• Santé - ADN, Enzyme, Fréquence, Coupure

[Génétique] SMEAR qui es tu??

j'aimerai bien que qqun me repond car je suis vraiment en galere.Au pire me donne une reference des titres de bouquin dans lequel je porrai potasser.   [...] En biologie moléculaire, le terme smear désigne la multitude de bandes observées sur gel d'agarose lorsque par exemple ton ARN est très dégradé, un ADN génomique a été digéré par une enzyme à forte fréquence de coupure, que ta PCR est vraiment très foireuse, etc.  [...]

[Microbiologie] Hybridation

Après, si l'expérience est un Southern-Blot (ou équivalent), la fréquence de coupure de l'ADN par l'enzyme doit être assez élevé pour que le profil de digestion soit lisse. Dans mon ancien labo, on utilisait des enzymes classique de type EcoRV, HindIII... Le point difficile étant que la zone de référence (pour toi le 16s) et la zone à tester (le gène de résistance) doivent toujours être détecté (et donc qu'il ne faut pas couper au niveau de la sonde - qui n'est généralement pas excessivement grande -500pb pour moi).  [...] Le site de reconnaissance est super long (je trouve que 27-28 nucléotides de détection, non dégénéré, c'est long - à comparer avec les 6-10 normalement), ce qui signifie une fréquence de coupe de l'ADN faible (donc de plus gros fragments).  [...]

[Biologie Moléculaire] Aflp

-restriction de l'ADN génomique par une ER à fréquence de coupure élevée et une ER à fréquence de coupure faible.  [...] ma question est.comment on peut faire une amplification selective des fragments de restrictionj'ai lue que la selection est faite parapport à une base mais jai pas bien compris.   [...]

extraire de l'ADN

L'EDTA est un chélateur d'ion divalent positif, autrement dit, il va capter les ions divalents comme l' Mg2+, or il se trouve que beaucoup d'enzymes ont besion d'ion divalent pour fonctionner, comme la DNase I par exemple. L'EDTA va donc empecher le fonctionnement de l'enzyme en bloquant son cofacteur.  [...] Pour le reste, certaine enzyme de restriction sont effectivement incapable de couper l'ADN si celle-ci es méthylée au niveau du site de coupure (à l'inverse il existe des enzyme qui cliveny spécifiquement ces sites).  [...]

[Génétique] Dm sur la myopathie de Duchenne

Pour la question 2. tu dois d'abord savoir ce qu'est une enzyme de restriction (une enzyme qui coupe l'ADN, en reconnaissant une séquence particulière de désoxynucléotides). Les 2 allèles, sain et muté, ont-ils exactement la même séquence.  [...] Imagine que ton enzyme reconnaissent la séquence. ATTGTT, que l'on trouve dans un allèle 1. Si l'allèle 2 est muté et possède à la place ATTCTT, l'enzyme ne coupera pas à cet endroit, alors l'enzyme permettra d'obtenir des fragments d'ADN de taille différente selon que l'allèle possédé par l'individu.  [...]

VIH-Sida : les premiers résultats positifs de la thérapie génique

Ils ont utilisé une enzyme artificielle développée par la firme Sangamo BioSciences. Cette enzyme, appelée nucléase à doigts de zinc, résulte de la fusion de deux domaines protéiques distincts. un domaine nucléase qui porte l'activité de coupure de l' ADN, et un domaine de liaison à l'ADN, dont la spécificité de séquence peut être modulée par modification de sa structure.  [...] Elle a donc été conçue pour couper spécifiquement l'ADN génomique des lymphocytes des patients au niveau du gène CCR5, afin qu'il ne puisse plus donner naissance à un corécepteur fonctionnel.  [...]

Les effets déterministes

Dans ce cas, elle fait appel à une enzyme peu fidèle (l'ADN polymérase êta), qui va prendre quelques bases au pif pour sauter par dessus un obstacle (mésappariement, ADN détérioré,...). Un autre problème peut aussi être une coupure de l'ADN. la cellule va alors faire du rafistolage et ressouder les deux brins.  [...] Mais des modifications peuvent être arrivées dans la séquence entretemps... Après, pour voir l'ampleur de la transformation, il faut se renseigner sur les endroits où les mutations persistent (je n'ai plus le chiffre en tête, mais il me semble que plus de 90% de l'ADN ne sert pas à coder des protéines et de l'ARN non traduit).  [...]

Endonucléases et liaisons de l'ADN

Bonjour, je fais un TPE sur la modification de l'ADN qui doit mélanger SVT et Chimie. J'ai la partie SVT et pour la chimie, je comptais expliquer le clivage de l'ADN par une enzyme.  [...] Pour l'instant, j'ai trouvé quel type d'enzyme coupait l'adn (l'endonucléase, qui appartient à la famille des hydrolases) ainsi que la localisation de la coupure sur l'ADN (au niveau des liaisons phosphodiester situées entre le groupement phosphate et les carbones aux extrémités du désoxyribose).  [...]

[Divers] la biologie générale

Parmi les séquences suivantes,qui appartient à une molécule d'ADN bicaténaire, laquelle peut etre reconnue comme le site de coupure d'une certaine enzyme de restriction*.  [...] J'ai rapidement parcouru vos réponses. il y a énormément de fautes, mais j'ai en particulier retenu La photosynthèse mitochondriale et les liaisons hydrogène d'un brin d'ADN, ou encore la nature des bases qui composent les ADN du vivant eucaryote.  [...]

[Biologie Moléculaire] utilisation de serial cloner

Alors j'explique mon problème, je dois faire un clonage avec des sticky ends et quand j'essaye de faire une construction avec serial cloner je n'arrive pas à sélectionner une enzyme pour qu'il coupe lui même au niveau du site de restriction. Est-ce tout simplement possible Si non comment faites vous.  [...] J'ai aussi une autre question, toujours sur Serial Cloner, est-il possible de couper par une enzyme de restriction et avoir la séquence correspondante à l'ADN linéaire après la coupure.  [...]