• Santé - ADN, Extrait, Fragments

Le paludisme aurait pu jouer un rôle dans la chute de l'Empire romain

Les chercheurs ont extrait de minuscules fragments d'ADN de la pulpe dentaire des dents pour isoler et purifier l'ADN provenant d'espèces de Plasmodium qui infectent l'Homme. Il est compliqué de trouver de l'ADN utilisable car le parasite vit dans le sang et des organes comme le foie et la rate qui se décomposent au fil du temps.  [...] Cette analyse de restes humains confirme la présence du paludisme pendant l'Empire romain entre le 1 er et le 3 e siècle. D'après Stephanie Marciniak, principale auteur de ces travaux, qui s'exprime dans un communiqué, nos données confirment que l'espèce était probablement Plasmodium falciparum et qu'elle affectait des personnes dans différents environnements écologiques et culturels.   [...]

TP sur les plasmides

Sur nos souches A,B et X on a extrait les plasmides, l'enzyme Pst1 les a digérée au niveau des gènes qui codent pour l'adhésine puis on a fait une électrophorèse sur gel d'agarose (on a donc une migration des fragments d'ADN).  [...] Après avoir réalisé une courbe étalon (graçe au poids moléculaire de référence), on a déterminer la taille de nos fragments expérimentaux. On compare ces tailles en bp (paire de bases) aux fragments de référence, et on dit que si au moins 3 fragments expérimentaux ressemblent à 3 fragments de référence, alors on a à faire au même plasmide.  [...]

En bref : Le génome de l'homme de Néanderthal partiellement décrypté

C'est une première. Une équipe de chercheurs de l'Institut Max Planck est parvenue à extraire et à séquencer l' ADN d'un homme de Néanderthal âgé de 45.000 ans.  [...] L'homme de Néanderthal avait été découvert dans une grotte, en Croatie. Annoncé sur le site Internet de la revue Nature, le séquençage de 0,03% de son génome, à partir d'ADN extrait de fragments d'os, devrait permettre de le comparer au bagage génétique de l'homme moderne, et d'apporter un nouveau regard - génétique celui-là - sur leurs liens de parenté.  [...]

[Biotechnologie] Principe de la PCR

d'exemplaires un fragment d'ADN particulier (la séquence d'intérêt, ADN d'intérêt ou ADN cible) à partir d'un extrait d'ADN (ADN matriciel). En.  [...] La PCR permet donc d'obtenir par réplication in vitro de multiples copies d'un fragment d'ADN à partir d'un extrait. L'ADN matriciel peut tout autant.  [...]

[Biologie Moléculaire] Fragment attendu pour électrophorèse d'ADN

[Biologie Moléculaire] Fragment attendu pour électrophorèse d'ADN.  [...] Actuellement en projet de recherche sur Staph aureus, nous avons extrait l'ADN de la bactérie, puis nous l'avons amplifié par PCR. Nous avons utilisé les amorces NucAF et NucAR. Nous attendions un fragment de 180 pb spécifique à Staph aureus. Lors de la lecture du gel d'agarose de l'électrophorèse nous avons bien eu des fragments mais ils ne sont pas de 180pb mais d'environ 270-300 pb.  [...]

Technique : RFLP

Après avoir extrait l'ADN de ces champignons, on va faire une RFLP (Restriction Fragment Length Polymorphism) sur l'ADN extrait.  [...] tu as dis précédemment que l'adn était coupé en point x (car site de restriction) et cela donnait des fragments. Soit, mets tu dis que s'il y a absence de ce site alors il y a migration de fragments plus courts ce ne serait pas le contraire par hasard, car si présence de site de restriction alors ca coupe donc longueur moindre que s'il n'y avait pas de site.  [...]

[Biotechnologie] PCR Vs Mini-prep (faite vos paris...)

En faite on fabrique un vecteur recombinant avec 3 inserts de taille différente. On transforme des bactéries et on les cultives sur boite de petri et l'on regarde le phénotype (les fragments d'ADN s'insert dans LacZ' dans le vecteur pUC19). Ensuite on extrait les plasmides pour faire une PCR et on fait en même temps une mini-prep pour comparer les résultats.  [...] Pour la mini-prep on digère de chaque côté du site multiple de clonage, ce qui revient à avoir les mêmes résultats au niveau des tailles de fragment à quelques pb près.  [...]

[Biologie Moléculaire] distribution de la taille de fragment d'ADN pour un échantillon de petite quantité

Je recherche un protocole ou une méthode permettant de visualiser la taille de fragment d'adn pour un extrait d'ADN de très faible concentration (eg. 1pg-1ng).  [...] - la définition du gel = une bande pourrait correspondre à plusieurs fragments sans qu'il soit possible de les différencier.  [...]

[Biologie Moléculaire] Preparation d'une gamme étalon ou standard pour PCRq

On peut utiliser des amorces dégénérées pour une PCR classique quand on ne connait pas sa séquence (puisque le but est juste d'avoir une bande), mais pour de la qPCR il vaut mieux des amorces dont on connait la séquence et qui ont toutes la meme séquence, sinon notre calcul des delta Ct doit en être impacté, surtout qu'une fois qu'on a la bande en PCR classique il suffit de l'extraire et de l'envoyer à séquencer afin d'avoir la séquence exacte et de designer des primers pour la qPCR, (en plus avec du dégénéré on augmentelerisque de non spécifique) m'enfin bon, peut etre que Flying qui est bien plus calé que moi sur le sujet a déja vu ca, et que ca se fait tout de même.  [...] relier ton Ct aux Ct d'ADN de concentration connu je ne suis pas sur que cela puisse se faire puisque x ng ou x nmol ne représente pas une quantité de transcrit (selon la taille des fragments), en plus de ca, dans les quantifications, les nucléotides libres sont aussi pris en compte, les primers aussi.  [...]

plasmide-clonage

en fait le plasmide porte un tout petit fragment (N-terminal) de la Bgal. Le reste de l'enzyme est codé par le chromosome. uand les deux morceaux sont exprimés l'enzyme est fonctionnelle et ca donne du bleu, quand le petit n'est pas exprimé alor l'enzyme n'est pas fonctionnelle et ca donne du blanc (du moins en theorie).  [...] En général (hors système Bleu-blanc de la B-Gal), on extrait l'ADN des colonies ayant poussé (miniprep. on pique une colonie, on la fait pousser en culture une nuit dans un milieu liquide contenant l'antibiotique en question, puis on la casse et on purifie son ADN) et on coupe l'ADN avec des enzymes de restriction pour déterminer quelle colonie possède le fragment d'intérêt (on dit alors que la colonie est un clone positif ) et l'ADN de cette colonie est alors amplifié par Midipreps pour être utilisé.  [...]