• Santé - ADN, Concentration, Contamination, Protéines

[Biochimie] Spectrophotomètrie : Les différentes technologies...

spectrophotometre. il émet sur une plage de longueurs d'ondes (ou sur une LO spécifique) et détermine l'absorbance de l'échantillon en fonction de la longueur d'onde. Tu obtiens un spectre d'absorption de ton échantillon. renseigne sur la pureté, la concentration d'une substance.  [...] Ex. pour l'ADN tu peux déterminer sa concentration en mesurant l'absorbance a 260nm et la contamination par protéines en mesurant à 280.  [...]

Le SIDA transmit par le moustique?

- la quantite de sang présent dans (ou sur) la trompe apres une piqure est infime et donc la concentration de virus n'est pas assez importante.  [...] Bonjour, tu es sûr que c'est un test à partir de protéines et pas de l'ADN Sinon il se peut que le motif protéique reconnu dans le test soit relativement conservé (les protéases ne le digérant pas ou peu, bien que dégradant suffisamment les protéines pour empêcher la contamination virale).  [...]

expérience Meselson et Sthal

dans cette expérience le suivi d'ADN après centrifugation sur gradient de ClCs,par spéctrophotmétrie d'absoption dans l'uv.  [...] Mais souvent on mesure également la DO à 280 également pour pouvoir estimer la contamination par les protéines (c'est valable lorsque l'on fait une extraction d'ADN par exemple).  [...]

[Biochimie] Effet du pH sur le spectre UV des nucléotides

A la suite d'un laboratoire de biologie, nous avons reçu les résultats d'une expérience à laquelle nous n'avions pas participé. Il s'agissait de la mesure des différence d'absoption de nucléotides (dATP et dCTP) ainsi que d'ADN à différents pH (4.9 et 7.8).  [...] On sait qu'un ratio 260/280 pour l'ADN devrait se situer aux alentours de 1.8-2 et exprime une possible contamination par des protéines.  [...]

[Biologie Moléculaire] les ARNs et extraction

Les échantillons sont déposés 2 fois mais à des quantité différente (les puits d'en haut contiennent moins de quantité d'ARN que les puits d'en bas). Je ne vois qu' un smear et dans tous les autres cas on ne distingue rien. Ceci est lié à une dégradation de l'ARN Peut-on dire qu'il y a contamination avec de l'ADN ou des protéines comment expliquer que dans un cas il y a un smear et que lorsque que l'on en dépose plus il n'y a rien merci de vos réponses.  [...] merci piwi mais je n'arrive pas à avoir la publication il faut un login. Quelqu'un connaît t-il le rôle de l'extraction à la guanidine/NaCl + chloroforme seulement. j'comprends pas bien où sont les protéines, l'ARN et l'ADN. à priori vu que le pH est basique l'ADN restera préférentiellement dans la phase inférieure. merci.  [...]

[Biologie Moléculaire] Interprétation PCRq en temps réel (SYBER Green)

Le problème c'est pour la suite, on doit rendre un résultat scientifique (j'ai déjà calculé le % de contamination et je suppose que je doit utiliser les données fournies mais à part la concentration en ADN total, je ne vois pas ce que je dois faire des autres ) et un autre que même l'agriculteur producteur des échantillons est capable de comprendre (importance des dégâts, traitement possible si oui lequel...).  [...] Tu peux donc effectivement définir un pourcentage de contamination par rapport à la quantité totale d'ADN (ce qui me paraît être le plus simple).  [...]

[Biologie Moléculaire] Qiagen RNeasy trizol

J'ai trouvé un protocole d'extraction sur rneasy apres lyse trizol, et j'aurai voulu savoir si il y avait un risque de contamination des ARN par le trizol, ou bien si il est parfaitement lavé. On m'avait mis en garde un jour sur l'extraction au trizol, car cela serait assez fastidieux.  [...] Donc pour eux c'est l'extraction au Trizol qui marche bien. Il faut juste faire attention lorsque l'on pr élève les ARNs de ne pas contaminer avec la phase intermédiaire contenant les protéines et l'ADN. Après en dosant les ARN, grâce au rapport 260/280 tu sais si tu as des contaminations protéiques, grâce au rapport 260/230 tu sais si tu as une contamination phénolique.  [...]

qPCR résultats hors gamme standard!!!

Si les 2 séquences sont identiques, fait une PCRq avec un couple d'amorces placé dans un intron pour contrôler le niveau de contamination par de l'ADN génomique.  [...] 3) Je réitère ma proposition d'estimer la quantité d'ADN génomique contaminant par un couple d'amorce situé dans un intron. C'est un contrôle de contamination et de niveau de bruit de fond imparable.  [...]

Plasmide et gène LacZ

La première étape de l'utilisation des plasmides est la détermination des bactéries transformant (qui ont intégré un plasmide non recombinant) et des bactéries transformant recombinant (qui ont intégré des plasmides recombinant, i.e. contenant le gène luc), par rapport aux bactéries non transformant.   [...] Une fois les bactéries sélectionnées, il va falloir purifier les vecteurs, afin que l'ADN soit exempt de toute protéine, de tout ARN ou d'une quelconque contamination chimique. Puis, avant de commencer les expériences proprement dites, on transfecte les plasmides dans les cellules qui nous intéressent.  [...]

[Biologie Moléculaire] Extraction d'ADN

Si c'est une extraction d'ADN plasmidique, la présence d'une pelote ou de longs filaments témoignent d'une contamination des plasmides par de l'ADN génomique bactérien. Quel est ton type d'extraction d'ADN. ADN total ou ADN plasmidique.  [...] Personnellement j'ai extrait de l'ADN génomique du soja par les méthodes classiques basées sur l'utilisation de détergent (CTAB et SDS ) par deux protocoles différents et dans les deux cas j'ai obtenu un précipité sous forme d'écaille. je n'ai pas compris qu'on est-ce que on obtient une pelote d'ADN et quelle est la relation entre la forme et le degré de contamination de l'ADN.  [...]