• Santé - ADN, Signal, Protéine

[Biotechnologie] Global Analysis of Protein Activities using proteome chips

Mais si tu dois te lancer dans l'étude de puces protéomiques (ou autre), je te conseille vivement de lire la revue de Zhu et al. de 2012 intitulé Applications of Functional Protein Microarrays in Basic and Clinical Research dont j'ai donné le lien précédemment ( http.  [...] En gros, la séquence d'ADN codant pour la protéine d'intérêt est fusionnée à une séquence signal (GST), puis des levures sont transfectées par le plasmide. Donc production de la protéine correctement modifiée et conformée (la protéine d'origine provient de la levure).  [...]

clonage overlap... problème

Je dois réaliser un clonage overlap et je suis complètement perdu... En gros, je dois insérer le tag mcitrine entre le peptide signal et le reste de la séquence de ma protéine.  [...] Comment est-ce que je peux identifier la séquence d'ADN correspondant au peptide signal de ma protéine (je connais le peptide signal mais je ne sais pas comment identifier quelle partie de la séquence d'ADN correspond à ce peptide signal). Est-ce que je dois faire un blastx.  [...]

L'influence de l'environnement sur le phénotype : besoin de conseils de méthode !

Proposition de la question 2. Lorsque le milieu n'est pas composé de glucose, c'est le lactose qui est consommé par la bactérie. Un signal chimique active ensuite une protéine ( CAP ) du cytoplasme. Elle peut alors se lier à l'ADN au niveau d'une séquence particulière située avant le gène lac nécessaire à l'exploitation du lactose.  [...] La liaison qui lie la protéine CAP avec l'ADN entraîne une déformation de la molécule d'ADN ( on observe une courbure de 80° ). Cette dernière favorise la fixation de l'ADN polymérase et donc la transcription du gène lac. Cette transcription va entrainer cette même action sur les gènes lacY et lacA de la protéine.  [...]

[Biochimie] "questions d'AA et de paires de bases" biologie cellulaire

On ne parle de codon que pour l'ARNm. La méthionine codée par le codon d'initiation est présente dans la protéine.Le codon stop ne code pour rien, il ne correspond à aucun acide aminé, c'est juste un signal d'arrêt de la traduction. Pour l'ADN on ne parle pas de codon non plus.  [...] Mais tu ne les retrouves pas sous forme d'acides aminés dans ta protéine, puisqu'elles sont non traduites. Considère qu'il s'agit simplement de panneaux signalétiques pour la machinerie cellulaire, leur indiquant où s'accrocher ^^.  [...]

[Immunologie] Le réarrangement des gènes des Ig

Par exemple pour une chaine légère. on a plein de segments d'ADN codant pour différents V et d'autres pour différents J. J'ai bien compris que le principe était d'enlever tous les fragments entre le V et le J qu'on souhaite garder pour former la chaine, mais ce que je ne saisis pas c'est pourquoi il reste un V avant le V choisi et un J après le J choisi.  [...] Après réarrangement, le gène va être transcrit à partir du promoteur situé juste en amont du segment L (qui code pour le peptide signal permettant l'adressage de la protéine dans la voie de sécrétion) qui précède le V réarrangé. A noter qu'il y a un promoteur en amont de chaque segment L, et donc après transcription les autres LV restés sur ton ADN après réarrangement ne seront pas présent sur le transcrit primaire.  [...]

[Biochimie] Ratio de Western Blot

Je m'avancerais pas trop pour le western blot. C'est correct pour une coloration BET (ADN) ou coomassie, mais pour un western ca depend des Ac utilises. Un Ac monoclonal ne reconnaitra qu'un seul epitope / proteine par exemple. meme un polyclonal, je ne pense pas que le signal soit vraiment proportionnel a la taille.  [...] mais pour un western ca depend des Ac utilises. Un Ac monoclonal ne reconnaitra qu'un seul epitope / proteine par exemple. meme un polyclonal, je ne pense pas que le signal soit vraiment proportionnel a la taille.  [...]

[Biochimie] Normalisation ChIP-chip/microarray

Lors de la manip, j'ai hybride sur l'array un ADN controle (cy5) et un ADN IP (Cy3). J'ai ensuite fais le ratio Cy3/Cy5 pour avoir le signal specifique de binding de ma proteine.  [...] Juste pour preciser, c'est une manip de ChIP-chip. Je ne cherche pas a connaitre le niveau d'expression de mon gene (comme en microarray classique) mais plutot savoir ou se situe ma proteine d'interet sur le chromosome.  [...]

[Biologie Cellulaire] synthèse de protéine

Oui vous avez bien répondu à ma question merci. Mais il y a autre chose que je n'ai pas compris. Mon prof a parlé d'une protéine signal peptidase qui est localisé sur la phase luminale du réticulum endoplasmique rugueux. Et je ne suis pas sûre d'avoir compris son rôle et comment elle fonctionne.  [...] Je pense avoir compris que cette protéine signal peptidase va séparer la séquence signal peptidase afin de l'éliminer car son rôle ne serait que de faire entrer la protéine dans le réticulum.  [...]

[Biologie Cellulaire] Protéine actives et code postal (signal).

Les chaînes polypeptidiques, débutent très souvent par une séquence de nucléotides qui seront amenée à disparaître de la protéine par la suite. Après maturation de la protéine, on ne retrouvera plus cette séquence.  [...] . Un peptide signal, s'il est présent, sert à envoyer une protéine à sa destination. Ces peptides là sont en N-Term ou C-Term.  [...]

[Biologie Moléculaire] Comment ajouter un petide signal à une proteine?

je dois ajouter un peptide signal dont la séquence fait 70 bp à la CFP. Comment dois-je procéder J'ai pensé faire 2 PCRs, une pour amplifier le peptide signal et une pour amplifier la CFP puis de faire une troisième PCR qui me permette de fusionner la cfp et le peptide signal.  [...] Mais j'ai peur de ne pas réussir a amplifier et purifier facilement mon peptide signal seul par PCR. est-ce possible sinon est-ce que quelqu'un a déjà fusionné un signal peptide a une protéine.  [...]