• Santé - Amorces, ADN, Plante

[Biologie végétale] pcr : LP/RP et LB/RP pour une plante

Je m'arrête là dans mon blabla et te propose ce schéma qui illustre les trois possibilités de génotype pour ta plante et ce qu'il se passe pour chacune selon les amorces. Tu me dis si tout ça prend du sens.  [...] PS. je précise que les amorces dessinées en losange/carré/rond c'est de la vulgarisation pour montrer un genre de puzzle, en vrai on va parler d'hybridation/appariement entre les nucléotides des amorces et ceux de l'ADN de la plante.  [...]

[Biologie Moléculaire] Réplication de l'ADN chez les eucaryotes SOS

Il y a certaines choses qui me paraissent peu claires dans cette partie. Quand il est écrit elle retire les bases dans le sens 5'3' les bases dont il est question sont bien celles de l'amorce d'ADN (réplication terminée) Car d'après ce que je sais si cette enzyme a une fonction exonucléase 5'3' c'est qu'elle permet de dégrader les amorces d'ARN et de les rendre en amorces d'ADN, le champ d'action de cette enzyme est donc avant la réplication puisque les amorces après la réplication ne sont plus d'ARN mais d'ADN.  [...] En plus clair la dernière question correspond au fait que dans la synthèse d'ADN chez les procaryotes l'exonucléase 5'3' n'a que la fonction de dégrader les amorces d'ARN et c'est l'ADN pol I qui les synthétisent en amorces d'ADN (d'après mon cours), donc ce que je voudrais savoir si en fait ma pensée est juste.  [...]

[Biologie Moléculaire] ADN Polymérase alpha delta epsilon

L'ADN pol alpha peut synthétiser les amorces ARN (primer) et les allonger sur le brin à synthèse discontinue de l'ADN naissant. Pour le brin à synthèse continue le complexe ADN polymérase delta/PCNA synthétise le brin d'ADN.  [...] -Soit alpha synthétise les amorces ARN et les allonge sur le brin à synthèse discontinue de l'ADN naissant. Pour le brin à synthèse continue le complexe ADN polymérase delta/PCNA synthétise le brin d'ADN (PCNA est une protéine qui augmente fortement la processivité).  [...]

[Biologie Moléculaire] Réplication

Si les ADN polymérases réalisent les liaisons phosphodiester, alors à quoi servent les ligases A ressouder les amorces remplacées par de l'ADN à l'ADN préexistant.  [...] de ce que j'en sais, l'ADN ligase sert surtout à fermer les césure finales. Une fois que toutes les amorces ARN ont été éliminé suite au passage de l'ADN polymérase, cette dernière se détache et l'ADN ligase se fixe pour finir les brins. (Donc surtout en fin de réplication je pense, après il y peut être cette relation avec les amorces, je regarde de ce côté là.).  [...]

[Biologie Cellulaire] Quelle est la définition de la vie ? - Page 2

Alors si un virus est vivant, quand est-il de mes fragments d'ADN que je mélange avec l'ADN polymérase et des amorces pour faire ma PCR.  [...] De plus, techniquement si je prends l'ADN d'E.coli dans un tube et je rajoute mon ADN polymérase (et deux-trois autres ingrédients), je le reproduis également. Mais elle est capable de réplication autonome, pourtant.  [...]

Problème de PCRs

Peut être certaine personne ont rencontré le même problème que moi et pourront m'aider. Je travaille sur de l'ADN environnemental extrait avec le kit DNA plant mini kit de Qiagen. Sur cet ADN je voudrais amplifider le 16s/18s et ITS. Pour le 16s j'ai utilisé les amorces 16s8f (5'-AGAGTTTGATCCTGGCTCAG-3') et 16s1541r (5'-AAGGAGGTGATCCAGCCGCA*-3') et pour ITS.  [...] Il pourrait s'agir d'inhibiteur autres (pipette, paillasse), je ne sais pas trop. AU départ je soupconnais la Taq de n'être pas aassez robuste donc maintenant je prends la taq platinum de invitrogen mais j'ai toujours ces problèmes. La première PCR semble marcher mais les autres ensuite ne marche plus.   [...]

Synthèse du brin retardé d'ADN

-L'ADN polymérase I sert à dégrader les amorces d'ARN grâce à son activité 5'3' exonucléase et les remplacer par de l'ADN grâce à son activité polymérase.  [...] A quel moment intervient la ligase Avant on après le remplacement des amorces ARN par de l'ADN Obtient-on d'abord un brin hybride ADN/ARN pour ensuite faire intervenir l'ARN polymérase I et obtenir un brin d'ADN.  [...]

[Génétique] Extraction, purification et analyse d'ARN (Nanodrop et bioanalyser)

Voilà, je me demandais si on utilisait des amorces ADN Dans le cas où on utilisait des amorces ARN, il faudrait les dégrader et les substituer par de l'ADN La Taq pourrait-elle faire cela.  [...] Pour les PCR classiques on utilise toujours des amorces ADN. C'est plus facile a synthétiser et a manipuler. In vivo pour la réplication il y a synthese d'amorces ARN par la primase qui sont ensuite remplacées par de l'ADN mais en PCR il n'y a pas de raison.  [...]

[Biologie Moléculaire] Pcr

Alors, pour synthétiser le brin complémentaire pendant la PCR, il faut des bases azotées (dNTP, les mono-nucléotides), des amorces pour ne répliquer qu'une partie de l'ADN (qui doit correspondre à la partie que tu veux explorer), et un milieu favorable pour que les enzymes de réplication fonctionnent bien (c'est le buffer, qui contient souvent du MgCL2).  [...] Le principe de la PCR c'est la copie d'un gène par une enzyme. une ADN polymérase, la Taq polymérase. Elle s'accroche à des amorces (en anglais. primers) qui définissent les deux bouts du gène. Ces amorces sont de petites séquences de 20 nucléotides en générale qui s'accrochent par complémentarité à l'ADN.  [...]

Rt-pcr

je travaille actuellement dans un labo d'analyse et travaille sur la mise au point d'un protocol de détection des allergenes alimentaires par RT-pcr et j aurais voulu savoir quelles etaient les concentrations optimum rn MgCl2 et en amorces pour l'amplifaction d'ADN de plantes(exp blé, soja...).  [...]