• Santé - Bactéries, Risque, ADN

[Microbiologie] Miniprep : impact de SDS/ NaOH à long terme sur la solution bactérienne

Nous avons fait une miniprep par lyse alcaline. Il y a une seule étape qui me pose problème, c'est lorsque l'on ajoute le SDS/NaOH (dont je connais le rôle) on observe un changement physique du milieu, translucide et plus visqueux. A ce moment on ajoute la solution de neutralisation de la basicité.   [...] L'ADN génomique des bactéries est ancré à la membrane. Cette manip permet de lyser les membranes et donc de purifier le milieu séparant alors membranes + ADN génomique et milieu + cDNA. Je pense que la tro pforte basicité du milieu couplé aux fortes charges du SDS risque de dénaturer le cDNA à la longue.  [...]

Bactéries : de l'ADN au dîner !

Lorsque les bactéries Escherichia coli se mettent à table, c'est pour manger... de l'ADN. Et elles en sont si friandes qu'elle peuvent même faire de l'ADN extracellulaire leur unique source de carbone et d'énergie.  [...] Les bactéries Escherichia coli vivent dans les boyaux des animaux à sang chaud, où elles aident à la digestion. Selon une étude à paraître dans l'édition de juin du Journal of Bacteriology, des chercheurs ont trouvé huit gènes chez ces bactéries leur permettant de consommer sans risque de l' ADN extracellulaire.  [...]

rDNA ou rRNA?

Sinon pour l'extraction, par exemple pour un profiling de bacteries, lorsque tu veux determiner quelles especes sont presentes a tel endroit, en fait tu extrais l'ADN total de tes bacteries, et apres tu fais une PCR (amplification de l'ADN) avec des amorces universelles des 16S des bacteries.  [...] Deja les genes qui sont transmis et gardes ne sont pas des genes essentiels, puisque les bacteries les ont deja et que cela leur suffit. Donc il n'y aura pas de transfert d'ADNr par exemple, et c'est aussi pour cela que la phylogenie construite a partir de cette portion d'ADN est relativement fiable.  [...]

PCR sur colonie après insertion chromosomique... ?

Tu n'es jamais sur de ce qu'il y a dans tes boites, il y a de nombreuses bactéries possédant des résistances antibiotiques, pour peu que tu ais manipulé du mieux possible mais qu'une bactérie qui ne vienne pas de ton étalement se soit retrouvé dans ta boite de pétri, tu as peut être une bactérie résistate a la kanamycine et qui ne vienne pas de ce que tu as transformé, qui se soit retrouvé en culture.  [...] deuxièmement, les mutations spontanées ça arrive, alors même si tu était en milieu stéril ++ et qu'aucunes bactéries externes ne s'est retrouvée dans ta boite, il y a tout de même un risque (très faibles, certes) que une de tes bactérie electroporée mais pour laquelle la transformation aurait pas réussi (donc qui ne contiendrai pas ton gène) se retrouve spontanément résistantes à la kanamycine (sans lien avec les résistances que tu insère avec ton ADN linéaire).  [...]

Collodictyon, un mystérieux protiste venu du fond des âges

Mais alors, avec quatre flagelles, où sont donc les collodictyons L'équipe norvégienne a mis l'organisme en culture en prenant soin de le nourrir avec des bactéries plutôt qu'avec des algues. Ces végétaux étant eux aussi eucaryotes, le risque était grand, lors de l'analyse de l'ADN, de ne pas parvenir à bien séparer les gènes des uns et des autres.  [...] Par exemple, expliquent-ils, s'ils retrouvent des bribes génétiques apparentés à certaines bactéries photosynthétiques, il y aura une trace des premières symbioses entre elles et les cellules eucaryotes, puisque c'est là l'origine des chloroplastes, siège de la photosynthèse chez les végétaux.  [...]

Problème, ADN bicaténaire, monocaténaire et bactéries ...

Pour les transformations ou transductions, l'ADN (qui pénétre dans la bactérie ou injecté par un phage) se retrouve à l'état monocaténaire linéaire. J'ai écrit dans mon cours que la transfo ou transduc se réalisais si il y avait zone homologue sur le génome de la bactérie.  [...] Les deux ADN doivent être issus de bactéries phylogénétiquement proche (%d'homologie inversement proportionnel à la distance phylo), et à partir d'un pourcentage d'homologie que je ne connais pas, la recombinaison est possible. Du coup, je suppose qu'au cycle de réplication suivant, tu as un ADN fils conforme à l'original (natif) et un ADN contenant la séquence nouvellement intégrée.  [...]

[Biochimie] La Replication de l'ADN durant l'Interphase

Des bactéries sont cultivées sur un milieu ne contenant que de l'azote lourd (15N) et sont ensuite modifiés par une technique d'extraction de l'ADN et de centrification, qui permetra de trouvé la densité des bactéries de ce milieu par une lumière ultraviolette. densité de 1.724.  [...] Je précise que dans cette première étape les bactéries sont cultivées pendant de nombreuses générations pour s'assurer que toutes les bactéries (ou presque) aient les deux brins avec de l'azote 15.  [...]

Expériences en génétique…

C'est ainsi que si on mélange des bactéries résistantes à l'antibio A et d'autres résistantes à l'antibio B, elles deviennent multirésistantes, c'est-à-dire que chaque bactérie est résistante aux deux antibiotiques.  [...] En biologie moléculaire, on utilise ces plasmides pour intégrer des morceaux d'ADN dans des bactéries rendues compétentes, c'est-à-dire perméables, l'ADN rentre tout seul dedans grâce à un choc électrique ou un choc thermique.  [...]

[2nde] L'ADN...

Moi j'ai pensé. La fonction initiale du fragment d'ADN est de multiplier le nombre de bactérie. Non elle n'est pas la même après transfert puisque ça a permis la multiplication de ces bactéries.  [...] Ce que vous décrivez est le protocole classique de transformation de bactérie. Ca ne change rien au problème. Votre but est bien de tester si les bactéries expriment la GFP (sinon je ne vois pas quoi d'autre). Or il se trouve que l'experience qui est réalisée avec les bactéries transformée (à savoir de les regarder à la lumière blanche) ne permet pas de répondre à la question.  [...]

La réplication

Cependant, comme vous pouvez le voir, j'ai des problèmes dans les noms (qui sont franchement pas commodes à mémoriser). si chez les eucaryotes on a Les ADN polymérase alpha, beta, gamma et delta, qu'en est il chez les procaryotes comme bactéries par exemple (j'ai vu que ce sont Adn polymérase I, II, et III, mais je ne vois pas leurs rôle respectif).  [...] si chez les eucaryotes on a Les ADN polymérase alpha, beta, gamma et delta, qu'en est il chez les procaryotes comme bactéries par exemple (j'ai vu que ce sont Adn polymérase I, II, et III, mais je ne vois pas leurs rôle respectif).  [...]