• Santé - Actif, Catalyse, Enzyme

[Biologie Moléculaire] Site actif d'un enzyme.

Le site actif est la région de l'enzyme où à lieu la réaction qu'elle catalyse. C'est là que le substrat de l'enzyme va être transformé en un nouveau produit en réagissant avec le ou les acides aminés de ce site.  [...] La transformation catalysée par l'enzyme et le substrat utilisé dépendent donc de la nature du site de liaison ET du site de catalyse. En un mot. du site actif.  [...]

[Biochimie] Inhibiteur de la chymotrypsine

voila. on dit que le meilleur inhibiteur de cette serine -protease est le fluorophosphat organique (DIFP) reagit très rapidement avec le rèsidue serine 195 du site actif, il bloque la 2 eme etape du catalyse de cette enzyme, celui du acyle-enzyme.  [...] dans ton cas, le chymotrypsinogène (=chymotrypsine inactive) doit être hydroxylé plusieurs fois (dont une par la chymotrypsine) pour être activé. le DIFP se fixe sur une sérine et empêche le fonctionnement de ta chymotrypsine (car il bloque l'accès,il empêche le contact entre le site actif et le ligand), et empêche ainsi l'activation du chymotrypsinogène.  [...]

[Biochimie] Spécificité de substrat , spécificité d'action

Tout est une question de conformation, c'est à dire de structure tridimensionnelle. La spécificité de substrat repose, entre autres, sur la conformation du site actif (la partie de la protéine qui va être responsable de la catalyse) et de ses environs. Quand un substrat s'approche du site actif, il va y avoir des micro-ajustements réciproques entre enzyme et substrat, avec formation de liaisons de faible énergie (c'est à dire non covalentes).  [...] Si le substrat et l'enzyme établissent des interactions suffisament importantes, et si le substrat possède la bonne conformation, alors le site actif, généralement de 2-3 acides aminés, pourra jouer son rôle de catalyseur.  [...]

[Génétique] Questions

Donc, pour qu'une enzyme puisse catalyser une réaction, il faut qu'elle entre en contact avec le substrat. Cela se produit au niveau du site catalytique. Comme une enzyme catalyse une transformation donnée d'une molécule donné (pour rester dans la généralité grossière ), le site actif doit pouvoir acueillir la molécule du substrat de façon convenable pour que la réaction puisse avoir lieu.  [...] Donc, l'enzyme a une conformation spatiale telle que le site actif se forme et telle que le contact entre lui et le substrat soit optimal.  [...]

enzymologie

j'aurais besoin d'une petite précision concernant la ß-galactosidase. je sais que le galactose est un inhibiteur de cette enzyme, mais est-ce que c'est un inhiniteur compétitif, incompétitif, mixte ou non compétitif.  [...] Comme c'est un produit de la réaction que catalyse la béta galactosidase, il a aussi une affinité pour le site actif de l'enzyme. Je pense donc que c'est un inhibiteur compétitif. Je ne sais pas si c'est adéquat comme appelation d'ailleurs.  [...]

Courbure des acides gras

Une membrane, comme tu le sais peut être, est une bicouche protéo-lipidique. Les lipides qui la composent sont en mouvement constant, ils diffusent au sein de chaque hémimembrane (et parfois entre les deux hémimembranes, mais il s'agit là d'un processus actif catalysé par une enzyme, la flippase).  [...] La fluidité des membranes biologiques est très importante, et est un processus régulé. Comment est elle régulée Eh bien, par exemple avec la présence d'acides gras insaturés, qui présentent une courbure. La courbure augmente la fluidité membranaire, car elle introduit un espace entre les acides gras des lipides membranaires.   [...]

comment agit l ATP??

De fait l'ATP ne casse aucune liaison moléculaire. C'est l'enzyme. Par ailleurs les enzymes ne nécessitent pas toutes un supplément d'énergie via liaison + hydrolyse d'un ATP. Par exemple beaucoup d'enzyme digestives s'en passent car l'entalpie des réactions catalysées est (très) favorable.  [...] L'ATP n'agit pas sur la catalyse, il permet seulement une excitation électronique de la structure. Hormis l'hydrolyse du groupement phosphate, tout se passe à l'opposé. la réaction chimique a lieu au niveau du site actif de l'enzyme.  [...]

[Biochimie] ATP Synthase et thermodynamique

Concernant l'ATP synthase, de ce que je sais elle utilise le gradient de protons entre espace intermembranaire et matrice mitochondriale pour synthétiser l'ATP. pour cela elle couple l'énergie potentielle relâchée par la circulation des H+ à une énergie mécanique, via la rotation de la partie mobile F1 de l'enzyme.  [...] Ma question est la suivante. on sait qu'une enzyme ne modifie en aucun cas le G d'une réaction, et pour moi la formation d'ATP à partir d'ADP et Pi est très endergonique. dans ce cas, comment l'enzyme peut la rendre spontanée La rotation ne sert-elle pas seulement à modifier la conformation du site actif pour permettre la fixation d'ADP+Pi, puis la catalyse et enfin le relâchement Dans ce cas pourquoi le G est modifié pendant le processus.  [...]

[Biochimie] enzymes: kinases, dehydrogenases

Imagine une enzyme qui catalyse le transfert d'un groupement phosphoryl d'une protéine à l'autre. elle a une activité kinase et une activité phosphatase.  [...] Ou alors peut être est-ce car dans certains autres métabolisme, cette même enzyme catalyse la réaction inverse, et l'on évite ainsi de donner 2 noms inutilement.  [...]

[Biochimie] unité de mesure enzymatique

bonjour,j ai acheter dernierement une enzyme de glucose phosphatase et l unité de mesure est 0,05units/mg.  [...] Cela veut dire que ton enzyme catalyse 0.05 ùmole (micromole) de substrat soit le glucose dans ton cas je présume, par minute et par mg (milligramme) d'enzyme...et l'unité s'appelle.Activité spécifique.  [...]