• Santé - Biologie moléculaire, Combinaisons, Acides aminés

Définition | Mutagenèse saturante | Futura Santé

La mutagénèse saturante est une technique de biologie moléculaire qui consiste à générer toutes les combinaisons réalisables d' acides aminés codées par un gène, en réalisant toutes les mutations possibles sur ce gène, une à une.  [...] On note que certains peptides sont similaires (en gras). Il faut donc tester 13 combinaisons dans ce cas précis. Cela permet par exemple de voir l'influence d'une mutation simple sur la structure et la fonction de la protéine ainsi formée.  [...]

[Génétique] Le classement en trois des nucléotides d'ARN.

Il existe 20 acides aminés différents, donc uniquement deux bases ne suffisent pas à coder tous les acides aminés. il n'y aurait que 4 2 =16 combinaisons possibles.  [...] Avec trois acides aminés, il y a 4 3 =64 combinaisons possibles, ce qui est plus que le minimum nécessaire mathématiquement. D'ailleurs, l'ensemble des combinaisons possibles est utilisé, donc certains codons codent pour le même acide aminé. le code génétique est dit redondant.  [...]

plusieurs questions avant mon DS

La geométrie dans l'espace de ce site actif est complémentaire de la géométrie du substrat ce qui garantit la spécificité. De même ce sont les acides aminés qu'on trouve au niveau de ce site qui vont réaliser la réaction catalysée par l'enzyme. On peut donc expliquer au niveau moléculaire la double spécificité.  [...] et le code génétique définit 64 possibilités, dont 3 codons stop. en réalité, il n'y a que 61 combinaisons correspondant à des acides aminés, certaines combinaisons donnant le meme a.a, c'est pourquoi on dit que le code génétique est redondant.  [...]

[Biologie Cellulaire] Principe d'émergence - Acides Aminés et Enzyme

L'enchaînement particulier des acides aminés, leur positionnement au sein du site catalytique de l'enzyme sont cruciaux pour que l'enzyme soit fonctionnelle. Un décalage de quelques angströms d'un acide aminé et la catalyse peut être perturbée. Au niveau de l'émergence, je ne vois pas de lien direct fort et évident.  [...] =. d'où assemblage des acides aminés formant les protéines (et on pourrait même partir de combinaisons des acides nucléiques =. ADN...etc) =. enzymes =. caractéristiques de l'individu dans son ensemble.  [...]

le code genetique

Je sais que il a plusieurs combinaisons d acides aminés pour un seul nucleotides mais je ne sais pas si cela veut dire que sa evite les mutations ou il y a quand meme une mutation mais elle est neutre.  [...] la redondance est pas illimitée. certains changements de nucléotides provoqueront de gros changements d'acides aminés et donc ta protéine sera mauvaise.  [...]

Différence entre procaryotes et eucaryotes : vitesse d’allongement de la chaîne peptidique

Je te remercie vpharmaco. Du coup le papier était un mauvais exemple (sachant qu'ils n'ont pas comparé un lysat de mammifère dans les mêmes conditions a priori). Pourtant, si on a 16 acides aminés par seconde pour une bactérie et 4 à 5 acides aminés pour des cellules eucaryotes, je reste toujours intrigué par cette différence d'un facteur 3 à 4.  [...] Notamment le fait que certaines combinaisons d'acides aminés (proline - proline - acide glutamique chez Ingolia et al., 2011 ) induises une sorte de pause passagère dans la traduction qui aide tantôt à la synthèse, tantôt au repliement de la protéine, entre autres choses.  [...]

[Biochimie] une formule mathématique concernant les protéine.

je souhaite connaitre une formule mathématique pour calculer le nombre de combinaison possible avec 20 acides aminés. sur un peptide issue de 20 codons au minimum jusqu'à 3 milliard de codon ''la distance en codon du génome humain... je suis pas sur du chiffre corrigez moi.  [...] Par ailleurs, pour répondre à votre remarque, il ne faut pas utiliser une factorielle pour votre calcul. Cela reviendrait à effectuer un tirage sans remise, ce qui n'est pas ce que vous demandez. Comme il vous l'a déjà été expliqué quand vous avez n d'emplacements et k possibilités avec remise, l'ensemble des combinaisons est donné par.  [...]

[Biologie Moléculaire] Enigme: repérer une suite de codons dans l'ADN

Après sachant que plusieurs codons peuvent correspondre au même acide aminé (cela dû à la redondance du code génétique) et que cela varie en fonction des acides aminés, le nombre de combinaisons calculé ci dessus est forcément supérieur aux nombres de séquences en acide aminé réalisable. Et la je bloque pour la suite.  [...] Dans ce cas la j'aurais plutôt tendance à dire 20*2 exposant X (nombre de triplets de nucléotides) chacune des 20 possibilités d'acide aminé est à multiplier par deux vue qu'à chaque combinaison éventuelle celui ci sera associé soit à l'un ou l'autre type de linker histones.  [...]

Définition | Code génétique | Futura Santé

Le code génétique fonctionne avec des mots de trois bases. les triplets. Avec trois bases et quatre possibilités pour chacune des bases, il est possible d'obtenir 64 (4 3 ) combinaisons, donc plus qu'il n'en faut pour 20 acides aminés. le code génétique est redondant, car un même acide aminé peut être codé par plusieurs codons (par exemple GAA et GAG codent tous deux pour l' acide glutamique ).  [...] dans l'ARNm, la base T est absente et remplacée par U, qui est complémentaire de A. Pendant la traduction, l'ARNm est traduit en séquence d'acides aminés. 61 des 64 triplets codent pour des acides aminés, les trois autres sont des codons stop (UAA, UAG et UGA).  [...]

[Biologie Moléculaire] [biologie moleculaire] Le code génétique

Prenons un protéine moyenne de 50kD cela fait 500 acides aminés environ, soit...ifiniment de possibilités de combinaisons (j'ai pas de calculatrice sous la main), penses-tu qu'il y en ai besoin de plus.  [...] Ensuite tu oublies un peu vite que l'on ne connait pas la fonction de 10% des proteines presentent dans une cellules... Lorsque le premier genome eucaryote a ete entierement sequences, les chercheurs se sont appercu que par les technique de biologie moleculaire et de genetique et de biochimie, ils n'avaient identifies que 30% des genes (ce qui signifie qu'aucune fonction n'a pu etre attribuee à 70% des genes en laboratoire.  [...]