• Santé - ADN, Accessibilité, Séquences

[Biologie Cellulaire] L'adn

On inclut dans le gène toutes les séquences régulatrices de la transcription. Dans tous les cas, elles sont présentes en amont du site d'initiation de la transcription donc non transcrites. ce sont les promoteurs dits extragéniques bien qu'on les inclue dans le gène.  [...] Les structures secondaires A et B sont observées in vivo. Ce ne sont pas des anomalies. la variation locale de la structure d'ADN permet de modifier l'accessibilité de certaines séquences à des protéines, ce qui permet une régulation génique.  [...]

[Biochimie] Quelle est la différence entre ADN et ARN?

Il y a effectivement une question de stabilité, mais aussi d'accessibilité à la traduction (ARN-. protéine). La machinerie de traduction ne peut pas fonctionner sur un système double brin d'ADN. Elle ne marche que sur du simple brin.  [...] Juste pour préciser, le ribosome est incapable de traduire de l'ADN meme simple brin. Il n'y a donc pas qu'une question d'accessibilité.  [...]

Comment la protéine Clock rythme notre biologie

Les derniers résultats de l'équipe de Paolo Sassone-Corsi de l'Institut de génétique et biologie moléculaire et cellulaire (1), publiés dans Cell le 5 mai 2006, montrent que la protéine Clock, élément central du contrôle de l'horloge circadienne, possède une activité enzymatique qui modifie le compactage de l'ADN et donc l'accessibilité des gènes.  [...] L'équipe de Paolo Sassone-Corsi vient de montrer que la protéine Clock possède également une activité enzymatique qui peut modifier le degré de compaction de l' ADN au sein de la cellule et de ce fait l'accessibilité des gènes et leur expression (2). Clock induit ainsi un remodelage de l'ADN au niveau des gènes contrôlés par l'horloge circadienne et régule leur expression.  [...]

Rôle Enhancer

Je crois aussi que ces séquences enhancers peuvent être déplacées artificiellement en amont ou en aval du gène, tout en gardant la spécificité de sa fonction (pour compléter la définition).  [...] Pour moi la plus grande différence tient du fait que ces séquences sont impliquées dans l'accessibilité de la séquence régulatrice du gène concerné.  [...]

extraction phénol chloroforme

juste un point de detail, mais l'ADN supercoiled est plus facilement coupable que l'ADN qui ne l'est pas. L'enroulement negatif de la molecule favorise son ouverture et donc son accessibilité aux enzymes.  [...] Personnellement pour mes minipreps j'utilise le kit wizard+ qui marche tres bien et me donne un ADN de qualité sufisante pour faire du sequençage automatique derriere. Le prix est d'environ 1euro par miniprep ce qui n'est pas si cher que ca.  [...]

[Biologie Cellulaire] Télomères et vieillissement

La télomérase permet de répliquer la portion simple brin. Donc il n'y a pas ou plus de perte de ladite séquence dans les cellules où son expression est constitutive (cellules germinales, cellules souches) ou ectopique (cellules somatiques potentiellement cancéreuses).  [...] Et bien il existe en plus de la sénescence réplicative, la sénescence métabolique qui est principalement due aux dégâts provoqués par les radicaux libres provenant d'une réduction partielle de l'oxygène par les électrons enlevés aux combustibles cellulaires, et le cas de la sénescence prématurée qui peut être induite par un endommagement de l'ADN, des modifications de la structure de la chromatine (c'est-à-dire l'accessibilité des facteurs de transcription au niveau des gènes et dont la non accessibilité de ces facteurs pourrait empecher leurs expréssions).  [...]

températures et PCR

La température d'hybridation c'est celle qui permet que les amorces se fixent à la matrice si je comprends bien et le Tm c'est la température a laquelle il y a 50% de simple brin mais je n'arrive pas a faire le lien avec les amorces parce que ça c'est la dénaturation non.   [...] Pour que tes amorces puissent s'hybrider à la matrice d'ADN, il faut que celle-ci sois dénaturée pour permettre l'accessibilité des amorces. Ainsi à Tm-5°C on considère que l'hybridation peut se faire correctement. Et oui, le Tm est la température à laquelle tu as 50% de ton ADN sous forme simple brin (et donc 50% en double brin).  [...]

biologie moléculaire

connaisons que toutes les cellules d'un meme animal contiennent des génomes identiques, dans une expérience, un tissu composé de multiples types cellulaires est fixé et soumis à une hybridation avec une sonde d'ADN spécifique d'un géne particulier. à votre grande surprise, le signal d'hybridation est brin plus fort dans certaines cellules que dans autre, est ce quelqu'un peut me donner une explication détaillée.  [...] si ta sonde n'hybride que les ADN, ca pourrait représenter la différence d'accessibilité des gènes spottés, dans les cellules ou le signal est le plus fort on aurait un gène plus accessible qui suppose une plus forte expression.  [...]

[Biologie Moléculaire] modification covalentes/non-covalentes de l'ADN

Il y a toutefois l'exemple du dimère de thymine (liaison covalente de deux T successif dans la séquence suite par exemple à un rayonnement UV) qui aboutit une changement de base (T-. C je me souvient plus).  [...] 2) Les proteines dites histones, qui forment des nucléosomes, et qui elles ne sont pas lié de façon covalente (enfin dans mes souvenirs ) à la molécule d'ADN. Ces nucléosomes jouent un rôle (important) dans la compaction/accessibilité des régions génomiques.  [...]

[Biologie Moléculaire] Les gènes Hox

Les protéines pour lesquelles ils codent appartiennent à une famille dont tous les membres ont en commun un domaine conservé, l'homéodomaine. Cet homéodomaine est formé d'environs 60 acides aminés formant 4 hélices (3 hélices alpha + une autre hélice). Ce sont les hélices 2 et 3 qui se fixent dans le grand sillon de l'ADN au niveau d'une séquence consensus spécifique à chacune des différentes sous-familles d'homéogènes.  [...] La première idée pour moi a été l'accessibilité de la chromatine. Si le gène en 3', donc Hoxa1, est exprimé en premier, l'environnement chromatinien à proximité de ce gène est plus accessible à des histones acétyltransférases et on peut imaginer une sorte de mécanisme coopératif, une sorte de réaction en chaine 3'-. 5'.  [...]