• Santé - ADN, Acide, Basique

[Biochimie] pH de l'ADN

Tu as peut-être mal entendu... Il n'a peut-être dit que dans une manip on placait l'ADN dans un tampon (= solution au pH fixé) basique.  [...] Les bases de l'ADN ne sont pas basiques contrairement a ce que leurs nom pourraient indiquer, (les atomes d'azotes qui pourraient capter des H+ et donc être basique, ne peuvent en fait pas capter les H+ car leur doublet non liant est pris dans délocalisations d'électrons du cycle).  [...]

[Biologie Cellulaire] Domaine de liaison à l'ADN

Une devinette alors j'me mouille. l'ADN possède un phosphate incomplétement oxydé. L'adn est alors chargé négativement. Il faudrait donc des acides-aminés chargés positivement...A moins qu'il ne faille des AA basique comme l'ADN est acide...langue au chat.  [...] Dans le premier cas, les protéines n'ont pas besoin de reconnaître un motif particulier de l'ADN. Et qu'est-ce qui n'est pas spécifique dans l'ADN La chaîne principale avec les posphates chargés négativement. Ainsi, beaucoup de protéines non spécifiques comme les histones sont basiques (chargées positivement) et vont dons établir des interactions ioniques avec l'ADN.  [...]

[Biochimie] A quoi ça sert?

Es ce quand on est a PH acide ou à PH basique que l'on élimine l'ADN JE sais que l'ADN est de charge négative donc je suppose que c'est quand on est a PH acide mais dans mon protocole, on m'indique qu'il faut tout d'abord mettre de la soude à 10 mol/L, es ce pour rompre les liaisons de la membrane de la levure.  [...] ok pour la soude elle détruit les membranes. Mais ensuite nous procedons à un abaissement du ph jusqu'a 4,5. Es ce pour eradiqué l'ADN nos pas de SDS juste ce que j'ai pu dire plus haut.  [...]

[Génétique] Extraction, purification et analyse d'ARN (Nanodrop et bioanalyser)

LEs ratios permettent uniquement de s'assurer de la pureté d'un acide nucléique. En effet l'absorbance a 230 concerne divers composés organiques (phénol par exemple) et celle a 280 les protéines. Un ratio de l'ordre de 2 permet de voir que ton extrait est assez propre et ne contient presque que de l'acide nucléique.  [...] Utilisé pour l'electrophorèse après la PCR. La question...est-ce utilisé pour charger l'ADN. L'ADN étant acide, dans une solution basique il aurait tendance à libérer des protons et donc se charger. (pour faire une analogie, il prendrait le rôle du SDS [quelque chose comme ça] pour l'electrophorèse des protéines ).  [...]

[Biologie Cellulaire] SAR et Histones

par contre, je ne sais pas à quoi servent les HMG dans la structure de la chromatine. je m'explique. ce sont des molécules bipolaires qui interagissent avec l'adn (+) et les histones (-) et apparement ca intervient dans le remodelage de la chromatine. repression ou activation en tout cas, ca m'a l'air bizarre, c'est comme si ca stabilisait la chromatine.  [...] Elles ont effectivement une structure dipolaire avec une extrémité basique qui interagit avec l'ADN et une extrémité acide qui interagit avec les histones.  [...]

[Biologie Moléculaire] ADN ARN extraction

J'ai un petit problème en TP de biologie moléculaire, c'est lors de l'extraction de l'ADN et de l'ARN. Ma question est. pourquoi l'ADN, à pH basique se retrouve en phase aqueuse, et pourquoi l'ARN se retrouve en phase aqueuse (tous les 2 lors de l'extraction bien entendu).  [...] En fonction du pH, la charge des protéines change (groupement acide/basique sur les chaines latérales avec différents pKa). Or l'interaction Histone/ADN est une interaction éléctrostatique(ADN - et queue des Histones + ) ==. si on modifie la charge des histones, on modifie l'interaction protéine ADN.  [...]

[Biologie Cellulaire] Basophilie Eosinophilie

Je parle uniquement des granulations des polynucléaires mais les termes éosinophiles et basophiles sont généralisable aux cytoplasmes (basique donc acidophile), noyaux (ADN/ARN = acide donc basophile), etc.  [...] 1. ADN. l'acide désoxyribonucléique est densément chargé négativement en raison des nombreux groupements phosphates. Il est acide et il a donc affinité pour les BASES. Il est donc dit basophile. Cet ADN est condensé par des protéines basiques (les histones).  [...]

[Génétique] L'acidité de l'ADN

on sait tous que l'ADN c'est un acide nucléique qui résulte de la succession de nucléotide qui sont composé d'une base nuclée,d'un désoxyribose et d'un acide phosphorique H 3PO4 qui est un acide fort et dont sa force KA diminu chaque foi avec sa perte de proton bon bref ma question est.  [...] Je voulais juste dire qu'au pH cellulaire (autour de 7 pour la majorité des cellules animales...) l'ADN est sous forme basique et est donc chargée négativement. C'est une propriété très utilisée en laboratoire. D'après les régles de la chimie, le pKa caractéristique d'un couple acido-basique détermine si la molécule est sous forme acide ou basique en fonction du pH.  [...]

[Biochimie] ADN: pKa du groupement phosphate, acidité etc.

Deuxième question.On dit dans mon cours de bioch que le phosphate impliqué dans un acide nucléique a deux pKa. un à 2 et un à 7 (un pour chaque fonction acide), puisque le pH physiologique est égal à 7 (J'arrondis les pH comme mon prof le fait dans mon cours), le premier groupe OH va s'ioniser en laissant partir son H+ et donc devenir une base conjuguée, le deuxième OH a un pKa= au pH, dans ce cas il devrait y avoir autant de forme basique qu'acide.  [...] . Je n'arrive pas à comprendre ce dernier point, quand je faisais des titrages en chimie je comprenais cette notion car on ajoutait de la base à un acide pour arriver à pH=pKa, mais dans le cas de l'ADN on n'ajoute rien.. Ca veut dire que l'OH oscille entre sa forme basique et sa forme acide Et quand est-il du 3e OH.  [...]

[Biologie Moléculaire] La molécule mystère - Page 10

Je suis une protéine d'humeur basique, si je suis absente ou mutée et non phosphorylée, la réparation de cassures double-brin ne pourra pas se faire.  [...] Ah attends, tu as parlé d'une protéine à humeur basique, et je pense donc que tu parle d'une histone puisqu'elles sont basiques pour pouvoir bien intéragir avec l'ADN qui est plutôt acide.  [...]