• Santé - Banques, Données, Protéines

Mlck

Ce sont des banques de données de protéines et/ou de gènes. Une petite recherche sur ces banques avec ton gène/protéine donne.  [...] Tu peux cliquer sur les différents liens offerts dans ces pages qui renvoient vers d'autres banques de données pour compléter les informations.  [...]

comment cloner une enzyme extraite d'une cellule animale?

Sinon, tu as deux choix, si tu as identifié la famille de ta protéine, cherche des homologues insectes dans les banques de données, fais une retrotranscription des ARNm avec un polyT, puis à l'aide d'une amorce semi spécifique (designer pour coller à qqchose qui ressemble aux protéines homologues identifiées) tu fais une PCR et tu clones.  [...] merci pour vos réponses qui m'aident beaucoup. Aussi quelques recherches m'ont permis de voir que je pouvais aussi explorer la voie de la protéomique puisque je ne connais pas la séquence protéique. pouvez-vous m'aider concernant cette méthode.  [...]

[Divers] Bioinformatique: Banques/Bases/Centre de resssource

Une banque de données peut être séquences protéiques, peut être séquences nucléotidiques, peut être Eucaryotes, peut être uniquement Drosphile,... autant de banques de données que de données.  [...] Ensuite, les systèmes d'interrogation de banques auraient quelle utilité C'est bien beau d'avoir un ensemble avec des données. Mais j'ai une recherche précise. je veux que la banque me sorte une séquence d'acides aminés de telle taille et pas d'une autre, d'un organisme qui est celui-là et pas un autre.  [...]

techniques de genetique

Ensuite tu utilises les banques de données comme par exemple celle du NCBI et tu fais du BLAST pour obtenir les séquences les plus proches chez d'autres organismes.  [...] comparaison de séquences un BLAST contre nr (toutes les banques de données) mais il te faut la séquence protéique de ce que tu veux comparer... enfin tout ça si je ne me trompe pas.  [...]

Les bases constituant les protéines

Ou alors un système MALDI/MS/MS, c'est mieux car au moins les ions sont monochargés donc il n'y a pas à faire le calcul des charges et la conversion du m/z. Et maintenant, on retrouve souvent des systèmes combinés, du style HPLC/MS/MS couplé à un ordinateur et un logiciel en relation avec des banques de données protéiques.  [...] Ca sépare les protéines d'un mélange, ça les fragmente, ca donne le spectre de masse, l'ordi l'interprète et intérroge une banque de donnée pour savoir quelle protéine c'est, si elle est connue.  [...]

Génomique, Protéomique

Le problème est que l'article, malgré sa qualité, date de 1997, et qu'à la vitesse ou progresse la biochimie, je craint qu'il soit un peu dépassé. Il parlait déjà des couplages auto-HPLC/MS/MS et des appareils de Fourier à résonance cyclotronique qui fournissaient des résultats prometteurs en protéomiques ainsi que des logiciels de couplage direct à des banques de données de protéine, permettant une optimisation du temps de travail.  [...] Pour la protéomique, je suppose que les avancées sont bien plus lentes.Est-ce qu'il y a des techniques ou des logiciels qui ont été développés pour déduire la structure tertiaire des protéines à partir de leur structures secondaires ou primaires Les séquenceurs d'Edman ont-ils été améliorés pour augmenter le rendement qui était si petit.  [...]

[Biologie Moléculaire] Recherche d'une librairie protéine centrosome

Ton sujet m'a interessé donc j'ai fait une petite recherche préliminaire sur Expasy en criblant selon la localisation subcellulaire Centrosome et chez homo sapiens. Il en ressort 275 protéines rattachées au centrosome humain, ça peut permettre déjà de dégrossir.  [...] Edit. Dans l'empressement j'avais pas tout lu. Tu peux aussi simplement faire une recherche dans expasy avec le nom de ta protéine. Dans la fiche de ta protéine, il y a tout un tas d'informations dont les localisations subcellulaires. Toutefois, cet outil permet juste de dégrossir, si tu ne vois pas que ta protéine localise dans le centrosome sur Expasy, cela ne veut pas dire que ça n'a jamais été vu.  [...]

diagnostic prénatal technique

les séquences pathogènes connues ont été déterminées empiriquement et sont recensées dans des banques de données. On peut séquencer une protéine mais je ne suis pas sûr que ça se fasse beaucoup en diagnostique. De plus, passer d'une séquence de 20 lettres à 4 lettres implique plusieurs possibilités (cf code génétique).  [...] Pour le diagnostique, on fait souvent (je pense) des PCR suivies de séquençage pour un certain nombre de gènes connus pour être impliqués dans certaines maladies. Il existe aussi des puces à protéines (même principe que les puces à ADN pour caractériser les interactions protéiques).  [...]

Identification d'une protéine

J'ai une séquence d'ADN et je dois trouver quelle protéine elle code. J'ai donc traduit cette séquence en AA grace à un logiciel, puis j'ai cherché des homologies avec d'autres protéines sur cette base de données. http.//www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST.  [...] si tout ce passe bien lorsque tu blastes une proteine contre la base de données, le meilleur resultat qu'il te sort est la proteine elle meme (normal). C'est donc les resultats suivant qui te renseignent sur l'identité possible de cette proteine.  [...]

respiration de cheyne-stokes et l'insuffisance cardiaque

Je voudrais connaitre le lien qui unit la respiration de cheyne-stokes et l'insuffisance cardiaque. Je sais que 40-50% des personnes qui souffrent d'IC ont la respiration C-S. Mais pourquoi.   [...] Le centre respiratoire médullaire étant atteint soit pour des cause neurologiques, soit pharmacologiques soit dans l'ins cardiaque.   [...]