette de comparer plusieurs sequences de nucleotides,de par la je veux dire mettre en evidence leur homologie de sequence,si jamais il y en a.  [...] Pour comparer deux séquences entre elles il y a Fasta (tu peux aussi utiliser ClustalW mais Fasta est plus rapide).  [...]

[Biologie Moléculaire] Comparaison de plaque qPCR

Alors j'ai 6 plaques de qPCR, 2 par espèce recherchée (protozoaire, bactérie ou champignon), sur chacune se trouve 3 échantillons de références toujours placés au même endroit et issus des même aliquots.   [...] Mes échantillons de références subissent eux aussi le traitement PCR, ils sont là pour valider le fait qu'entre 2 plaques il se passe la même chose. Je ne suis pas dans le calcul direct de mes CT/nb de copie, j'essaie de mettre au même niveau mes plaques, parce que je ne peux pas travailler exactement de la même manière entre deux plaques, donc je dois corriger mes valeurs. Ma question c'est comment puis-je faire ça.   [...]

[définition] Votre définition de l'espèce ?

Le problème de l'espèce concerne la biologie au premier chef, tout particulièrement la biologie de l'évolution, mais également la génétique et la biologie moléculaire. Il a été l'objet de la querelle des universaux, un débat qui a duré tout au long du Moyen Age et eu des conséquences très importantes sur l'histoire des sciences.  [...] Mais c'est pas déja ce qui est fait en phylogénie moléculaire, la comparaison de la séquences des ARN ribosomiaux entre espèces.  [...]

[Biologie Moléculaire] question concernant la comparaison des ADN entre les organismes

lorsque l'on compare les ADN d'organismes apparentés comme l'homme et la souris, les séquences conservées correspondent aux exons et aux régions régulatrices fonctionnellement importantes, et les séquences non conservées correspondent génèralement à l'ADN non codant, est ce que c'est vrai ou non.  [...] Hum... c'est une bonne question. J'aurais tendance à dire que oui, mais je ne suis pas sûr, faudrait attendre qu'un spécialiste en biologie moléculaire passe par là. Mais intuitivement, on aurait envie de dire que les séquences codantes, et les régions régulatrices importantes sont soumises à une très forte sélection, donc ne vont pas beaucoup varier.  [...]

[Biologie Moléculaire] Comparaison génome procaryote-eucaryote

Bref à première vue, cela se voit que cela est bien flou pour moi.. alors je demande un peu d'aide, quelques précisions, ou même quelques idées pour la comparaison que j'essaie d'établir, qui ne me semble pas si facile à établir justement.. Dois-je me baser sur la forme interphasique des chromosomes pour établir cette comparaison.  [...] - Dans le cadre de ma comparaison, lorsque je dois établir des parallèles entre les deux génomes c'est l'aspect structural qui me pose le plus de probleme en effet, chez les eucaryotes les différents niveaux de condensation mettent en jeu également les différentes phases du cycle de mitose, or lorsque je montre ces différents niveaux chez la bactérie, je ne suis pas du tout en mesure d'établir ce même parallèle avec un quelconque cycle de division (que je sais par ailleurs binaire, mais pas plus.  [...]

Blé : des réarrangements chromosomiques que l'on croyait impossibles

.. D'autres, comme le chou ou le maïs dérivent d'ancêtres polyploïdes. Les raisons du succès de la polyploïdie chez les plantes ne sont pas élucidées. Par ailleurs la polyploïdie est propice à des réarrangements chromosomiques importants dont les chercheurs connaissent très peu les bases moléculaires.  [...] C'est par la comparaison des séquences génétiques des espèces de blé diploïdes, tétraploïdes et hexaploïdes que les chercheurs ont élucidé les bases moléculaires des événements évolutifs observés au niveau du locus Ha. L'analyse comparée leur a permis de déterminer l'étendue des régions réarrangées, leurs séquences ainsi que les sites de réarrangements.  [...]

[Génétique] Terme scientifique pour comparaison des séquences d'ADN

Je suis en train de préparer un exposé et je suis tombé sur une question à laquelle je n'ai pas trouvé de réponse, à savoir. comment s'appelle le fait de comparer des séquences d'ADN.  [...] Donc, quel est le terme scientifique permettant de définir l'action de comparer des séquence d'ADN Avec plusieurs mots clef, je n'ai trouvé nul part un site ou une vidéo ou un magasine donnant un terme spécifique.  [...]

[Génétique] Comparaison de séquences

J'ai un TP à faire en SVT à l'aide d'Anagène. Je dois faire des comparaisons de différentes séquences. Je dois révéler la notion de famille multigéniques.  [...] Pourquoi la comparaison des séquences de nucléotides d'espèces différentes est plus précise que la comparaison des séquences d'acides aminés.  [...]

Pourquoi pas de matrice de substitution pour l’alignement (BLAST) des séquences nucléotidiques

La comparaison de séquences de protéines ou de nucléotides permet d'évaluer le degré de parenté entre ces séquences. C'est essentiellement ce que font les outils BLAST.  [...] Lorsqu'on réalise un BLAST de séquence protéique, ON dispose de différentes options de matrices de substitution (PAM, BLOSSUM …) pour calculer le score des alignements. Dans le cas des BLASTs de séquences nucléotidiques, ces matrices de substitution n'existent pas, On ne peut que donner des valeurs numériques aux matches, mismatches et gaps observés à la suite de l'alignement.  [...]

[Biologie Moléculaire] BAC alignement

Je lis un article scientifique sur le réarrangement du génome et je suis bloquée sur un point où ils utilisent des BAC pour comparer des séquences. En fait j'ai pas eu beaucoup de cours à se sujet et j'arrive pas à comprendre la méthode donc je viens demander votre aide.  [...] Je comprends pas du tout lorsqu'ils disent paired BAC end sequences from sperm DNA... ça veut dire qu'il prennent uniquement des séquences terminales Je sais pas comment marche un alignement ou comparaison de séquences avec des BAC et donc j'arrive pas à comprendre la phrase.  [...]