• Santé - Analyse, Génome, Bactérie

protéine de bactérie

elle doit avoir de nombreuses autres protéines essentielles cette bacterie. en vrac toute la machinerie de replication de l'ADN et de transcription, toutes les protéines impliquées dans la traduction etc.  [...] En fait, je t'explique, je suis en L3 bioinformatique, notre travail ici consiste a étudier une séquence d'environ 1000 nucléotide provenant du génome de la bactérie Scabies.  [...]

Une bactérie bénéfique pour la conservation de la viande

Une équipe de chercheurs de l'INRA a séquencé le génome de la principale bactérie vivant sur la viande et le poisson frais. Lactobacillus sakei. Cette bactérie, utilisée couramment en Europe pour la fermentation des produits carnés comme le saucisson sec, montre des propriétés qui pourraient être utilisées également pour une meilleure conservation de la viande fraîche (ou du poisson), en préservant sa qualité microbiologique.  [...] Une équipe de chercheurs de l'INRA a séquencé et analysé le génome de Lactobacillus sakei afin de répondre à une question principale. quelles sont les fonctions importantes, codées par ce génome qui permettent d'expliquer que cette bactérie soit si bien adaptée à la viande.  [...]

L'amibe : un lieu de rencontre pour les bactéries intracellulaires

De nombreuses bactéries vivent au contact des cellules d'animaux. Certaines, intracellulaires strictes, ne peuvent pas se multiplier en dehors des cellules qu'elles parasitent et sont responsables de maladies humaines, comme Chlamydia trachomatis pour les infections génitales, ou Rickettsia prowazekii qui cause le typhus épidémique.  [...] Avec l'aide du Génoscope, les équipes de Didier Raoult et de Jean-Michel Claverie ont déterminé et analysé la séquence complète du génome de la bactérie intracellulaire Rickettsia bellii. Ils y ont découvert de nombreux indices de transfert de gène entre cette bactérie et d'autres bactéries intracellulaires, Legionella pneumophila (l'agent de la dangereuse pneumonie des légionnaires) et Protochlamydia amoebophila (proche de Chlamydia trachomatis ).  [...]

Le génome d'une bactérie "insecticide" décrypté

Le génome de Photorhabdus luminescens, une bactérie pathogène d'insectes vivant en symbiose avec un ver (nématode), vient d'être entièrement séquencé par une équipe de l'Institut Pasteur (associée au CNRS). Son analyse, publiée dans Nature Biotechnology (E.  [...] Rien d'étonnant donc à ce que les chercheurs aient identifié des gènes de toxines susceptibles de tuer de nombreux insectes. Mais il faut préciser qu'aucun génome bactérien aujourd'hui séquencé n'avait permis de trouver autant de gènes de toxines entomopathogènes.  [...]

Choléra : trois mutations rendent la souche haïtienne plus virulente

Une étude de la Northwestern University (Evanston, États-Unis) vient d'analyser le génome d' altered El Tor et y a peut-être trouvé la réponse. Selon les scientifiques, trois gènes à l'origine des toxines bactériennes ont muté et changent le comportement infectieux de Vibrio cholerae.  [...] Le génome de la bactérie a été scruté de près. L'analyse révèle quelques étrangetés intéressantes. D'abord, la principale toxine responsable de la diarrhée causée par le choléra a acquis des changements qui la rapprochent beaucoup plus des formes retrouvées dans les épidémies du début du XIX e siècle, connues pour leur agressivité.  [...]

La bactérie du désert se cale sur le cycle de l'eau

Les scientifiques ont ensuite effectué une analyse du génome de la bactérie du désert, ce qu'il leur a permis de découvrir qu'elle possède le gène kaiC. Ce gène et sa fonction sont connus chez les bactéries photosynthétiques. il code pour une ATPase contrôlant le rythme circadien endogène.  [...] Cette protéine s'active et se désactive cycliquement toutes les 24 heures, infligeant à la bactérie un rythme calé sur celui du soleil. Même si ce gène a été identifié chez des bactéries non photosynthétiques, sa fonction est toujours inconnue.  [...]

Une bactérie intestinale mangeuse de cholestérol

Tapie dans le colon, au milieu de milliers de milliards de congénères qui nous aident à digérer, cette bactérie transforme le cholestérol en coprostanol, une molécule que l'intestin n'assimile pas et qui est évacuée dans les selles. Une équipe du laboratoire d'Ecologie et Physiologie du Système Digestif (Inra, Jouy-en-Josas), vient de lui donner un nom. Bacteroides dorei.  [...] L'équipe a pu isoler la bactérie à l'origine de cette activité et déterminer qu'elle appartient au genre Bacteroides, très commun dans l'intestin où il représente environ 20 % des espèces. L'analyse génétique a rapproché la bactérie de l'espèce B. dorei, l' analogie des deux génomes atteignant 99,5 %.  [...]

Les microbes aériens, nouvelle marotte de Craig Venter

La phase pilote de son Air Genome Project, dirigé par le Craig Venter Institute et financé à hauteur de 2,5 millions de dollars par l'Alfred Sloan Foundation, consiste en une station de prélèvement portative placée sur le toit d'un immeuble de Manhattan dont l'emplacement a été tenu secret.  [...] Capable de filtrer 1400 mètres cubes d'air par jour, l'appareil doit permettre de récolter des milliers d'échantillons de microorganismes dont le génome sera ensuite analysé par les même techniques que celles utilisées pour le Human Genome Project. Car si les particules atmosphériques polluantes font l'objet d'une surveillance importante dans les zones urbaines, on ne dispose que de peu d'informations sur les bactéries et virus qui s'y promènent.  [...]

[Evolution] Variations sur un thème de synthétase...

1) Dans le but d'étudier la répartition de ces 2 mécanismes, une étude est menée par a) analyse de séquence pour les bactéries dont le génome a été séquencé, et b) par PCR dans les autres cas.  [...] Je pense que l'analyse des séquences de chaque gène au sein de l'ensemble des bactéries au génome séquencée permet de repérer les régions les plus conservées, ce qui permet de dessiner les oligos sur ces régions. Ainsi, il est possible de rechercher tel ou tel gène par PCR dans les organismes étudiés en étant relativement confiant lorsque l'on a un résultat positif en PCR (une bande à la bonne taille).  [...]

Maladies nosocomiales : séquencer le génome bactérien pour les contrer

le séquençage du génome des bactéries. Autrement dit, l'analyse détaillée de leur ADN. Ils ont testé grandeur nature leur stratégie. Les résultats parus dans Science Translational Medicine semblent prometteurs.  [...] Selon eux, à l'avenir, le séquençage de génome en temps réel de ce type de bactérie pourrait devenir un outil de choix pour améliorer le contrôle des épidémies nosocomiales.  [...]