• Santé - Aval, Forme, ADN

[Biologie Moléculaire] Sens de lecture de l'adn...

Je viens de le lire texto dans un livre. L'extrémité 3' (un carbone du désoxyribose) du nucléotide en amont est liée au phosphate (5') du nucléotide en aval. Donc le dinucléotide formé se lit d'un 5' libre à un 3' libre, par extension l'adn se lit du 5' libre au 3' libre des deux extrémités.  [...] Le fait que les 2 brins de l'ADN soient anti-parallèles pose un problème à l'ADN-polymérase car, si elle se déplace dans le bon sens pour un brin, elle se déplace dans le mauvais sens pour recopier l'autre, ce qui oblige à des acrobaties complexes pour recopier ce brin par petits bouts dans le bon sens (fragments d'Okasaki).  [...]

Réplication

L'ADN polymérase agit elle en amont ou en aval de la fourche de réplication.  [...] en toute logique l'ADNpol doit agir en amont de la fourche de réplication. Si l'on considère que l'aval est encore sous forme double-brin et l'ADN situé en amont est simple-brin, l'ADNpol nécessite une matrice simple brin pour synthétiser le brin d'ADN complémentaire, elle agit donc forcément en amont de la fourche de réplication.  [...]

[Biologie Moléculaire] Gène et Promoteur

cette séquence n'est pas transcrite. L'unité de transcription a donc un point de départ situé en aval du promoteur. c'est le nucléotide à partir duquel la synthèse de l'ARN par l'AN polymérase s'initie. Le terminateur est une séquence qui marque l'arrêt de l'élongation de l'ARN polymérase et la dissociation de l'hybride ARN-ADN qui s'est formé dans la bulle de transcription (le phénomène de transcription découle de l'appariement des bases azotées du brin matrice d'ADN et du brin en synthèse d'ARN).  [...] Le fait d'avoir un seul promoteur par unité de transcription permet une régulation plus fine de chaque gène individuellement, tandis que l'organisation de gènes en tandem appelés opérons dans le domaine des procaryotes permet d'organiser le génome en modules fonctionnels et de s'adapter rapidement à des variations de l'environnement (disponibilité de substrat,...).   [...]

[Biologie Cellulaire] Duplication de l'ADN en phase S

Mais la question que je me pose est. quel est ce lycée où l'on étudierait en détails la réplication de la forme A de l'ADN sachant que la plus commune est la forme B.  [...] Au sujet de l'adn A, ce que j'ai dit est faux apparament de toute façon, mais j'ai cru comprendre que c'était la forme que prennais l'adn en dehors d'une solution aqueuse donc après extraction quoi et que c'était la première forme découverte d'ou le A..et qu'ensuite on avait découvert la forme d'adn dans la cellule à la quelle on a donné le nom d'adn B.  [...]

sensibilité de OriC à la méthylation pour l'opéron tryptophane

- C'est là qu'intervient la protéine SeqA qui va se fixer aux GATC hémiméthylés, former des complexes et séquestrer le chromosome. En plus, SeqA est capable de se lier à la membrane, bref tu imagines la suite.  [...] Puis, c'est le complexe MutS+ATP – ADN - MutL qui permet le recrutement de l'endonucléase MutH. Il y a formation d'une sorte de boucle qui rapproche les 2 sites GATC non méthylés situés en amont et en aval du mésappariement.  [...]

[Biochimie] Topoisomerase et hélicase

Pour comprendre le pourquoi du comment, une expérience facile à réaliser chez soit. Prendre deux ficelles et les entortiller ensemble sous la forme d'une double hélice. Une fois la double hélice formée, fixer une des extrémités de la double hélice (à l'aide d'un poids ou autre), à l'autre extrémité, séparer les deux ficelles en tirant dessus.  [...] Une autre topoisomérase (TopIIa) est impliquée dans la relaxation de la molécule d'ADN lors des premières étapes de la mitose où la molécule d'ADN est compactée pour former les chromosomes mitotiques. Cette compaction elle aussi créée des supertours et la topoisomérase sert au relâchement de ces supertours, là encore elle évite la cassure.  [...]

Topoisomérase , hélicase

Les topoisomérases utilisent de l'énergie pour couper des brins d'ADN superenroulés afin de les dérouler et/ou de les enrouler dans l'autre sens. Elles résolvent un problème de topologie de l'ADN, qui sont notamment créés par les hélicases.  [...] tandis que l'hélicase (qui intervient juste aprés topoesomérase) va ouvrir la chaine déroulée donc il va engendre la formation de l'oeil de réplication.  [...]

[Génétique] quel est le but du clivage

T1, ça me tenait vraiment à coeur de répondre à cette question parce que personellement j'adore la polyadénylation, je trouve que c'est quelque chose de vraiment cool =).   [...] Donc déja avant tout ça ne se déroule que chez les ARNm de vertébrés, ya donc dans ces ARNm une séquence consensus AAUAAA à proximité de l'extrémité 3' sur laquelle se fixe un facteur de clivage Cpsf et un peu en aval de celle-ci un facteur Cstf qui va se fixer sur une autre séquence consensus GU et qui va stimuler le dit-clivage (clivage=coupure de l'ADN au cas ou t'avais pas capté).  [...]

[Biochimie] Problème d'amorces

On me demande de proposer des amorces qui permettent d'amplifier la séquence de l'éxon 3 (en Majuscule), les amoces (de 20 nucléotides) devront être posées sur les séquences introniques (en amont et en aval). Seulement, j'ai appri que l'ADN polymérase synthétise de l'ADN dans le sens 5'-.  [...] En terminal, je n'était pas excéllent en biologie, je débute ma premiere année, je n'ai pas encore les réflèxes nécessaires...alors j'ai d'abord penser que, comme on effectuait un PCR, les ADN sont forcément doubles brins. Je n'ai pas pensait au fait qu'on parlait de gène, et que l'ADN est donc double brin. Merci pour l'info.  [...]

[Biologie Moléculaire] the Genome walking method

bjr, j'ai besoin d'aide concernant the Genome walking method. particulièrement interessée par protocol for the GenomeWalker kit by Clontech.   [...] la marche sur le chromosome est une technique permettant le séquençage des régions amont et aval d'une séquence connue d'ADN.  [...]