• Santé - ARN, Extraction, Variables, Matériel

[Biologie Moléculaire] nombre de cellules

Bonjour à tous, je voudrais savoir combien d'ARN et donc combien de cellules environ (combien d'ARN contient une cellule) est nécessaire pour une manip de PCR quantitative, merci de vos réponses.  [...] Les rendements en ARN totaux après extraction sont très variables selon le matériel envisagé.  [...]

[Biotechnologie] Tampon de lyse

Ce tampon intervient directement après le lavage des cellules (bactéries ou cellules humaines), et à pour rôle de les détruire. Suivant ce que l'on veut faire ensuite (extraction protéines, ADN et/ou ARN), la composition du tampon varie, mais il contiendra généralement un détergeant afin de briser la membrane cellulaire et d'autre composants, également variables, mais aussi des sels et un pouvoir tampon au pH désirée.  [...] Bref, la composition du tampon de lyse est (très) variable suivant la manip' que l'on réalise, mais son rôle est généralement d'extraire notre produit en détruisant la cellule.  [...]

question d'ARN

Dans la courbe a. Les ARN peuvent etre de taille très variables, les petits ARN sont ceux tout juste initiés, les grands sont ceux dont la transcription arrivait a son terme.  [...] pour la courbe B. Les ARN sont plus courts, cela montre qu'il y a eu l'epissage pendant l'heure d'incubation sans radioactivité.  [...]

identification bactérienne en qq heures

Techniquement il doit etre possible de créer des amorce PCR spécifique d'une espèce bactérienne, que se soit sur le 16S ou même des marqueurs alternatifs type ARN polymérase. Et là on évite les problèmes de prélevement polymicrobien. Si on met bout a bout la PCR (3H), une étape de restriction enzymatique pour vérifier si on a le bon fragment (1H) et le gel d'électrophorèse pour voir tout ça (1H) ca fait 5H.  [...] En effet, comme il l'a déjà été dit, il faut savoir quelle espèce on recherche, un peu comme un test par immunodetection. De plus les conditions de PCR directement sur colonie ou milieu liquide (sans extraction d'ADN) sont souvent variables d'une espèce à l'autre.  [...]

biologie cellulaire, transcription ARN

La fixation et l'activation de l'ARN polymérase sont contrôlées par des facteurs de transcription (éléments trans-régulateurs) qui se fixent au niveau de séquences cis-régulatrices spécifiques appelées enhancer et silencer, situées à des distances variables du site de démarrage de la transcription.  [...] Pour compléter d'un autre point de vue, la transcription se fera bien par l'action de trans-régulateurs (les facteurs de transcription protéiques) sur des séquences cis-régulatrices du promoteur (séquences d'ADN). Les séquences du promoteur peuvent être des silencer et être reconnus par des facteurs de transcription inhibiteurs, ou des séquences enhancer et recruter alors des facteurs de transcription activateurs.   [...]

Discussion | Dossier

Dans cet objectif, nous avons testé comme matériel cellulaire les granulocytes neutrophiles, une suspension composée de lymphocytes et de monocytes et enfin un modèle utilisant le sang total. Les expérimentations mises en oeuvre se sont faites avec différents temps d'incubation et avec des concentrations variables en activateur.  [...] Pour prendre en compte cette hypothèse, nous avons incubé les cellules avec des concentrations variables en acide arachidonique. Nous avons pu mettre en évidence une activation de la transcription et de la traduction de la COX-2 pour des concentrations supérieures à 20µM.  [...]

empreinte à la DNase I

.. la différence aurait été réalisée pendant la culture des bactérie j'aurai pu imaginer un influence de la température sur la conformation des protéines. mais là au niveau de la migration je ne vois que modérement l'interet.   [...] oui j'ai remarqué ca doit etre dû à mon avis à des difficultés soit de quantifier la quantité de RNAp soit de normaliser sa concentration (version mutée ou non, s'il avaient pu indiquer des concentrations précises ils l'auraient fait non) soit au principe du best results are shown et que ca marchait mieux avec plus ou moins d'ARN pol.  [...]

[Zoologie] Analyse de données sur des phoques :)

Il me semble que les classification qu'on obtient ont des degrés de robustesse variables entre branches, et qu'on doit pouvoir quantifier la cohérence entre deux arbres obtenus par des méthodes différentes (je suis pas phylogéniste, mais ça me paraît correspondre à des trucs qu'on retrouve dans la littérature).  [...] Je n'ai pas dit que l'ACP ne permettait pas d'utiliser des variables corrélées. Mais je me demande à quel point ce qu'il en sort signifie quelque chose quand une variable est structurellement dépendante d'une autre (imaginons que nous ayions un pourcentage d'eau, un pourcentage de matière sèche.  [...]

Le rapport Campbell ; Découverte majeure ou manipulation de données scientifiques ? - Page 2

Son extraction demande du matos et des ressources intellectuelles pour l'utiliser qu'un autre animal aurait bien des difficultés à mettre en route. Donc, pas étonnant que l'homo sapien soit le seul à consommer du lait en dehors de l'allaitement.  [...] he final model included the basic model plus paternal and/or maternal family history of cancer, smoking habits, alcohol intake, and female variables (age at menarche, pregnancies, menopausal status, use of hormone replacement therapy, and oral contraceptives).  [...]

[Microbiologie] séquençage de l'ARNr

Le gène codant pour l'ARNr 16S est très conservé chez les Procaryotes, ce qui signifie que ce gène a un haut degré de similitude chez tous ces organismes. Il est donc possible d'utiliser des primers spécifiques de ces séquences pour amplifier par PCR les séquences variables, situées entre deux séquences conservées.  [...] Il est donc possible d'utiliser des primers spécifiques de ces séquences pour amplifier par PCR les séquences variables, situées entre deux séquences conservées.  [...]