• Santé - ADN, Boucles, Hybridation, ARN

[Biologie Moléculaire] Hybridation ADNdb - ARNm

D'après ce que j'ai lu il est possible d'avoir hybridation ARN-ADN(matrice) entre les bases correspondantes aux exons, les introns se retrouvant en forme de boucles non hybridées à l'ARN.  [...] Du coup, est-ce que qu'une hybridation ADN matrice - ARN est possible en même temps qu'une hybridation partielle de ce même brin matrice à un locus différent avec l'ADN brin complémentaire. Une double hybridation du brin matrice, avec d'un côté l'ARN complémentaire, et d'un autre sur des sequences nues hybridation d'une partie du 2nd brin ADN codant.  [...]

La fragilité des chromosomes mieux comprise

Sur les gènes les plus longs à transcrire, l'ADN vient former des boucles suite à l'hybridation avec l'ARN fraîchement répliqué. Ceci induit une fragilité chromosomique à l'origine de cancers. Caroline Davis, Flickr, cc.  [...] Pour aller plus loin, l'équipe a cherché ensuite à savoir précisément ce qui pouvait fragiliser l'ADN quand réplication et transcription sont concomitantes. Ils ont mis en évidence des structures en boucle qui perdurent, dues à l' hybridation de l'ADN avec la molécule d' ARN produite lors de la transcription.  [...]

[Biotechnologie] Terminateur de transcription

a) les sites Nut, qui une fois transcrits sont des sites de liaisons pour une hélicase (la fameuse Rho) qui migre sur l'ARN, rattrape l'ARN pol et dissocie le complexe ADN..ARN, si bien que l'ARN pol aussi est élaguée de l'ADN. Les sites Nut sont suivie de sites de pauses (des tiges-boucles) ce qui favorise Rho.  [...] b) La transcription de certains gènes s'achèvent par terminaison intrinsèque (Rho-indépendante) au passage d'une région palindromique structurée en tige-boucle immédiatement suivie d'une série de T. C'est un peu complexe mais en gros c'est la différence de stabilité entre la tige boucle ARN et le polyU qui conduit à dissocier le complexe.  [...]

[Biologie Moléculaire] ADN, chromatine, ... Mises en évidence expérimentales.

Je pensais à une hybridation du brin transcrit avec un ARN pré-messager (pas d'excision des introns ni raboutage des exons).  [...] Heu non justement, on prend de l'ARN cytosolique donc mature qu'on hybride avec de l'ADN et les boucles d'ADN qui ne s'apparient pas sont les régions des introns. Ou bien j'ai mal compris la question.  [...]

L'ARN synthétique, peut-être une bonne arme contre le Sida

Les chercheurs de l'IECB ont d'abord patiemment testé une série de petits brins d'ARN (des oligonucléotides ) en puisant dans une banque qui en contient cent milliards, pour retenir ceux capables de se fixer spécifiquement sur la région TAR. Les équipes de l'IBS et de l'université d'Ottawa ont ensuite pris le relais pour étudier de près cette fixation à l'aide d'une technique utilisant la RMN ( résonance magnétique nucléaire).  [...] L'étude servira aussi, plus généralement, à mieux comprendre le fonctionnement des associations entre ARN (ou entre ARN et ADN) au niveau de structures en boucles, qui participent manifestement à la régulation de l'expression des gènes. Dans ces mécanismes, les différents types d'ARN jouent des rôles multiples et la compréhension de cette régulation constitue le grand chantier de la génétique actuelle.  [...]

[Biochimie] Réplication des télomères

En ce qui concerne les fragments d'Osaki, la télomérase rallonge le brin matrice, mon prof parle ensuite d'une boucle que ferait le brin matrice et sur laquelle serait ajoutée une amorce ARN permettant de synthétiser le reste du Fragment d'Osaki en 3'-5'.  [...] C'est exact, il est possible de synthétiser en 3'-5'. Je ne sais plus quelle polymérase s'en charge (il y a plusieurs ADN et ARN polymérases dans les eucaryotes supérieurs). L'ADN simple brin est capable de former des boucles si les séquences sont palyndromiques.  [...]

[Biologie Moléculaire] stabilité ADN

On a aussi l'exemple des séquences CRISPR chez certaines bactéries qui s'hybrident aussi avec des ARN(viraux) pour entrainer leur dégradation.  [...] Sinon en terme d'appariement par complémentarité de bases un peu comme l'ADN, on va retrouver des structures formées par l'ARN qui correspondent à ce qu'on appelle des tiges (structures tiges/boucles) et où les bases s'apparient induisant un repliement de l'ARN sur lui même.  [...]

L'ADN G-quadruplexe, à 4 brins, existe bien dans les cellules humaines

Le 25 avril 1953, le jeune biologiste James Watson et Francis Crick, physicien reconverti dans la biologie, publient dans la revue Nature un article intitulé Une structure pour l'acide désoxyribonucléique. Ils y proposent que l' ADN (déjà connu) prend la forme d'une hélice à double brin.  [...] Associées grâce à des ions positifs ( sodium, potassium, etc.), elles peuvent se fixer par chacun des quatre coins à un ADN (ou un ARN), le contraignant à se replier. On obtient alors un morceau d'ADN qui semble constitué de quatre brins parallèles (en fait reliés par des demi-boucles, voir le schéma ci-dessous).  [...]

régulation de la transcription

bonjour à tous, voilà pendant le cours j'ai pris quelques notes sur la régulation de la transcription par atténuation mais ça reste un peu flou dans ma tète.. est ce que l'un de vous aurait la gentillesse de bien vouloir m'éclairer un peu sur ce phénoméne.   [...] Au cours de la transcription, il se peut que l'ARN polymérase soit ralentie. Ce ralentissement est lié à la présence de séquences ADN organisées en répétitions inversées (du genre CCTAGGCCA- x nts- TGGCCTAGG) qui sont susceptibles de se structurer en tige-boucles (cela ressemble un peu à des champignons).  [...]

[Biologie Cellulaire] La cellule mystère.... - Page 3

Je ne comprend pas l'interet d'utiliser un ADNc avec un ARN pré-messager. Pourquoi on ne se contente pas de faire une hybridation entre ADN normal et ARN normal (maturé) (éventuellement après avoir isolé l'ADN pour effectivement avoir le morceau qui nous intéresse) Ca serait plus simple, plutot que de se taper une rétrotranscription à partir d'un ARNm.  [...] En fait on voit très nettement que le gène (ADN) est beaucoup plus long que son ARNm. Les boucles sont présentes au niveau du brin d'ADN et correspondent effectivement aux introns car les 2 brins sont hybridés sauf au niveau de ces boucles ce qui montre que l'ADN possède des séquences que l'ARNm n'a pas.  [...]