• Santé - Alignement, Comparaison, Bac, Phrase

[Biologie Moléculaire] BAC alignement

Je lis un article scientifique sur le réarrangement du génome et je suis bloquée sur un point où ils utilisent des BAC pour comparer des séquences. En fait j'ai pas eu beaucoup de cours à se sujet et j'arrive pas à comprendre la méthode donc je viens demander votre aide.  [...] Je comprends pas du tout lorsqu'ils disent paired BAC end sequences from sperm DNA... ça veut dire qu'il prennent uniquement des séquences terminales Je sais pas comment marche un alignement ou comparaison de séquences avec des BAC et donc j'arrive pas à comprendre la phrase.  [...]

[Biochimie] Logiciel anagène

c'était pour savoir en TP bac comment savoir sur le logiciel anagène si l'on doit faire une comparaison simple ou avec alignement entre deux séquences nucléotidiques Et comment le justifier.  [...] Beh réfléchissons. dans quels cas avez-vous fait l'une des comparaisons et dans quel autre cas, l'autre type de comparaison Est-il pareil que de comparer des organismes très proches (ie, très peu de changements a priori) entre eux et comparer des organismes plus éloignés.  [...]

Eve mitochondriale ?? - Page 2

Plus sérieusement, je ne vois pas ce qu'apporterait de plus d'analyser l'alignement d'ovules ou spermatozoïdes d'un même individu par comparaison à l'alignement du génome Pan paniscus et Homo sapiens.  [...] si tu compares deux séquences homologues (disons pour fixer les idées la séquence de la globine alpha) de deux humains tirés au hasard, les différences éventuelles résultent des mutations accumulées durant toute l'histoire des lignées de ces deux humains depuis qu'elles ont divergé, ce qui peut représenter des milliers de générations (ou juste une si ce sont deux frères).   [...]

Question métier ?

Je vais devoir choisir une filière pour ma licence en biologie qui me mènera par la suite au master, seulement, j'aimerai entendre l'avis de certains enseignants et/ou chercheurs travaillant dans différents domaines afin de prendre connaissance de ce que sont concrètement les métiers, le quotidien de chacun en fonction des filières.   [...] - collecte des séquences du gène chez différentes espèces, alignement et comparaison. détermination des zones conservées. réalisation d'arbre phylogénétique. determination du rôle des zones conservées et non conservées. listage des conséquences déjà observées.  [...]

[Génétique] Terme scientifique pour comparaison des séquences d'ADN

J'entends par là que l'alignement est un procédé qui permet la comparaison. Or je cherche le terme scientifique qu'on utilise pour parler de comparaison de séquences d'ADN.  [...] http.//bioweb.pasteur.fr/ qui montre qu'il n'y a pas de terme pour parler de comparaison de séquences d'ADN, on parle directement d'alignements.  [...]

Gingivite et poche parodontale : des maladies parodontales répandues | Dossier

Elle trouve son origine dans le développement des bactéries présentes dans la bouche. Ce phénomène peut être amplifié chez les adolescents porteurs d'appareil orthodontique, par un mauvais alignement des dents qui enserrent les bactéries et qui favorisent donc la plaque dentaire.  [...] Le traitement consiste à pratiquer un détartrage mécanique ou à l'aide d' ultrasons qui soigne de manière réversible la gingivite.   [...]

sujet pour programmation bio informatique

L'alignement de séquence, d'un point de vue programmation je le trouve sympa parce que pas hyper compliqué en soi, mais juste assez prise de tête pour être motivant, le truc final est pas simple a visualiser au tout début du programme ducoup tu le refond deux trois fois avant d'avoir quelque chose de potable et à la fin c'est class' e plus tu peuxfacilement trouver d'autres trucs simples à ajouter dedans pour impressionner un peu ^^ genre bon a la base il fait ca mais j'ai voulu aller plus loin, et il offre aussi la possibilité de donner à l'utilisateur ca, et ca et ca.  [...] Merci pour toutes ces infos, compte tenu de ces elements le sujet proposé par @minushabens me semble plus adapté. Mais je vais garder sous le coude l'alignement de séquences et la détermination d'amorces pour m'initier au domaine dès que j'aurai l'occasion.  [...]

[Biologie Cellulaire] Cytométrie en flux

Ce qui se conçoit bien s'énonce clairement, et les mots pour le dire arrivent aisément, disait je crois Descartes il y a fort longtemps. Comme il a raison. Et comme tu devrais t'en inspirer pour rédiger ta demande.   [...] Dans tous les cas il est difficile de faire des comparaisons sur de quantifications d'un labo à l'autre. Pour toutes les raisons citées plus haut plus le fait que les machine ne présentent pas les mêmes sensibilté, les différences de réponses des PMT, l'alignement des lasers ect.  [...]

[Biologie Moléculaire] Equivalent de Vector NTI

Je vais tester clustal pour les alignements de séquences. pour le moment j'utilise un logiciel de chez GATC, vu que je fais séquencer par cette société.  [...] Si vous êtes un expert de ce logiciel et si vous commaissez parfaitement les fonctions.Cloning. Primer Design. Multiple sequence Alignement. Assembling Contigs contactez nous rapidement afin que nous en discutions.  [...]

[Biochimie] Outils informatiques

J'imagine cependant que l'on peut réaliser des alignements locaux avec BLAST et plusieurs séquences en lui donnant une banque uniquement constituée de nos cibles (j'y ajouterai quand même quelques protéines non relevantes histoire de voir la pertinance des résultats).  [...] Ce n'est pas forcément parce que BLAST du NCBI ne trouve aucun alignement qu'il n'y a rien à trouver. C'est peut être parce que les paramètres par défaut ne lui permettent pas de trouver quoi que ce soit. Dés lors il faut bricoler... Ca se complique.  [...]