• Santé - ADN, Fragments, UV

[Biologie Moléculaire] élèctrophorèse (ADN)

Donc, si tu n'observes pas de bande dans un puits c'est que le poids moléculaire de l'ADN fragmenté n'est pas dans la fourchette de taille observable par le gel d'agarose calibré (autrement dit, ton ADN est tellement petit qu'il a pu passer a travers ce maille et que lors de la migration, il a carrément quitter le gel en migrant vers une électrode).  [...] Ensuite le traitement aux UV a pour conséquence de fragmenter ces molécules d'ADN en fragments plus petits, de façon a ce que plus on expose aux UV, plus on fragmente l'ADN. Du coup a T1, une partie de l'ADN de départ est fragmenté, donc moins de signal, a T2, on a tout cassé, donc plus de barre mais un ensemble de fragments de petite taille qui doit ressembler à une trainée.  [...]

[Biochimie] PCR & Southern Blot

Non pas forcément, comme le disait wishangel, tu peux faire migrer ton ADN sur gel d'agarose avec du BEt et visualiser tes fragments sous UV.  [...] Si, si tu le fais migrer en même temps qu'un marqueur de poids moléculaire = mélange de fragments d'ADN de taille connue (cela peut être un ADN de ta collection digéré par des enzymes à ta convenance).  [...]

[Biologie Moléculaire] Electrophorèse (ADN sur Agarose) et Bromure d'éthidium

En mettre dans le gel est suffisant pour voir aux UV les bandes d'ADN. Le problème de l'éthidium, c'est qu'il est chargé positivement et il migre donc dans le sens opposé à l'ADN. Si vous laissez migrer trop longtemps votre ADN, il peut ne plus y avoir assez d'éthidium dans le bas de votre gel et vous risquez de ne plus voir les bandes de faible masse moléculaire (vous devez d'ailleurs avoir des petits fragments vu que vous utilisez un gel à 2% non ).  [...] J'y avais vaguement pensé, le truc c'est que je n'ai jamais vu mes fragments de petite taille dans un gel lorsque je fais migrer des restrictions. Et ce n'est pas une question de concentration en agarose seulement. L'idée que j'avais derrière la tête (ou dedans, c'est selon ), c'est que les petits migrent trop vite comparé aux grands, donc je me disais que, BET ou pas dans ton TAE de migration, les petits risquent de sortir avant que de correctement séparer les grands.  [...]

Southern blot

L'irradiation aux UV permet de photoponter les molécules d'ADN a la membrane de nitrocellulose. Ceci permet d'eviter de perdre les fragments d'ADN lors des hybirdations.  [...] La neutralisation sert à tamponner (après dénaturatio) étant donné que tu dois hybrider avec une sonde par la suite... Les UV servent à ponter l'ADN comme l'a dit YoYo, cependant cette étape est facultative, et certains sautent cette étapes... (pas moi en tout cas ).  [...]

dangerosité des ultraviolets

Des observations récentes suggéraient que les UV A altéraient aussi l'ADN, mais le mécanisme restait inconnu. Les chimistes français ont montré que des réactions de dimérisation peuvent aussi se produire à la suite de l'absorption du rayonnement UV A. Pour ce faire, ils ont travaillé avec de l'ADN synthétique formé uniquement des bases adénine et thymine, et ils ont observé son comportement sous l'action des rayons UV A.  [...] Les bases seules, non liées entre elles, n'absorbent pas le rayonnement UV A. En revanche, l'absorption des UV A augmente avec l'appariement des deux simples brins pour former une double hélice. De plus, le risque qu'un photon UV A provoque la formation d'un cyclobutane à partir de deux thymines est multiplié par dix pour un double brin d'ADN comparé à un simple brin.  [...]

[Biologie Moléculaire] Concentration ADN plus élevé au picogreen qu'aux UV (spectrométrie)

J'ai fait plusieurs quantifications d'ADN et voilà que la concentration de mes échantillons est plus élevée au picogreen qu'aux UV. Voici comment je procède.  [...] Ce sont des échantillons d'ADN humain provenant de Buffy Coat (couche de cellules blanches du sang). Je prends 4 ul d'ADN que je dilue dans 196 ul de TE 1X (donc une dilution 1.50). Je lis ensuite la plaque dans le lecteur absorbance (UV) ce qui me permet de déterminer la concentration ainsi que la pureté.  [...]

[Divers] Système de visualisation d'ADN en gel, fluorescence et UV!

[Divers] Système de visualisation d'ADN en gel, fluorescence et UV.  [...] Quelqu'un pourrait me conseiller d'un système simple de visualisation de gel avec caméra et lumière blue/UV pour visualiser les bandes d'acides nucléiques (ADN et ARN) dans un gel d'agarose préparé avec de BET et de Sybr safe (fluorescence).  [...]

les longues années (3.5 milliards!) qui ont abouti à l'évolution d'une B à une ArchB?

C'est une hypothèse comme quoi les UV auraient modifié l'ADN. Mais l'évolution naturelle aurait pu suffire. Quelle est la bonne réponse Mystère, tout ce que l'on peut faire c'est établir des hypothèses (avec des arguments scientifiques) pour expliquer cette évolution.  [...] Les mutations se font très bien même sans UV, pour preuve la grosse majorité des cancers dont la cause est connue n'a rien à voir avec les UV. N'importe quelle molécule interagissant fortement avec l'ADN est susceptible de provoquer des mutations. Les mutations peuvent même se produire complètement par hasard, sans cause externe.  [...]

[Divers] Un agent mutagéne: les ultraviolets ! Aide ?

Pour compléter ton argumentation, il y a des maladies génétiques, comme Xeroderma pigmentosum, ou les patients ont une mutation de XPD, une des sous unités de TFIIH impliquée dans la réparation de l'ADN. Ces patients, entre autres, doivent se protéger de la lumière du soleil, car ils développent des cancers de la peau en raison des UV qui induisent des mutations non réparées de leur ADN.  [...] Mais au risque d'être chiante. en quoi ça a à voir avec l'universalité du code L'universalité est que dans tous les organismes vivants, un codon précis code pour un aa précis (sauf les quelques exceptions, mais passons). Les UV provoquent des dimères de T au niveau de l'ADN lesquels sont réparés (très efficacement) par les systèmes de réparation au moment de la réplication, ou s'il y a des fuites, il y a une réparation couplée à la transcription.  [...]

Longueur d'onde et temps d'exposition radis

le temps n'est pas important, c'est la quantité de rayonnement fournie qui compte (donc ça dépend de la source). il faudra évidement faire des essais dans une gamme large (0, 1min, 5 min, 1h, 5h...etc).   [...] Les UV mutagènes se trouvent autour des 254nm (max d'absorbance par l'ADN). C'est dangereux à utiliser.  [...]