• Santé - ADN, Niveau, Liaisons

DNAses, pourquoi spécifique aux ADN?

je sais que les DNAses coupent l'ADN au niveau des liaisons phosphodiesters, cependant les ARN sont aussi, dans leur structure primaire, une suite d'acides nucléiques liés entre eux par des liaisons phosphodiesters. Comment la DNAse (en générale) fait-elle pour être spécifique à l'ADN.  [...] Et dans la formation du complexe enzyme-substrat, il n'y a pas que la structure du site ou se déroule la réaction qui compte (ici la liaison PDE), dans notre exemple la seule présence du groupe hydroxy sur le ribose peut faire la différence.  [...]

[Biochimie] séchage et fibre d'ADN

Je ne comprends pas trop. On parle généralement de pelote d'ADN (l'ADN, c'est long et c'est fin, et il est impossible de ne pas l'emmêler). Du coups, de l'eau est emprisonné dans les boucles et les replis de l'ADN. Lorsque l'on sèche, l'eau disparaît et l'ADN se ratatine.  [...] Sinon, au niveau moléculaire, je ne sais pas, mais cela m'étonnerai que l'absence d'eau raccourcit l'ADN. ce sont des liaisons fortes comme même... (à part entre les deux brins d'ADN, qui sont des liaisons hydrogène, donc il faut de l'eau. Mais cela ne va pas les raccourcir...).  [...]

arrêt de la transcription

Du coup l'hybride ADN-ARN forme une boucle au niveau des U. or les liaisons A-U sont plus faibles (deux liaisons hydrogène, mais même par rapport à A-T, c'est moins stable, pour une raison que j'ignore), ce qui pousse la Pol à se décrocher.  [...] Oui, quand l'ARN pol arrive au site de terminaison il y a formation de cette structure. Il y a un autre type de terminaison également, qu'on appelle Rho-dépendante (ici c'est une Rho-indépendante = directe ), avec intervention de l'hélicase Rho.   [...]

Nucleofilaments et chromatine, chromatide ?

1) La chromatine qui est au niveau le plus décompactée sous forme de fibre de 10nm ou nucleofilaments. Je n'ai pas très bien compris tout d'abord le rôle de la nuclease spécifique. Si elle coupe les liaisons ADN comment sera t-il possible de se reformer après Est ce l'histone H1 qui permet de faire des interactions et donc des liaisons en zigzag.  [...] Le mot chromatine ne désigne pas un corps mais une substance, la substance composée d'ADN et des protéines et ARN associés. Quant à chromatide ça désigne les deux bâtonnets dont observe la séparation durant l'anaphase. Voilà pourquoi on dit qu'une chromatide est constituée/composée/formée d'une substance nommée chromatine.  [...]

[Biochimie] Les ponts hydrogènes

Pour moi, une liaison H est une faible liaison (+/- 10fois moins forte qu'une liaison covalente) qui se forme entre des molécules polaires. les atomes de pôles contraires ont tendance à s'attire (comme c'est le cas etre les molécules d'H 2 O). Ces liaison ce rompts facilement mais peuvent se refomer très rapidement.  [...] C'était aussi pour connaitre ton niveau. Car je peux te donner comme exemple l'interaction des bases d'ADN. A et T 2 liaisons H, C et G, 3 liaisons H, pour le maintient de l'ADN en double hélice, ou bien les liaisons H qui interviennent dans la formation des helices alpha des protéines, par ex, mais si je ne connais pas ton niveau, je ne peux savoir si ces exemples sont trop poussés.  [...]

[Biologie Moléculaire] PCR et fluorescence...

Le petit souci est que je suis plutôt chimiste et que même si je connais un peu le principe de ces méthodes, je ne sais pas trop le matériel nécessaire pour effectuer cela. Mes questions sont donc. Que faut-il pour réaliser une pcr et une observation avec un microscope à fluorescence (une liste détaillé serait l'idéal) Qui peut me fournir le matériel Est-il possible de transformer un microscope leica dm 2500 pour la fluorescence.   [...] C'est un Ser-protéase qui hydrolyse les liaisons peptidiques au niveau des C-ter lorsque les aa les formant sont aliphatiques, aromatiques ou hydrophobes. Je l'ai utilisée dans des extractions d'ADN génomique bactérien et viral à partir de sang total et j'en ai de mauvais souvenirs au niveau des qPCR.  [...]

[Biochimie] Question théorique sur clonage TOPO

Le plasmide pCR4 Blunt-TOPO vector (Figure11) nous est fourni sous forme linéaire, il possède en 3' une topoisomérase I du virus Vaccinia. Cette topoisomérase a la capacité de se fixer à des sites spécifiques de l'ADN et de cliver celui-ci au niveau des liaisons phosphodiesters, après le motif 5'-CCCTT.  [...] L'énergie libérée lors de cette réaction permet la formation d'une liaison covalente entre l'extrémité 3' du brin coupé et le résidu tyrosyl-274 de l'enzyme. Cette liaison est ensuite attaquée par l'extrémité 5' hydroxyl du brin d'ADN à insérer dans le vecteur, ce qui a pour résultats de libérer la topoisomérase I et de lier l'insert au vecteur (Figure12).  [...]

[Biologie Cellulaire] Domaine de liaison à l'ADN

Dans un premier temps il faut bien qu'elle adhère de manière aléatoire à l'ADN par ces phosphates ( fixation non spécifique donc )ensuite qu'elle rompt les liaisons et enfin qu'elle se fixe ou pas à la séquence de paire de base. Sans compter sur le fait qu'elle doit dégager l'hisone de l'ADN si sa séquence spécifique est enroulée autour d'un octamère d'histones... Elle fait tout ça la protéine.  [...] En fait les protéines ont directement accès aux bases de l'ADN, essentiellement au niveau du grand sillon de la double hélice, donc pas besoin de se lier aux phosphates, de casser les liaisons.  [...]

Endonucléases et liaisons de l'ADN

Pour l'instant, j'ai trouvé quel type d'enzyme coupait l'adn (l'endonucléase, qui appartient à la famille des hydrolases) ainsi que la localisation de la coupure sur l'ADN (au niveau des liaisons phosphodiester situées entre le groupement phosphate et les carbones aux extrémités du désoxyribose).  [...] J'ai aussi trouvé que, pour couper ces liaisons qui étaient des liaison ester, il fallait annuler l'estérisation en ajoutant une molécule d'eau.  [...]

[Biologie Moléculaire] Liaisons Hydrophobes et ADN

Alors les liaisons hydrophobes, tu pourras trouver facilement toute la doc dont tu as besoin sur internet. Mais en gros ce sont les groupements hydrophobes qui se regroupent pour minimiser leur exposition à un environement aqueux, ils se regroupent pour fuir l'eau en qlq sorte.  [...] A partir de là tu n auras pas de mal a imaginer que l' ADN en particulier les bases comportent les cycles qui sont tres hydrophobes et interagissent entre eux par empilement. ce sont les interactions de stacking. Ces interactions, contrairement à ce qu on pense contribuent largement plus à la stabilité de l ADN db que les liaisons hydrogenes.  [...]