• Santé - Analyse, Image, Méthode, Cellules, Moyenne

Analyse d'image (ImageJ ou autre)

Bonjour je voulais savoir si quelqu'un savait analyser une image grâce à imageJ (ou autre). J'ai une coupe d'un tissu et j'ai besoin de connaitre la surface moyenne des cellules qui ont été mises en évidence par un anticorps, elles sont plus foncées que le reste du tissu mais bon l'espace intercellulaire apparaît lui aussi plus foncé et parfois les cellules sont proches si bien qu'on ne peut pas les différencier, il y a aussi des accumulations de colorant ci et là qu'il faudrait rejeter.  [...] Je voulais donc savoir si quelqu'un s'y connaissait en analyse d'image pour m'aider à trouver une méthode adéquate pour sélectionner automatiquement les cellules intéressante afin de calculer leur aire moyenne.  [...]

densité optique

Je m'adresse tout particulièrement à ceux qui ont l'habitude de mesurer les densités optiques des taches de leur western blot avec des logiciels sur PC.   [...] Voilà quand j'analyse (avec image pro plus v4.4) les images scannées, le logiciel me renvoie une densité moyenne par tache... sans me dire évidemment comment il s'y prend pour ariver à ce résultat. Personnellement je voudrais normaliser ce chiffre par rapport à un niveau de noir maxi par exemple, histoire de pouvoir comparer non seulement les taches entre elles, mais aussi les films.  [...]

D3 system : diagnostiquer un cancer avec son smartphone

Le D3 est ainsi capable de mémoriser dans une seule image les informations moléculaires de plus de 100.000 cellules dans un échantillon de sang ou de tissu. Ces informations peuvent ensuite être transmises pour analyse à un serveur à distance, capable de produire des graphiques et ce via un réseau crypté.  [...] Un test pilote du D3 avec des lignées de cellules cancéreuses a permis de détecter la présence de protéines tumorales avec une exactitude et une précision équivalentes aux meilleurs systèmes actuels d'analyse moléculaire, selon ses inventeurs. Le D3 peut ainsi effectuer l'analyse simultanée de plus de 100.000 cellules.  [...]

culture d'explant

la culture d'explant. de petit fragment de tissus vont être placé dans une boite de culture et recouvert de milieu nutritif. Après quelques jours, des cellules vont migré de l'explant (image à voir ) et qui vont se mettre à proliférer. Il sera alors possible de récupérer ces cellules et de les soumettre à des analyses extérieures.  [...] Lors de l'embryogenèse, la mise en place de tous les organes ne nécessite pas de courant électrique pour faire se déplacer les cellules et se positionner aux bons endroits.  [...]

L'Homme de Néandertal aussi avait des tumeurs

Morceaux de côtes d'Homme de Néandertal. Celui du dessus (a) présente un creux en son centre, ce qui a conduit les auteurs à l'analyser plus en détail. Les résultats d'imagerie suggèrent que cet os aurait contenu une tumeur bénigne. Monge et al., Plos One.  [...] Dans cette étude, les auteurs ont utilisé une technique d'imagerie appelée microtomographie aux rayons X. Cette méthode consiste à couper l'image d'un objet en de très nombreuses sections, qui peuvent ensuite être analysées individuellement. Dans ce cas précis, un bout de côte néandertalienne de trois centimètres environ a été divisé en presque 500 fractions étudiées par les anthropologistes.  [...]

[Evolution] Apparition multiples de la vie ?

Pour reprendre une image que le chimiste belge Jacques Reisse utilise dans ses conférences, si une cellule actuelle était une voiture moderne (on prend souvent l'exemple d'une Ferrari), l'analyse phylogénétique à travers la définition du concept de LUCA, c'est comme d'essayer de simplifier les pièces du véhicule jusqu'à se retrouver avec une Ford T, ou à la rigueur, le fardier de Cugnot.  [...] Or, la première cellule, dans notre analogie, ressemblait plus à une calèche et on n'a aucun moyen, en simplifiant une Ferrari, de s'imaginer qu'à l'origine, il y avait des calèches.  [...]

Quel Master Bioinformatique choisir ?

Mais ils font aussi beaucoup d'analyse de données médicales en partenariat avec le pôle de néphrologie/urologie. Pour finir il y aussi une demande dans l'analyse d'image, notamment sur le développement d'embryon. Je suppose que le master est donc orienté vers ces thématiques (sauf l'analyse d'image bizarrement mais certains se perfectionnent en stage).  [...] Je me suis posée énormément de questions au cours de ma scolarité... et encore maintenant xD Je pense qu'une bonne méthode pour se renseigner est de chasser les gens - comme j'aime bien dire - sur LinkedIn. Tu tapes le nom d'une formation dans la barre de recherche et tu auras accès à des quantités de gens qui auront vécu ladite formation.  [...]

Utilisation Image j

Seulement voila le prof veut une analyse de l'image en pourcentage, avec image J, du champ récepteur.  [...] Quelqu'un pourrait me donner le protocole à appliquer pour pouvoir obtenir le pourcentage de la zone grisée sur chaque patte sur les photos ci-jointes.   [...]

Mémoire : la méthode des lieux (légende de Simonide) | Dossier

Avec le culte des eaux de Mnémosyne à Olympie, les Grecs cherchaient déjà des moyens d'améliorer leur mémoire. Une autre découverte, qui eut un retentissement dans les siècles suivants, le montre également. C'est la légende de Simonide et la découverte de la première méthode pour la mémoire. la méthode des lieux.  [...] Cette méthode consiste à coder en images les éléments que l'on doit apprendre, et à placer chacune d'elles dans un lieu selon un itinéraire bien connu et représenté mentalement. Pour rappeler tous les éléments dans l'ordre, il suffit de refaire mentalement le trajet et de découvrir l'image qui a été placée en chaque lieu.  [...]

L'oreille et son analyse temporo-spatiale du pattern cochléaire | Dossier

Comme chaque capteur n'occupe qu'une portion de surface, l'analyse de la forme membranaire cochléaire comporte un fractionnement de l'image, une fragmentation bidimensionnelle pour les CCE (mosaïque), linéaire pour les CCI (assimilable à un peigne de Dirac).  [...] Au total, l'oreille est un convertisseur analogique-digital qui analyse les formes acoustiques membranaires au moyen d'un échantillonnage spatio-temporel, les cellules de Corti formant le relais interface.  [...]