• Santé - ADN, Cellule, Fragments

Mutagenèse dirigée : un Nobel pour des souris mutantes

Le principe de recombinaison homologue était déjà bien connu avant que Capecchi ne l'exploite dans les cellules souches de souris. Il repose sur le fait que quand deux fragments d'ADN sont très semblables, homologues sur au moins une vingtaine de bases, et si une cassure survient, la cellule la répare mais peut se tromper et ponter les deux morceaux, les recombiner.  [...] C'est cette propriété qui a été utilisée par les scientifiques pour muter spécifiquement un gène de la manière dont ils le désiraient. On savait que l'on pouvait injecter de façon transitoire un fragment d'ADN dans une cellule. L'idée était d'utiliser comme fragment une version mutée du gène que l'on ciblait, on savait que statistiquement se produirait dans l'une ou l'autre des cellules un événement de double recombinaison qui introduirait la mutation dans le génome de la cellule.  [...]

[Biochimie] Cellules mortes

Souvent c'est le TNF avec le ligand Fas. Ce signal active la cascade de la caspase et de la désoxyribonucléase CAD (Caspase Activated DNase), dans la cellule et cette dernière décompose l'ADN de la cellule en fragments de 50 à 300 Kb, ce qui aboutit à la mort de la cellule et à la production de corpuscules plus petits (corps apoptotiques).  [...] Les faits morphologiques de l'apoptose comportent la réduction de volume avec préservation de la morphologie des organites intracellulaires, un bourgeonnement de la membrane, une condensation et une marginalisation de la chromatine, une fragmentation de l'ADN, une invagination de la membrane, pour aboutir à une libération des corps apoptotiques.  [...]

1ère S

Une hélicase ouvre localement la double hélice de l'ADN et sépare les deux brins, deux ADN polymérases copient chacun des deux brins et la ligase relie les fragments d'ADN double brin. Le matériel génétique, présent dans le noyau de la cellule et isolé du cytoplasme par une enveloppe, se présente sous une forme décondensée appelée chromatine.  [...] La mitose est la deuxième étape du cycle cellulaire. Celle-ci comporte quatre phases. Lors de la prophase, la chromatine se condense et forme des chromosomes constitués chacun de 2 chromatides. L'enveloppe nucléaire se fragmente et disparaît progressivement pour permettre aux chromosomes de migrer dans l'ensemble de la cellule.  [...]

anticorps

Le contact Ag avec l'Ig du BCR entraîne des modifications sur le gène IgH des cellules lymphoïdes B naïves. Un processus d'hypermutation somatique, correspondant à quelques mutations ponctuelles, aboutit à la modification de quelques codons (codent pour quelques aminoacides différents, principalement sur les régions CDR1 et 2).  [...] En fait comme l'explique mantos, il y a en fait des fragments de gènes qui vont se recombiner par excision des séquences d'ADN entre les fragments sélectionnés. Au niveau de la zone de ligature des fragments, il y a un mécanisme qui permet qu'elle ne soit pas réalisée excactement de la même façon, avec même un possible décalage du cadre de lecture (pour un chromosome, sacahnt qu'on a deux chaines et trois fragments à assembler ça fait relativement peu d'anticorps fonctionnels par décalage du cadre de lecture, en fait la cellule dispose d'une deuxième chance avec le chromosome homolgue si ça échoue), c'est l'explication de l'existence des régions hypervariables.  [...]

[Biologie Cellulaire] Marquage à l'iodure de propidium pour suivi du cycle cellulaire

Si j'ai bien compris le principe de cette méthode, la perméabilisation des cellules entraîne la sortie des fragments d'ADN de 180 bp, ce qui fait que l'intensité de fluorescence des cellules en apoptose est inférieure à celle des autres cellules (puisque proportionnelle à la quantité d'ADN), d'où l'apparition d'un pic en subG1.  [...] Pour le marquage IP, comme tu l'as dit, les cellules en subG1 le sont surtout à cause d'une fuite des fragments d'ADN clivés hors de la cellule. Seulement, le clivage régulier de l'ADN internucléosomal est typique d'un processus apoptotique. Dans le cas des autres morts cellulaires, la dégradation de l'ADN peut intervenir plus tardivement dans le cas d'une mort cellulaire par autophagie et/ou est plus anarchique comme dans le cas d'une nécrose.  [...]

Immunoprécipitation de la chromatine

Dans le cours que j'étudie actuellement nous apprenons que la CHIP est une méthod e permettant de determiner le site de liaison de l'adn sur le génome si je ne me trompe pas.  [...] La ChIP permet d'identifier le site de fixation d'une protéine sur l'ADN. Il faut posséder l'anticorps spécifique de la protéine qui t'intéresse (ou alors exprimer une protéine taggée dans ta cellule et avoir un anticorps anti-tag). Donc tu extrais les complexes ADN/protéines des cellules, tu les découpes en courts fragments (qq centaines de paires de bases par exemple pour commencer) tu incubes avec ton anticorps.  [...]

création de bactéries artificielles

Moi j'ai simplement entendu parler de la fabrication artificielle d'un virus par une nouvelle technique d'amplification et de lagation des fragments d'ADN. Une fois synthétisé ce génome virale etait injecté dans une cellule et il a permi la synthèse de nouveaux virions. C'etait aussi craig venter.  [...] Je ne sais pas si ça vous intéresse, mais Albert Libchaler et Vincent Noireaux ont construit une cellule artificielle. une sphère verte fluo, ou plutot, une vésicule de phospholipides de blanc d'oeuf, remplie de la machinerie cellulaire d'une Escherichia coli (privée de son matériel génétique), d'un gène de fluorescence prélevé sur une méduse et d'un autre provenant du staphylocoque doré, et enfin d'une enzyme virale pour permettre la traduction des gènes.  [...]

[Génétique] puces à ADN

J'ai cru comprendre que l'on doit tout d'abord fixer sur la lame de la puce des fragments d'ADN des gènes d'interets (mais je ne comprends pas bien comment on fait.. doit-on connaitre le génome de la cellule pour pouvoir ainsi sélectionner les gènes recherchés).  [...] Y à t-il un moyen qui permettrait d'utiliser ces micropuces sans connaitre le génome de la cellule Et qui permettrait alors de détecter des nouveaux gènes impliqués dans la toxicité embryonnaire.  [...]

Cause peu connue

Cependant, paradoxalement, 95 % de la mortalité lymphocytaire se produit chez des cellules non infectées par le VIH, ou plutôt non complètement infectées par le virus du Sida. Le seul contact de la protéine virale gp120 avec le récepteur CD4 pourrait suffire à activer des voies cellulaires aboutissant à la mort de l'hôte.  [...] D'autre part, une étude de 2010 parue dans Cell a montré que dans certains cas, le VIH pénétrait les cellules et la transcription inverse pouvait être incomplète. Ainsi, les fragments d'ADN flottant dans le cytoplasme induisent une fois encore une réponse apoptotique de la part de la cellule.  [...]

virologie

Pour ce que j'en sais, le réassortiment (concernant les fragments des ARN viraux) a lieu pendant ou à l'issue ce phénomène de recombinaison virale.  [...] Une recombinaison virale peut se produire quand deux virus infectent en même temps une même cellule. Ces deux virus vont contenir leurs fragments d'ARN qui vont aller ensuite dans le cytoplasme sous forme d'ADN qui va être utilisé par la cellule. Cette dernière va alors, via sa machinerie cellulaire, produire des virus qui seront constitués de fragments ARN du virus 1 et du virus 2.  [...]